Summary of results
NHL subtype . | Case . | API2-MLT . | BCL 10 . | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Expression* . | Alteration . | Exon . | Codon . | Mutation . | TS† . | MD-T† . | MD-N† . | |||
MALT | 1 | + | n/c | − | − | − | − | − | − | − |
2 | + | n/c | CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | − | |
3 | − | c | GGA > GAA | 3 | 213 | GlyGlu | + | − | − | |
4 | + | n/c | − | − | − | − | − | − | − | |
5 | + | n/c | − | − | − | − | − | − | − | |
6 | + | n/c | − | − | − | − | − | − | ||
7 | + | n/c | GAG > GTG | 1 | 11 | GluVal | + | − | − | |
8 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
9 | + | n/c | − | − | − | − | − | − | − | |
10 | − | c | GGA > GAA | 3 | 213 | GlyGlu | + | − | − | |
11 | + | n/c | − | − | − | − | − | − | − | |
12 | − | c | GCA > TCA | 1 | 5 | AlaSer | + | − | − | |
13 | − | c | CCT > CCG | 3 | 175 | Silent | − | +‡ | − | |
ACA > AGA | 2 | 100 | ThrArg | − | +‡ | − | ||||
14 | − | c | TTC > GTC | 2 | 94 | PheVal | + | − | − | |
15 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
16 | − | n/c | − | − | − | − | − | − | − | |
17 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
18 | + | n/c | − | − | − | − | − | − | − | |
19 | + | n/c | CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | − | |
20 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
21 | − | c | TCA > TCT | 3 | 227 | Silent | + | − | − | |
CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | + | ||||
22 | − | c | CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | − | |
MALT + LCP | 23 | − | c | CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | − |
24 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
25 | − | n/c | CTA > CCA | 3 | 207 | LeuPro | − | +‡,1-153 | − | |
AAC > ACC | 2 | 93 | AsnThr | − | +‡ | − | ||||
26 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
27 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
28 | − | c | GGA > GAA | 3 | 213 | GlyGlu | + | + | + | |
CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | + | ||||
29 | − | c | GGA > GAA | 3 | 213 | GlyGlu | + | + | − | |
30 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
31 | − | n/c | TTG > ATG | 2 | 68 | LeuMet | + | − | − | |
32 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
33 | − | c | CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | − | |
34 | − | n/c | − | − | − | − | − | − | − | |
35 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
DLCL | 36 | − | c | − | − | − | − | − | − | − |
37 | − | c | CCT > CCG | 3 | 195 | Silent | + | − | − | |
38 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
39 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
40 | − | c | GGA > GAA | 3 | 213 | GlyGlu | + | − | − | |
41 | − | c | CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | − | |
41 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
43 | − | c | CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | − | |
44 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
45 | − | c | − | − | − | − | − | − | − |
NHL subtype . | Case . | API2-MLT . | BCL 10 . | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Expression* . | Alteration . | Exon . | Codon . | Mutation . | TS† . | MD-T† . | MD-N† . | |||
MALT | 1 | + | n/c | − | − | − | − | − | − | − |
2 | + | n/c | CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | − | |
3 | − | c | GGA > GAA | 3 | 213 | GlyGlu | + | − | − | |
4 | + | n/c | − | − | − | − | − | − | − | |
5 | + | n/c | − | − | − | − | − | − | − | |
6 | + | n/c | − | − | − | − | − | − | ||
7 | + | n/c | GAG > GTG | 1 | 11 | GluVal | + | − | − | |
8 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
9 | + | n/c | − | − | − | − | − | − | − | |
10 | − | c | GGA > GAA | 3 | 213 | GlyGlu | + | − | − | |
11 | + | n/c | − | − | − | − | − | − | − | |
12 | − | c | GCA > TCA | 1 | 5 | AlaSer | + | − | − | |
13 | − | c | CCT > CCG | 3 | 175 | Silent | − | +‡ | − | |
ACA > AGA | 2 | 100 | ThrArg | − | +‡ | − | ||||
14 | − | c | TTC > GTC | 2 | 94 | PheVal | + | − | − | |
15 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
16 | − | n/c | − | − | − | − | − | − | − | |
17 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
18 | + | n/c | − | − | − | − | − | − | − | |
19 | + | n/c | CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | − | |
20 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
21 | − | c | TCA > TCT | 3 | 227 | Silent | + | − | − | |
CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | + | ||||
22 | − | c | CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | − | |
MALT + LCP | 23 | − | c | CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | − |
24 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
25 | − | n/c | CTA > CCA | 3 | 207 | LeuPro | − | +‡,1-153 | − | |
AAC > ACC | 2 | 93 | AsnThr | − | +‡ | − | ||||
26 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
27 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
28 | − | c | GGA > GAA | 3 | 213 | GlyGlu | + | + | + | |
CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | + | ||||
29 | − | c | GGA > GAA | 3 | 213 | GlyGlu | + | + | − | |
30 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
31 | − | n/c | TTG > ATG | 2 | 68 | LeuMet | + | − | − | |
32 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
33 | − | c | CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | − | |
34 | − | n/c | − | − | − | − | − | − | − | |
35 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
DLCL | 36 | − | c | − | − | − | − | − | − | − |
37 | − | c | CCT > CCG | 3 | 195 | Silent | + | − | − | |
38 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
39 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
40 | − | c | GGA > GAA | 3 | 213 | GlyGlu | + | − | − | |
41 | − | c | CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | − | |
41 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
43 | − | c | CTC > CTG | 1 | 8 | Silent | + | − | − | |
44 | − | c | − | − | − | − | − | − | − | |
45 | − | c | − | − | − | − | − | − | − |
BCL10 expression analyzed by immunohistochemistry. n, nuclear; c, cytoplasmic.
Results derived from analysis on DNA either from whole tissue sections (TS) or from microdissected tumor cells (MD-T) or normal cells (MD-N).
Both mutations from the same case were found in two different tumor cell clusters.
Result on DNA from microdissected large tumor cells.
LCP, large cell proliferation.