Sequence variations in common ABO alleles (base changes shown with reference to the A1 allele)
Exon . | 3 . | 4 . | 5 . | 6 . | 7 . | |||||||||||||||
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PCR Fragment* . | . | . | . | . | F1 . | F2 . | . | . | . | . | . | . | F3 . | |||||||
Nucleotide . | 106 . | 188 . | 189 . | 220 . | 261 . | 297 . | 467 . | 526 . | 646 . | 657 . | 681 . | 703 . | 771 . | 796 . | 802 . | 803 . | 829 . | 930 . | 10591061 . | 1096 . |
A1 | G | G | C | C | G | A | C | C | T | C | G | G | C | C | G | G | G | G | C | G |
A1v | T | |||||||||||||||||||
A2 | T | — | ||||||||||||||||||
B | G | G | T | A | A | C | A | A | ||||||||||||
O1 | — | |||||||||||||||||||
O1v | T | A | T | T | — | G | A | A | T | A | ||||||||||
O2 | G | G | A | A |
Exon . | 3 . | 4 . | 5 . | 6 . | 7 . | |||||||||||||||
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PCR Fragment* . | . | . | . | . | F1 . | F2 . | . | . | . | . | . | . | F3 . | |||||||
Nucleotide . | 106 . | 188 . | 189 . | 220 . | 261 . | 297 . | 467 . | 526 . | 646 . | 657 . | 681 . | 703 . | 771 . | 796 . | 802 . | 803 . | 829 . | 930 . | 10591061 . | 1096 . |
A1 | G | G | C | C | G | A | C | C | T | C | G | G | C | C | G | G | G | G | C | G |
A1v | T | |||||||||||||||||||
A2 | T | — | ||||||||||||||||||
B | G | G | T | A | A | C | A | A | ||||||||||||
O1 | — | |||||||||||||||||||
O1v | T | A | T | T | — | G | A | A | T | A | ||||||||||
O2 | G | G | A | A |
F1, F2, and F3 are the 3 PCR fragments used to assay the known single nucleotide polymorphisms. Note that deletions are denoted by dashes.