Table 5.

Properties of sequenced VDJ rearrangements from 78 adult B-lineage acute lymphoblastic leukemia clones

Patient (clone)VH familyClosest matching
VHsegment5-150		Distance of VH from JH1 (kb)Closest matching
JHsegment		AgeSexImmunophenotypeKaryotypeWBC (log)Time to first CR5-151Clinical outcome5-152
57 VH6 6 -1 74.31 JH1 24 M null ALL t(4;11) 2.75 standard CCR 
355 VH6 6 -1 74.31 JH2 40 F null ALL t(4;11) 2.38 standard relapse 
406 VH6 6 -1 74.31 JH4 20 F null ALL t(4;11) 2.58 standard CCR  
5 VH6 6 -1 74.31 JH5 17 M CALL other  standard relapse 
110 VH6 6 -1 74.31 JH4 25 M CALL normal 0.23 standard CCR 
181 VH6 6 -1 74.31 Unclear5-153 29 M CALL normal 0.77 standard CCR 
243(a) VH6 6 -1 74.31 JH4 27 M CALL other 0.32 standard relapse 
373 VH6 6 -1 74.31 JH4 48 F CALL t(1;19)    
378(a) VH6 6 -1 74.31 JH5 20 M CALL 9p abn   relapse  
80(a) VH6 6 -1 74.31 Unclear5-153 31 F pre-B ALL  1.03 standard CCR  
192(a) VH6 6 -1 74.31 JH4 20 F pre-B ALL t(4;11) 2.53 standard CCR 
192(b) VH6 6 -1 74.31 JH5 20 F pre-B ALL t(4;11) 2.53 standard CCR 
223 VH6 6 -1 74.31 JH4 23 F pre-B ALL 11q23 [non t(4;11)] 1.23 late relapse  
392 VH6 6 -1 74.31 JH4 39 F pre-B ALL other  standard CCR  
263(a) VH1 1 -2 121.36 JH4 24 F cALL  1.03 standard CCR 
321 VH1 1 -2 121.36 JH5 18 M cALL HeH 1.34 standard relapse 
338 VH1 1 -2 121.36 JH4 27 F cALL 9p abn 0.93 standard CCR  
378(b) VH1 1 -2 121.36 JH5 20 M cALL 9p abn   relapse  
121 VH1 1 -3 139.94 JH4 19 M cALL other 1.40 standard relapse 
1235-155 VH1 1 -35-155 139.94 JH6 16 F pre-B ALL  0.36  relapse  
1265-155 VH1 1 -35-155 139.94 JH6 17 F pre-B ALL 9p abn 1.42 standard relapse  
362(a) VH4 4 -4 146.80 JH5 29 F cALL other 0.70 standard relapse 
26 VH4 4 -4 146.80 JH4 25 M pre-B ALL t(12;21) 0.95 standard relapse 
410 VH4 4 -4 146.80 JH4 35 F B ALL  2.11  CCR  
7(a) VH2 2 -5 162.83 JH6 31 M pre-B ALL t(9;22) 1.96 late  
222(a) VH2 2 -5 162.83 JH4 40 F pre-B ALL t(9;22) 2.05 standard CCR 
243(b) VH1 1 -8 207.77 JH5 27 M cALL other 0.32 standard relapse 
263(b) VH1 1 -8 207.77 JH6 24 F cALL  1.03 standard CCR 
374 VH3 3 -9 220.00 JH4 19 M cALL    relapse 
72 VH3 3 -11 221.00 JH4 20 M cALL    relapse 
204 VH3 3 -11 221.00 JH6 19 M cALL HeH 0.52 standard CCR 
2835-155 VH3 3 -135-155 254.84 Unclear5-153 55 M null ALL normal 0.70 standard CCR  
76 VH3 3 -13 254.84 JH6 21 M cALL normal 1.58 standard CCR 
255(a) VH3 3 -13 254.84 JH4 16 M cALL    relapse 
7(b) VH3 3 -13 254.84 JH6 31 M pre-B ALL t(9;22) 1.96 late  
401 VH3 3 -13 254.84 JH5 49 F pre-B ALL t(9;22)  standard relapse 
112 VH3 3 -23 393.91 JH5 22 M pre-B ALL t(1;19) 1.59 late relapse 
177 VH3 3 -23 393.91 JH5 44 F pre-B ALL 14q32 abn 0.85   
40 VH3 3 -30 459.71 JH6 19 M cALL  1.59 standard  
198 VH3 3 -30 459.71 JH3 43 M pre-B ALL t(9;22) 0.61 standard relapse 
323 VH4 4-30-4(poly) See text JH4 20 M cALL other 1.74 standard CCR 
243(c) VH3 3-30/3-30-5(poly) See text JH1 27 M cALL other 0.32 standard relapse 
389 VH4 4 -31 473.90 JH5 22 F null ALL t(4;11) 2.30 standard relapse 
77(a) VH4 4 -31 473.90 JH6 24 F pre-B ALL 6q del 1.19 standard CCR  
255(b) VH4 4 -39 546.31 JH5 16 M cALL    relapse 
272 VH3 3 -43 594.90 JH4 28 F cALL 6q del 1.65 standard CCR  
255(c) VH3 3 -48 662.52 JH5 16 M cALL    relapse 
408 VH3 3 -53 717.67 JH6 18 M cALL other 1.99 late relapse 
299(a) VH3 3 -53 717.67 Unclear5-153 18 F pre-B ALL   standard CCR 
18 VH4 4-55(Ps) 730.82 JH4 16 F pre-B ALL  1.36 standard CCR  
56 VH4 4 -61 763.82 JH5 16 M cALL 14q32 abn 0.79 standard CCR  
376(a) VH3 3 -64 782.45 JH4 50 F cALL t(9;22) 1.39 standard relapse 
327 VH3 3-65(Ps) 790.80 JH4 36 M cALL  0.36 standard CCR 
289 VH1 1 -69 838.62 JH5 20 M cALL  1.08 late CCR 
376(b) VH1 1 -69 838.62 JH4 50 F cALL t(9;22) 1.39 standard relapse 
7(c) VH1 1 -69 838.62 JH6 31 M pre-B ALL t(9;22) 1.96 late  
296 VH2 2 -70 847.52 Unclear5-153 40 F pre-B ALL 12p abn 1.05 late CCR  
11 VH2 2 -70 847.52 JH4 19 M B ALL  2.19 standard relapse  
134 VH3 3 -73 879.65 JH3 48 M B ALL 14q32 abn 2.74 late relapse  
475-154 VH4 4 -45-154 146.80 JH5 26 M cALL other 1.01 late CCR 
  4 -615-154 763.82         
1875-154 VH2 2 -55-154 162.83 JH4 24 F cALL    relapse 
  2 -265-154 426.35         
  2 -705-154 847.52         
1955-154 VH4 4 -345-154 498.28 JH6 35 M cALL t(9;22) 1.60 never  
  4 -395-154 546.31         
2625-154 VH4 4 -395-154 546.31 JH5 54 M null ALL t(4;11) 2.34 late CCR  
  4 -595-154 751.94         
362(b)5-154 VH3 3 -305-154 459.71 JH4 29 F cALL other 0.70 standard relapse 
  3-30-3 (poly)5-154 See text         
  3-30/3-30-5(poly)5-154 See text         
17 VH5 5-a(poly)# — JH6 16 F pre-B ALL    relapse 
71 VH Unclear5-160 — JH4 16 M cALL  0.63 standard CCR 
241 VH Unclear5-160 — Unclear5-154 16 F cALL 12p abn 1.91 standard relapse 
248 VH4 Unclear5-160 — JH4 21 F cALL HeH 0.40 standard CCR 
347(a) VH1 Unclear5-160 — JH5 27 M cALL t(12;21) 1.60 standard relapse 
347(b) VH3 Unclear5-160 — JH4 27 M cALL t(12;21) 1.60 standard relapse 
77(b) VH3 Unclear5-160 — JH6 24 F pre-B ALL 6q del 1.19 standard CCR 
80(b) VH1 Unclear5-160 — JH5 31 F pre-B ALL  1.03 standard CCR 
130 VH Unclear5-160 — JH5 30 F pre-B ALL t(9;22) 1.89 late CCR 
149 VH Unclear5-160 — Unclear5-154 19 M pre-B ALL 11q23 [non t(4;11)] 2.07 standard relapse 
222(b) VH3 Unclear5-160 — JH4 40 F pre-B ALL t(9;22) 2.05 standard CCR 
299(b) VH4 Unclear5-160 — JH6 18 F pre-B ALL   standard CCR 
375 VH4 Unclear5-160 — JH6 19 M pre-B ALL HeH 0.48 standard relapse 
244 False†† False†† — False†† 50 F null ALL t(4;11) 1.99 standard CCR 
Patient (clone)VH familyClosest matching
VHsegment5-150		Distance of VH from JH1 (kb)Closest matching
JHsegment		AgeSexImmunophenotypeKaryotypeWBC (log)Time to first CR5-151Clinical outcome5-152
57 VH6 6 -1 74.31 JH1 24 M null ALL t(4;11) 2.75 standard CCR 
355 VH6 6 -1 74.31 JH2 40 F null ALL t(4;11) 2.38 standard relapse 
406 VH6 6 -1 74.31 JH4 20 F null ALL t(4;11) 2.58 standard CCR  
5 VH6 6 -1 74.31 JH5 17 M CALL other  standard relapse 
110 VH6 6 -1 74.31 JH4 25 M CALL normal 0.23 standard CCR 
181 VH6 6 -1 74.31 Unclear5-153 29 M CALL normal 0.77 standard CCR 
243(a) VH6 6 -1 74.31 JH4 27 M CALL other 0.32 standard relapse 
373 VH6 6 -1 74.31 JH4 48 F CALL t(1;19)    
378(a) VH6 6 -1 74.31 JH5 20 M CALL 9p abn   relapse  
80(a) VH6 6 -1 74.31 Unclear5-153 31 F pre-B ALL  1.03 standard CCR  
192(a) VH6 6 -1 74.31 JH4 20 F pre-B ALL t(4;11) 2.53 standard CCR 
192(b) VH6 6 -1 74.31 JH5 20 F pre-B ALL t(4;11) 2.53 standard CCR 
223 VH6 6 -1 74.31 JH4 23 F pre-B ALL 11q23 [non t(4;11)] 1.23 late relapse  
392 VH6 6 -1 74.31 JH4 39 F pre-B ALL other  standard CCR  
263(a) VH1 1 -2 121.36 JH4 24 F cALL  1.03 standard CCR 
321 VH1 1 -2 121.36 JH5 18 M cALL HeH 1.34 standard relapse 
338 VH1 1 -2 121.36 JH4 27 F cALL 9p abn 0.93 standard CCR  
378(b) VH1 1 -2 121.36 JH5 20 M cALL 9p abn   relapse  
121 VH1 1 -3 139.94 JH4 19 M cALL other 1.40 standard relapse 
1235-155 VH1 1 -35-155 139.94 JH6 16 F pre-B ALL  0.36  relapse  
1265-155 VH1 1 -35-155 139.94 JH6 17 F pre-B ALL 9p abn 1.42 standard relapse  
362(a) VH4 4 -4 146.80 JH5 29 F cALL other 0.70 standard relapse 
26 VH4 4 -4 146.80 JH4 25 M pre-B ALL t(12;21) 0.95 standard relapse 
410 VH4 4 -4 146.80 JH4 35 F B ALL  2.11  CCR  
7(a) VH2 2 -5 162.83 JH6 31 M pre-B ALL t(9;22) 1.96 late  
222(a) VH2 2 -5 162.83 JH4 40 F pre-B ALL t(9;22) 2.05 standard CCR 
243(b) VH1 1 -8 207.77 JH5 27 M cALL other 0.32 standard relapse 
263(b) VH1 1 -8 207.77 JH6 24 F cALL  1.03 standard CCR 
374 VH3 3 -9 220.00 JH4 19 M cALL    relapse 
72 VH3 3 -11 221.00 JH4 20 M cALL    relapse 
204 VH3 3 -11 221.00 JH6 19 M cALL HeH 0.52 standard CCR 
2835-155 VH3 3 -135-155 254.84 Unclear5-153 55 M null ALL normal 0.70 standard CCR  
76 VH3 3 -13 254.84 JH6 21 M cALL normal 1.58 standard CCR 
255(a) VH3 3 -13 254.84 JH4 16 M cALL    relapse 
7(b) VH3 3 -13 254.84 JH6 31 M pre-B ALL t(9;22) 1.96 late  
401 VH3 3 -13 254.84 JH5 49 F pre-B ALL t(9;22)  standard relapse 
112 VH3 3 -23 393.91 JH5 22 M pre-B ALL t(1;19) 1.59 late relapse 
177 VH3 3 -23 393.91 JH5 44 F pre-B ALL 14q32 abn 0.85   
40 VH3 3 -30 459.71 JH6 19 M cALL  1.59 standard  
198 VH3 3 -30 459.71 JH3 43 M pre-B ALL t(9;22) 0.61 standard relapse 
323 VH4 4-30-4(poly) See text JH4 20 M cALL other 1.74 standard CCR 
243(c) VH3 3-30/3-30-5(poly) See text JH1 27 M cALL other 0.32 standard relapse 
389 VH4 4 -31 473.90 JH5 22 F null ALL t(4;11) 2.30 standard relapse 
77(a) VH4 4 -31 473.90 JH6 24 F pre-B ALL 6q del 1.19 standard CCR  
255(b) VH4 4 -39 546.31 JH5 16 M cALL    relapse 
272 VH3 3 -43 594.90 JH4 28 F cALL 6q del 1.65 standard CCR  
255(c) VH3 3 -48 662.52 JH5 16 M cALL    relapse 
408 VH3 3 -53 717.67 JH6 18 M cALL other 1.99 late relapse 
299(a) VH3 3 -53 717.67 Unclear5-153 18 F pre-B ALL   standard CCR 
18 VH4 4-55(Ps) 730.82 JH4 16 F pre-B ALL  1.36 standard CCR  
56 VH4 4 -61 763.82 JH5 16 M cALL 14q32 abn 0.79 standard CCR  
376(a) VH3 3 -64 782.45 JH4 50 F cALL t(9;22) 1.39 standard relapse 
327 VH3 3-65(Ps) 790.80 JH4 36 M cALL  0.36 standard CCR 
289 VH1 1 -69 838.62 JH5 20 M cALL  1.08 late CCR 
376(b) VH1 1 -69 838.62 JH4 50 F cALL t(9;22) 1.39 standard relapse 
7(c) VH1 1 -69 838.62 JH6 31 M pre-B ALL t(9;22) 1.96 late  
296 VH2 2 -70 847.52 Unclear5-153 40 F pre-B ALL 12p abn 1.05 late CCR  
11 VH2 2 -70 847.52 JH4 19 M B ALL  2.19 standard relapse  
134 VH3 3 -73 879.65 JH3 48 M B ALL 14q32 abn 2.74 late relapse  
475-154 VH4 4 -45-154 146.80 JH5 26 M cALL other 1.01 late CCR 
  4 -615-154 763.82         
1875-154 VH2 2 -55-154 162.83 JH4 24 F cALL    relapse 
  2 -265-154 426.35         
  2 -705-154 847.52         
1955-154 VH4 4 -345-154 498.28 JH6 35 M cALL t(9;22) 1.60 never  
  4 -395-154 546.31         
2625-154 VH4 4 -395-154 546.31 JH5 54 M null ALL t(4;11) 2.34 late CCR  
  4 -595-154 751.94         
362(b)5-154 VH3 3 -305-154 459.71 JH4 29 F cALL other 0.70 standard relapse 
  3-30-3 (poly)5-154 See text         
  3-30/3-30-5(poly)5-154 See text         
17 VH5 5-a(poly)# — JH6 16 F pre-B ALL    relapse 
71 VH Unclear5-160 — JH4 16 M cALL  0.63 standard CCR 
241 VH Unclear5-160 — Unclear5-154 16 F cALL 12p abn 1.91 standard relapse 
248 VH4 Unclear5-160 — JH4 21 F cALL HeH 0.40 standard CCR 
347(a) VH1 Unclear5-160 — JH5 27 M cALL t(12;21) 1.60 standard relapse 
347(b) VH3 Unclear5-160 — JH4 27 M cALL t(12;21) 1.60 standard relapse 
77(b) VH3 Unclear5-160 — JH6 24 F pre-B ALL 6q del 1.19 standard CCR 
80(b) VH1 Unclear5-160 — JH5 31 F pre-B ALL  1.03 standard CCR 
130 VH Unclear5-160 — JH5 30 F pre-B ALL t(9;22) 1.89 late CCR 
149 VH Unclear5-160 — Unclear5-154 19 M pre-B ALL 11q23 [non t(4;11)] 2.07 standard relapse 
222(b) VH3 Unclear5-160 — JH4 40 F pre-B ALL t(9;22) 2.05 standard CCR 
299(b) VH4 Unclear5-160 — JH6 18 F pre-B ALL   standard CCR 
375 VH4 Unclear5-160 — JH6 19 M pre-B ALL HeH 0.48 standard relapse 
244 False†† False†† — False†† 50 F null ALL t(4;11) 1.99 standard CCR 

ALL indicates acute lymphoblastic leukemia; cALL, common ALL.

F5-150

All named matches have less than 97% homology with no more than 3 mismatching base pairs, except those marked with ∥.

F5-151

Standard time to CR is up to 42 days.

F5-152

Patients followed for at least 24 months or up to first relapse.

F5-153

Clones were found to match more than 1 JH segment equally well; therefore, a JH segment was not assigned.

F5-155

These matches were relatively poor (90% to 95% homology) with between 8 and 10 mismatching base pairs.

F5-154

Clones were found to match 2 to 3 VH segments equally well; all possibilities are listed.

#This polymorphic VH segment has not been accurately mapped at present.

F5-160

Clones were found to match more than 3 VH segments equally well; therefore, a VH segment was not assigned.

[ViewLarge]
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal