Table 2.

The 30 most differentially expressed genes in a comparison of MM1 and MM4 subgroups

Accession*FunctionGene symbol†MM1 (N = 20) PMM4 (N = 18)Pχ2WRS‡Pvalue
D00596 DNA replication TYMS 3 18 24.35 1.26  ×  10−4 
U35835 DNA repair PRKDC 2 17 23.75 4.55  ×  10−6 
U77949 DNA replication CDC6 1 13 15.62 5.14  ×  10−6 
U91985 DNA fragmentation DFFA 1 12 13.38 6.26  ×  10−5 
U61145 Transcription EZH2 4 15 12.77 1.67  ×  10−4 
U20979 DNA replication CHAF1A 2 12 10.75 1.10  ×  10−4 
U03911 DNA repair MSH2 0 9 10.48 2.88  ×  10−6 
X74330 DNA replication PRIM1 0 9 10.48 9.36  ×  10−6 
X12517 SnRNP SNRPC 0 9 10.48 5.26  ×  10−6 
D85131 Transcription MAZ 0 9 10.48 1.08  ×  10−5 
L00634 Farnesyltransferase FNTA 10 18 9.77 7.28  ×  10−5 
U21090 DNA replication POLD2 11 18 8.27 8.05  ×  10−5 
X54941 Cell cycle CKS1 10 17 7.07 1.26  ×  10−4 
U62136 Cell cycle UBE2V2 13 18 5.57 4.96  ×  10−6 
D38076 Cell cycle RANBP1 13 18 5.57 7.34  ×  10−6 
X95592 Unknown C1D† 13 18 5.57 1.10  ×  10−4 
X66899 Cell cycle EWSR1 14 18 4.35 1.89  ×  10−4 
L34600 Translation initiation MTIF2 14 18 4.35 3.09  ×  10−5 
U27460 Metabolism IUGP2 15 18 3.22 1.65  ×  10−4 
U15009 SnRNP SNRPD3 15 18 3.22 1.47  ×  10−5 
J02645 Translation initiation EIF2S1 16 18 2.18 7.29  ×  10−5 
X95648 Translation initiation EIF2B1 16 18 2.18 1.45  ×  10−4 
M34539 Calcium signaling FKBP1A 18 18 0.42 1.71  ×  10−5 
J04611 DNA repair G22P1 18 18 0.42 7.29  ×  10−5 
U67122 Antiapoptosis UBL1 20 18 0.00 7.29  ×  10−5 
U38846 Chaperon CCT4 20 18 0.00 1.26  ×  10−4 
U80040 Metabolism ACO2 20 18 0.00 8.38  ×  10−5 
U86782 Proteasome POH† 20 18 0.00 5.90  ×  10−5 
X57152 Signaling CSNK2B 20 18 0.00 7.29  ×  10−5 
D87446 Unknown KIAA0257† 20 18 0.00 1.26  ×  10−5 
Accession*FunctionGene symbol†MM1 (N = 20) PMM4 (N = 18)Pχ2WRS‡Pvalue
D00596 DNA replication TYMS 3 18 24.35 1.26  ×  10−4 
U35835 DNA repair PRKDC 2 17 23.75 4.55  ×  10−6 
U77949 DNA replication CDC6 1 13 15.62 5.14  ×  10−6 
U91985 DNA fragmentation DFFA 1 12 13.38 6.26  ×  10−5 
U61145 Transcription EZH2 4 15 12.77 1.67  ×  10−4 
U20979 DNA replication CHAF1A 2 12 10.75 1.10  ×  10−4 
U03911 DNA repair MSH2 0 9 10.48 2.88  ×  10−6 
X74330 DNA replication PRIM1 0 9 10.48 9.36  ×  10−6 
X12517 SnRNP SNRPC 0 9 10.48 5.26  ×  10−6 
D85131 Transcription MAZ 0 9 10.48 1.08  ×  10−5 
L00634 Farnesyltransferase FNTA 10 18 9.77 7.28  ×  10−5 
U21090 DNA replication POLD2 11 18 8.27 8.05  ×  10−5 
X54941 Cell cycle CKS1 10 17 7.07 1.26  ×  10−4 
U62136 Cell cycle UBE2V2 13 18 5.57 4.96  ×  10−6 
D38076 Cell cycle RANBP1 13 18 5.57 7.34  ×  10−6 
X95592 Unknown C1D† 13 18 5.57 1.10  ×  10−4 
X66899 Cell cycle EWSR1 14 18 4.35 1.89  ×  10−4 
L34600 Translation initiation MTIF2 14 18 4.35 3.09  ×  10−5 
U27460 Metabolism IUGP2 15 18 3.22 1.65  ×  10−4 
U15009 SnRNP SNRPD3 15 18 3.22 1.47  ×  10−5 
J02645 Translation initiation EIF2S1 16 18 2.18 7.29  ×  10−5 
X95648 Translation initiation EIF2B1 16 18 2.18 1.45  ×  10−4 
M34539 Calcium signaling FKBP1A 18 18 0.42 1.71  ×  10−5 
J04611 DNA repair G22P1 18 18 0.42 7.29  ×  10−5 
U67122 Antiapoptosis UBL1 20 18 0.00 7.29  ×  10−5 
U38846 Chaperon CCT4 20 18 0.00 1.26  ×  10−4 
U80040 Metabolism ACO2 20 18 0.00 8.38  ×  10−5 
U86782 Proteasome POH† 20 18 0.00 5.90  ×  10−5 
X57152 Signaling CSNK2B 20 18 0.00 7.29  ×  10−5 
D87446 Unknown KIAA0257† 20 18 0.00 1.26  ×  10−5 
*

Accession numbers listed are GenBank numbers, except those beginning with “HT,” which are provided by the Institute of Genomic Research (TIGR).

†

Gene symbol not Human Genome Organisation (HUGO) approved.

‡

Wilcoxon rank sum test.

View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal