Table 1.

Mutational analysis of consensus salivary gland lymphomaVH genes

Case no. GermlineVH gene % homologyCDR1 and 2 FW1, 2, and 3
RS R/S Random R/S R S R/S Random R/S
V1-69 97  4  0  4  3.6  3  1  3  
2  V1-69 91  6  5  1.2  3.6  5  11 0.45  3  
3  V1-69 98  1  0  1  3.6  3  0.67  3  
4  V1-69 92  6  4  1.5  3.6 7  7  1  3  
5  V1-69 93  2  5  0.4 3.6  7  8  0.87  3  
6  V1-69 98  3  3  3.6  1  2  0.5  3  
7  V1-69 98  3  0.3  3.6  2  1  2  3  
8  V1-69 97 1  2  0.5  3.6  4  2  2  3  
9  V1-46 94  6  3  2  4.2  1  7  0.14  2.8  
10 V3-7 98  2  0  2  4.9  1  2  0.5  2.8 
11  V3-30.3 100  
12  V3-11 94  3  1  4.3  6  8  0.75  2.8  
13  V3-30 91  4  1.2  3.9  10  7  1.4  2.8  
14  V4-39 94  4  1  4  4.5  7  4  1.7  2.6 
Case no. GermlineVH gene % homologyCDR1 and 2 FW1, 2, and 3
RS R/S Random R/S R S R/S Random R/S
V1-69 97  4  0  4  3.6  3  1  3  
2  V1-69 91  6  5  1.2  3.6  5  11 0.45  3  
3  V1-69 98  1  0  1  3.6  3  0.67  3  
4  V1-69 92  6  4  1.5  3.6 7  7  1  3  
5  V1-69 93  2  5  0.4 3.6  7  8  0.87  3  
6  V1-69 98  3  3  3.6  1  2  0.5  3  
7  V1-69 98  3  0.3  3.6  2  1  2  3  
8  V1-69 97 1  2  0.5  3.6  4  2  2  3  
9  V1-46 94  6  3  2  4.2  1  7  0.14  2.8  
10 V3-7 98  2  0  2  4.9  1  2  0.5  2.8 
11  V3-30.3 100  
12  V3-11 94  3  1  4.3  6  8  0.75  2.8  
13  V3-30 91  4  1.2  3.9  10  7  1.4  2.8  
14  V4-39 94  4  1  4  4.5  7  4  1.7  2.6 

Columns headed with “R” or “S” give the number of deduced replacement or silent mutations from the proposed germlineVH nucleotide sequences, respectively. “Random R/S” refers to the ratio of all possible replacement to silent mutations for the given areas as described by Chang and Casali.31 

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal