Table 1.

Primers used for amplification of different constructs of AC133 promoters


Construct

Forward primer (with KpnI site)

Reverse primer (with HindIII site)
P1 (-1800/+10)   5′-TGAGGTACCTTCAGTGCCTCTTTCAGT-3′   5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′  
P1 (-1100/+10)   5′-TGAGGTACCTATCCTGAGAACTCACTCACTA-3′   5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′  
P1 (-750/+10)   5′-TGAGGTACCTTTGTAGCTTGTGCATCCAT-3′   5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′  
P1 (-490/+10)   5′-TGAGGTACCACAGAGCGGGAAGACCAA-3′   5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′  
P1 (-349/+10)   5′-CTAGGTACCTGCACACTAAGGATCCAAAT-3′   5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′  
P1 (-750/-250)   5′-TGAGGTACCTTTGTAGCTTGTGCATCCAT-3′   5′-AGTAAGCTTACCCTTCTGTTGCCTAATC-3′  
P1 (-490/-250)   5′-TGAGGTACCACAGAGCGGGAAGACCAA-3′   5′-AGTAAGCTTACCCTTCTGTTGCCTAATC-3′  
P2   5′-ACTGGTACCGGTCCAATCAGAGTGCGT-3′   5′-ATGAAGCTTCCCTTAGCTCGCCAGA-3′  
P3   5′-ACTGGTACCGGCGGCAGCGGTGACTA-3′   5′-ACTAAGCTTGCACACTCACCTCCGACT-3′  
P4   5′-ACTGGTACCGACAGACCCCAGATAGCCT-3′   5′-ACTAAGCTTAGCCTGGGTGACAGAGACT-3′  
P5
 
5′-ACTGGTACCGCATGTCTGTCTCTGTGTCC-3′
 
5′-ACTAAGCTTACTGACAACTGCCCACTGC-3′
 

Construct

Forward primer (with KpnI site)

Reverse primer (with HindIII site)
P1 (-1800/+10)   5′-TGAGGTACCTTCAGTGCCTCTTTCAGT-3′   5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′  
P1 (-1100/+10)   5′-TGAGGTACCTATCCTGAGAACTCACTCACTA-3′   5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′  
P1 (-750/+10)   5′-TGAGGTACCTTTGTAGCTTGTGCATCCAT-3′   5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′  
P1 (-490/+10)   5′-TGAGGTACCACAGAGCGGGAAGACCAA-3′   5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′  
P1 (-349/+10)   5′-CTAGGTACCTGCACACTAAGGATCCAAAT-3′   5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′  
P1 (-750/-250)   5′-TGAGGTACCTTTGTAGCTTGTGCATCCAT-3′   5′-AGTAAGCTTACCCTTCTGTTGCCTAATC-3′  
P1 (-490/-250)   5′-TGAGGTACCACAGAGCGGGAAGACCAA-3′   5′-AGTAAGCTTACCCTTCTGTTGCCTAATC-3′  
P2   5′-ACTGGTACCGGTCCAATCAGAGTGCGT-3′   5′-ATGAAGCTTCCCTTAGCTCGCCAGA-3′  
P3   5′-ACTGGTACCGGCGGCAGCGGTGACTA-3′   5′-ACTAAGCTTGCACACTCACCTCCGACT-3′  
P4   5′-ACTGGTACCGACAGACCCCAGATAGCCT-3′   5′-ACTAAGCTTAGCCTGGGTGACAGAGACT-3′  
P5
 
5′-ACTGGTACCGCATGTCTGTCTCTGTGTCC-3′
 
5′-ACTAAGCTTACTGACAACTGCCCACTGC-3′
 

KpnI and HindIII sites (underlined) are incorporated into 5′ end of primers.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal