Table 1.

Exon/intron boundaries of TEL2

Exon no. Size (bp) 5′ splice donor Intron length (kb) 3′ splice acceptor TEL1/ETV6 exon size (bp)*
1  >31 ATGCAG gtaaga  1.7  taggag CGAGAA   57  
2  134  GACTCC gtaagt  9.5  ttgcag GCATCC  130  
3  166  GCTCAG gtcagg  2.3  ctccag GTGACG  164  
4  125  CGGAAG gtgagg  1.9  ttgcag AGGTGA  134  
5  230  TCGCTG gtgagt  2.3  ttgcag ACTGCC  545  
6  142  CACAAG gtgagc  2.0  ttccag AACCGG  142  
7  100  GTTCAG gtgagt  0.1  ttctag ATTTCT  100  
8  117  —  —  —   
Exon no. Size (bp) 5′ splice donor Intron length (kb) 3′ splice acceptor TEL1/ETV6 exon size (bp)*
1  >31 ATGCAG gtaaga  1.7  taggag CGAGAA   57  
2  134  GACTCC gtaagt  9.5  ttgcag GCATCC  130  
3  166  GCTCAG gtcagg  2.3  ctccag GTGACG  164  
4  125  CGGAAG gtgagg  1.9  ttgcag AGGTGA  134  
5  230  TCGCTG gtgagt  2.3  ttgcag ACTGCC  545  
6  142  CACAAG gtgagc  2.0  ttccag AACCGG  142  
7  100  GTTCAG gtgagt  0.1  ttctag ATTTCT  100  
8  117  —  —  —   

Exon/intron borders and intron sizes were determined from the sequence of PAC clone 50J22 (accession #Z84484).

*

Exon sizes for TEL1/ETV6 are taken from Baens et al.25 

The transcriptional start site of TEL2 is not known; therefore the exact size of exon 1 is at least 31 bp, but may be larger.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal