Table 1.

IgH and IgL gene rearrangement data from the 31 analyzed VH3-21 positive cases


Case no.

VH homology, %

D gene

JH gene

VH reading frame

Vκ family

Vλ

VL gene homology, %

Jλ/κ

VL gene reading frame*
1   99.1   —   6   F   2   2-14   98.4   3   F  
2   98.2   —   6   F   2 & 4   2-14   97.2   3   F  
3   96.9   —   6   F   1   2-14 & 2-11   98.4 & 98.7   3 & 3   F & NF  
4   96.4   —   6   F   1   2-14   97.6   3   F  
5   97.8   —   6   F   Vκ2 A18   —   100   4   NF  
6   95.9   —   6   F   3   2-14   98   3   F  
7   95.9   —   6   F   2   2-14   98.8   3   F  
8   97.3   —   6   F   —   2-14   96.9   3   F  
9   96.4   —   6   F   1 & 4   2-14   98   3   F  
10   96.4   —   6   F   1 & 3   2-14   89.4   3   F  
11   97.3   —   6   F   —   2-14   98.4   3   F  
12   96.4   —   6   F   —   2-14   99.6   3   F  
13   99.1   —   6   F   3 & 4   2-14   98   3   F  
14   99.6   —   6   F   2 & 4   2-14   98.4   3   F  
15   95.9   —   6   F   4   2-14   98   3   F  
16   96.4   —   6   F   1   2-14   98.4   3   F  
17   99.1   —   6   F   4   2-14   98.4   3   F  
18   100   —   6   F   1   2-14   99.2   3   F  
19   95.1   —   6   F   —   2-14   98.4   3   F  
20   95.9   —   6   F   3   3-4   96.3   3   NF  
21   96.9   —   6   F   1   2-14   99.2   3   F  
22   97.3   3-22   4   F   1   2-14 & 1-3   97.6 & 91.9   3 & 3   F & NF  
23   95.1   5-5/5-18   3   F   —   2-14   97.6   3   F  
24   97.3   6-13   4   F   1   2-14   98.4   3   F  
25   94.2   2-2   3   F   3   2-14   98.8   1   F  
26   96.4   —   4   F   1   2-14 & 1-17   98.8 & 97.6   3 & 1   Both F  
27   100   6-19   4   F   1   2-11   100   1   F  
28   100   6-13   6   F   Vκ3 A27 & Vκ1 L12   —   100 & 100   1 & 1   F & NF  
29   100   3-10   6   F   Vκ3 L2   —   100   2   F  
30   100   3-3   6   F   Vκ1 L12   —   100   1   F  
31
 
92.8
 
1-7
 
6
 
NF
 
2 & 5/6
 
1-4
 
98.6
 
1
 
F
 

Case no.

VH homology, %

D gene

JH gene

VH reading frame

Vκ family

Vλ

VL gene homology, %

Jλ/κ

VL gene reading frame*
1   99.1   —   6   F   2   2-14   98.4   3   F  
2   98.2   —   6   F   2 & 4   2-14   97.2   3   F  
3   96.9   —   6   F   1   2-14 & 2-11   98.4 & 98.7   3 & 3   F & NF  
4   96.4   —   6   F   1   2-14   97.6   3   F  
5   97.8   —   6   F   Vκ2 A18   —   100   4   NF  
6   95.9   —   6   F   3   2-14   98   3   F  
7   95.9   —   6   F   2   2-14   98.8   3   F  
8   97.3   —   6   F   —   2-14   96.9   3   F  
9   96.4   —   6   F   1 & 4   2-14   98   3   F  
10   96.4   —   6   F   1 & 3   2-14   89.4   3   F  
11   97.3   —   6   F   —   2-14   98.4   3   F  
12   96.4   —   6   F   —   2-14   99.6   3   F  
13   99.1   —   6   F   3 & 4   2-14   98   3   F  
14   99.6   —   6   F   2 & 4   2-14   98.4   3   F  
15   95.9   —   6   F   4   2-14   98   3   F  
16   96.4   —   6   F   1   2-14   98.4   3   F  
17   99.1   —   6   F   4   2-14   98.4   3   F  
18   100   —   6   F   1   2-14   99.2   3   F  
19   95.1   —   6   F   —   2-14   98.4   3   F  
20   95.9   —   6   F   3   3-4   96.3   3   NF  
21   96.9   —   6   F   1   2-14   99.2   3   F  
22   97.3   3-22   4   F   1   2-14 & 1-3   97.6 & 91.9   3 & 3   F & NF  
23   95.1   5-5/5-18   3   F   —   2-14   97.6   3   F  
24   97.3   6-13   4   F   1   2-14   98.4   3   F  
25   94.2   2-2   3   F   3   2-14   98.8   1   F  
26   96.4   —   4   F   1   2-14 & 1-17   98.8 & 97.6   3 & 1   Both F  
27   100   6-19   4   F   1   2-11   100   1   F  
28   100   6-13   6   F   Vκ3 A27 & Vκ1 L12   —   100 & 100   1 & 1   F & NF  
29   100   3-10   6   F   Vκ3 L2   —   100   2   F  
30   100   3-3   6   F   Vκ1 L12   —   100   1   F  
31
 
92.8
 
1-7
 
6
 
NF
 
2 & 5/6
 
1-4
 
98.6
 
1
 
F
 

— represents no D gene identified or no Vκ/λ family amplified.

*

F indicates functional; NF, nonfunctional.

The Vκ PCR products were sequenced only in cases 5 and 28 to 30.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal