Table 3.

Vβ usage in T-cell lines and T-ALL samples as determined by molecular analysis and mAb reactivity

Sample
TCRβ chain
Age, sexSB analysisRT-PCR + HD
Sequence analysis of RT-PCR productsVβ MAb reactivity
Allele 1 (frame)
Allele 2 (frame)
T-cell lines        
 CEM CyTCRβ NA R/R Vβ9-Cβ Vβ9-Jβ2.3 (+) — Vβ9.1 
 DND-41 TCRβδ+ NA R/R Vβ13-Cβ/Vβ18-Cβ Vβ18-Jβ1.2 (+) Vβ13-Jβ2.7 (−) no reactivity 
 HPB-ALL TCRαβ+ NA R/R Vβ5-Cβ/Vβ6-Cβ Vβ5-Jβ2.5 (+) Vβ6-Jβ2.5 (−) Vβ5.2/5.3 
 HSB-2 CyTCRβ NA R/R Vβ5-Cβ Vβ5-Jβ1.1 (+) — Vβ5.1 
 HUT78/H9 TCRαβ+ NA R/R Vβ23-Cβ Vβ23-Jβ1.2 (+) — Vβ23 
 KT-1 TCRαβ+ NA R/R Vβ15-Cβ/Vβ18-Cβ Vβ18-Jβ2.3 (+) Vβ15-Jβ1.2 (+) Vβ18 
 MOLT16/17 TCRαβ+ NA R/R Vβ2-Cβ Vβ2-Jβ2.3 (+) — Vβ2 
 MOLT3/4 CyTCRβ NA R/R Vβ2-Cβ/Vβ12-Cβ Vβ2-Jβ2.1 (+) Vβ12-Jβ2.5 (−) Vβ2 
 P12 CyTCRβ NA R/R Vβ13-Cβ Vβ13-Jβ2.1 (+) — Vβ13.1/13.3 
 PF-382 CyTCRβ NA R/R Vβ2-Cβ/Vβ6-Cβ Vβ2-Jβ2.1 (+) Vβ6-Jβ2.7 (−) Vβ2 
 RPMI8402 CyTCRβ NA R/R Vβ17-Cβ/Vβ24-Cβ Vβ24-Jβ1.5 (+) Vβ17-Jβ2.7 (−) no reactivity 
 SUP-T3 CyTCRβ NA R/R Vβ3-Cβ Vβ3-Jβ2.3 (+) — Vβ3  
T-ALL samples        
 T002 TCRαβ+T-ALL 5, F R/R Vβ3-Cβ Vβ3-Jβ1.5 (+) — Vβ3  
 T010 TCRαβ+T-ALL 3, M R/R Vβ7-Cβ Vβ7-Jβ1.4 (+) — no reactivity 
 T012 TCRαβ+ T-ALL 34, M R/R Vβ9-Cβ/Vβ11-Cβ/Vβ23Cβ/Vβ24-Cβ3-150 Vβ11-Jβ1.5 (+)/Vβ24-Jβ1.5 (+) Vβ9-Jβ2.1 (+)/Vβ23-Jβ1.2 (+) no reactivity  
 T015 TCRαβ+ T-ALL np, np R/R Vβ4-Cβ/Vβ6-Cβ Vβ4-Jβ2.1 (+) Vβ6-Jβ1.1 (−) no reactivity 
 T017 TCRαβ+ T-ALL 3, F R/R Vβ13-Cβ/Vβ20-Cβ Vβ20-Jβ1.5 (+) Vβ13-Jβ1.2 (−) Vβ20 
 T020 TCRαβ+ T-ALL 14, np R/R Vβ7-Cβ/Vβ21-Cβ Vβ21-Jβ2.3 (+) Vβ7-Jβ2.2 (−) Vβ21.3 
 T029 TCRαβ+ T-ALL 10, F R/R Vβ22-Cβ Vβ22-Jβ1.1 (+) — Vβ22  
 T044 TCRαβ+T-ALL np, np R/R Vβ6-Cβ/Vβ21-Cβ/Vβ24-Cβ3-150 Vβ6-Jβ1.2 (+)/Vβ21-Jβ2.1 (+) Vβ24-Jβ1.1 (+) no reactivity 
 T047 TCRαβ+ T-ALL np, np R/R Vβ2-Cβ Vβ2-Jβ1.2 (+) — Vβ2 
 T069 TCRαβ+ T-ALL 29, M R/R Vβ3-Cβ Vβ3-Jβ1.6 (+) — Vβ3 
 T077 TCRαβ+ T-ALL 10, M R/R Vβ3-Cβ/Vβ8-Cβ Vβ8-Jβ2.1 (+) Vβ3-Jβ2.1 (+) Vβ8  
 T139 TCRαβ+ T-ALL 14, M R/R Vβ3-Cβ/Vβ11-Cβ Vβ3-Jβ2.1 (+) Vβ11-Jβ1.1 (+) no reactivity 
 T140 TCRαβ+ T-ALL 28, M R/R Vβ3-Cβ/Vβ6-Cβ Vβ3-Jβ2.5 (+) Vβ6-Jβ1.2 (+) Vβ3  
 T145 TCRαβ+ T-ALL 51, M R/R Vβ5-Cβ/Vβ7-Cβ Vβ5-Jβ1.5 (+) Vβ7-Jβ2.3 (+) no reactivity  
 T181 TCRαβ+ T-ALL np, np R/R Vβ7-Cβ Vβ7-Jβ2.1 (+) — no reactivity  
 T182 TCRαβ+ T-ALL np, np R/R Vβ6-Cβ/Vβ13-Cβ Vβ6-Jβ1.1 (+)3-151 Vβ13-Jβ2.5 (−) no reactivity 
Sample
TCRβ chain
Age, sexSB analysisRT-PCR + HD
Sequence analysis of RT-PCR productsVβ MAb reactivity
Allele 1 (frame)
Allele 2 (frame)
T-cell lines        
 CEM CyTCRβ NA R/R Vβ9-Cβ Vβ9-Jβ2.3 (+) — Vβ9.1 
 DND-41 TCRβδ+ NA R/R Vβ13-Cβ/Vβ18-Cβ Vβ18-Jβ1.2 (+) Vβ13-Jβ2.7 (−) no reactivity 
 HPB-ALL TCRαβ+ NA R/R Vβ5-Cβ/Vβ6-Cβ Vβ5-Jβ2.5 (+) Vβ6-Jβ2.5 (−) Vβ5.2/5.3 
 HSB-2 CyTCRβ NA R/R Vβ5-Cβ Vβ5-Jβ1.1 (+) — Vβ5.1 
 HUT78/H9 TCRαβ+ NA R/R Vβ23-Cβ Vβ23-Jβ1.2 (+) — Vβ23 
 KT-1 TCRαβ+ NA R/R Vβ15-Cβ/Vβ18-Cβ Vβ18-Jβ2.3 (+) Vβ15-Jβ1.2 (+) Vβ18 
 MOLT16/17 TCRαβ+ NA R/R Vβ2-Cβ Vβ2-Jβ2.3 (+) — Vβ2 
 MOLT3/4 CyTCRβ NA R/R Vβ2-Cβ/Vβ12-Cβ Vβ2-Jβ2.1 (+) Vβ12-Jβ2.5 (−) Vβ2 
 P12 CyTCRβ NA R/R Vβ13-Cβ Vβ13-Jβ2.1 (+) — Vβ13.1/13.3 
 PF-382 CyTCRβ NA R/R Vβ2-Cβ/Vβ6-Cβ Vβ2-Jβ2.1 (+) Vβ6-Jβ2.7 (−) Vβ2 
 RPMI8402 CyTCRβ NA R/R Vβ17-Cβ/Vβ24-Cβ Vβ24-Jβ1.5 (+) Vβ17-Jβ2.7 (−) no reactivity 
 SUP-T3 CyTCRβ NA R/R Vβ3-Cβ Vβ3-Jβ2.3 (+) — Vβ3  
T-ALL samples        
 T002 TCRαβ+T-ALL 5, F R/R Vβ3-Cβ Vβ3-Jβ1.5 (+) — Vβ3  
 T010 TCRαβ+T-ALL 3, M R/R Vβ7-Cβ Vβ7-Jβ1.4 (+) — no reactivity 
 T012 TCRαβ+ T-ALL 34, M R/R Vβ9-Cβ/Vβ11-Cβ/Vβ23Cβ/Vβ24-Cβ3-150 Vβ11-Jβ1.5 (+)/Vβ24-Jβ1.5 (+) Vβ9-Jβ2.1 (+)/Vβ23-Jβ1.2 (+) no reactivity  
 T015 TCRαβ+ T-ALL np, np R/R Vβ4-Cβ/Vβ6-Cβ Vβ4-Jβ2.1 (+) Vβ6-Jβ1.1 (−) no reactivity 
 T017 TCRαβ+ T-ALL 3, F R/R Vβ13-Cβ/Vβ20-Cβ Vβ20-Jβ1.5 (+) Vβ13-Jβ1.2 (−) Vβ20 
 T020 TCRαβ+ T-ALL 14, np R/R Vβ7-Cβ/Vβ21-Cβ Vβ21-Jβ2.3 (+) Vβ7-Jβ2.2 (−) Vβ21.3 
 T029 TCRαβ+ T-ALL 10, F R/R Vβ22-Cβ Vβ22-Jβ1.1 (+) — Vβ22  
 T044 TCRαβ+T-ALL np, np R/R Vβ6-Cβ/Vβ21-Cβ/Vβ24-Cβ3-150 Vβ6-Jβ1.2 (+)/Vβ21-Jβ2.1 (+) Vβ24-Jβ1.1 (+) no reactivity 
 T047 TCRαβ+ T-ALL np, np R/R Vβ2-Cβ Vβ2-Jβ1.2 (+) — Vβ2 
 T069 TCRαβ+ T-ALL 29, M R/R Vβ3-Cβ Vβ3-Jβ1.6 (+) — Vβ3 
 T077 TCRαβ+ T-ALL 10, M R/R Vβ3-Cβ/Vβ8-Cβ Vβ8-Jβ2.1 (+) Vβ3-Jβ2.1 (+) Vβ8  
 T139 TCRαβ+ T-ALL 14, M R/R Vβ3-Cβ/Vβ11-Cβ Vβ3-Jβ2.1 (+) Vβ11-Jβ1.1 (+) no reactivity 
 T140 TCRαβ+ T-ALL 28, M R/R Vβ3-Cβ/Vβ6-Cβ Vβ3-Jβ2.5 (+) Vβ6-Jβ1.2 (+) Vβ3  
 T145 TCRαβ+ T-ALL 51, M R/R Vβ5-Cβ/Vβ7-Cβ Vβ5-Jβ1.5 (+) Vβ7-Jβ2.3 (+) no reactivity  
 T181 TCRαβ+ T-ALL np, np R/R Vβ7-Cβ Vβ7-Jβ2.1 (+) — no reactivity  
 T182 TCRαβ+ T-ALL np, np R/R Vβ6-Cβ/Vβ13-Cβ Vβ6-Jβ1.1 (+)3-151 Vβ13-Jβ2.5 (−) no reactivity 
F3-150

Multiple Vβ-Cβ products probably resulting from subclone formation with one major clone and one minor clone (< 10%) not detectable by SB analysis.

F3-151

Transcript involves Cβ2 segment coupled to the Jβ1.1 segment of the VDJ exon, which fits with deletion as seen in SB analysis. np indicates not provided.