Primers used for amplification of different constructs of AC133 promoters
Construct . | Forward primer (with KpnI site) . | Reverse primer (with HindIII site) . |
---|---|---|
P1 (-1800/+10) | 5′-TGAGGTACCTTCAGTGCCTCTTTCAGT-3′ | 5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′ |
P1 (-1100/+10) | 5′-TGAGGTACCTATCCTGAGAACTCACTCACTA-3′ | 5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′ |
P1 (-750/+10) | 5′-TGAGGTACCTTTGTAGCTTGTGCATCCAT-3′ | 5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′ |
P1 (-490/+10) | 5′-TGAGGTACCACAGAGCGGGAAGACCAA-3′ | 5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′ |
P1 (-349/+10) | 5′-CTAGGTACCTGCACACTAAGGATCCAAAT-3′ | 5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′ |
P1 (-750/-250) | 5′-TGAGGTACCTTTGTAGCTTGTGCATCCAT-3′ | 5′-AGTAAGCTTACCCTTCTGTTGCCTAATC-3′ |
P1 (-490/-250) | 5′-TGAGGTACCACAGAGCGGGAAGACCAA-3′ | 5′-AGTAAGCTTACCCTTCTGTTGCCTAATC-3′ |
P2 | 5′-ACTGGTACCGGTCCAATCAGAGTGCGT-3′ | 5′-ATGAAGCTTCCCTTAGCTCGCCAGA-3′ |
P3 | 5′-ACTGGTACCGGCGGCAGCGGTGACTA-3′ | 5′-ACTAAGCTTGCACACTCACCTCCGACT-3′ |
P4 | 5′-ACTGGTACCGACAGACCCCAGATAGCCT-3′ | 5′-ACTAAGCTTAGCCTGGGTGACAGAGACT-3′ |
P5 | 5′-ACTGGTACCGCATGTCTGTCTCTGTGTCC-3′ | 5′-ACTAAGCTTACTGACAACTGCCCACTGC-3′ |
Construct . | Forward primer (with KpnI site) . | Reverse primer (with HindIII site) . |
---|---|---|
P1 (-1800/+10) | 5′-TGAGGTACCTTCAGTGCCTCTTTCAGT-3′ | 5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′ |
P1 (-1100/+10) | 5′-TGAGGTACCTATCCTGAGAACTCACTCACTA-3′ | 5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′ |
P1 (-750/+10) | 5′-TGAGGTACCTTTGTAGCTTGTGCATCCAT-3′ | 5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′ |
P1 (-490/+10) | 5′-TGAGGTACCACAGAGCGGGAAGACCAA-3′ | 5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′ |
P1 (-349/+10) | 5′-CTAGGTACCTGCACACTAAGGATCCAAAT-3′ | 5′-CTTGAAGCTTGTGGGGATCTGCCTCAGTCA-3′ |
P1 (-750/-250) | 5′-TGAGGTACCTTTGTAGCTTGTGCATCCAT-3′ | 5′-AGTAAGCTTACCCTTCTGTTGCCTAATC-3′ |
P1 (-490/-250) | 5′-TGAGGTACCACAGAGCGGGAAGACCAA-3′ | 5′-AGTAAGCTTACCCTTCTGTTGCCTAATC-3′ |
P2 | 5′-ACTGGTACCGGTCCAATCAGAGTGCGT-3′ | 5′-ATGAAGCTTCCCTTAGCTCGCCAGA-3′ |
P3 | 5′-ACTGGTACCGGCGGCAGCGGTGACTA-3′ | 5′-ACTAAGCTTGCACACTCACCTCCGACT-3′ |
P4 | 5′-ACTGGTACCGACAGACCCCAGATAGCCT-3′ | 5′-ACTAAGCTTAGCCTGGGTGACAGAGACT-3′ |
P5 | 5′-ACTGGTACCGCATGTCTGTCTCTGTGTCC-3′ | 5′-ACTAAGCTTACTGACAACTGCCCACTGC-3′ |
KpnI and HindIII sites (underlined) are incorporated into 5′ end of primers.