Table 2.

In vitro V(D)J recombination assay with RAG1mutants causing Omenn syndrome

RAG1pHRecCJ (coding joints)pHRecSJ (signal joints)
Blue colTotalR(× 10−3)*Blue colTotalR(× 10−3)
Wild type 39 11 800   9.9 560 53 360 10.5 
L732F 66 500 < 0.01 930 000 < 0.001 
R973H 66 000 < 0.01 17 220 0.06 
ΔT631 24 44 320   1.6 42 36 000 1.16 
R404W 64 000 < 0.01 876 000 < 0.001 
S875FS3 117 000 < 0.008 36 960 0.03 
R474H 78 300   0.30 24 400 < 0.04 
G720C 27 000 < 0.03 22 000 < 0.04 
R624H 117 000 < 0.008  7000 < 0.14 
K992E 31 500 < 0.03 15 000 < 0.06 
K86FS 19 840 < 0.05 15 400 < 0.06 
Y333X 67 800   0.04 27 600 < 0.03 
RAG1pHRecCJ (coding joints)pHRecSJ (signal joints)
Blue colTotalR(× 10−3)*Blue colTotalR(× 10−3)
Wild type 39 11 800   9.9 560 53 360 10.5 
L732F 66 500 < 0.01 930 000 < 0.001 
R973H 66 000 < 0.01 17 220 0.06 
ΔT631 24 44 320   1.6 42 36 000 1.16 
R404W 64 000 < 0.01 876 000 < 0.001 
S875FS3 117 000 < 0.008 36 960 0.03 
R474H 78 300   0.30 24 400 < 0.04 
G720C 27 000 < 0.03 22 000 < 0.04 
R624H 117 000 < 0.008  7000 < 0.14 
K992E 31 500 < 0.03 15 000 < 0.06 
K86FS 19 840 < 0.05 15 400 < 0.06 
Y333X 67 800   0.04 27 600 < 0.03 

FS indicates frameshift mutation; X, nonsense mutation.

*

R (coding joints) = 3 × (Blue col)/(Total) × 1000.

R (signal joints) = (Blue col)/(Total) × 1000.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal