Table 2.

Deduced protein sequences of isolated FVIII light-chain–specific scFv

Heavy chains
 
FR1 CDR1 FR2 CDR2 FR3 CDR3 FR4  
------------------------------ ----- -------------- ----------------- -------------------------------- ----------------------- -----------  
111
 
12 3 4 56 789001
 
123456789012345678901234567890 12345 67890123456789 012a3456789012345 67890123456789012abc345678901234 567890abcdefghijklmno12 34567890123  
DP-10 QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFS SYAIS WVRQAPGOGLEWMG GIIPIFGTANYAQKFQG RVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR
 
EL-14 ----------A---------------D--N -FP-- -------------- -------STK------- ---M---G---------N--------I----- QQNGGWYEGPLLE..PRPDALDI WGQGTMVTVSS
 
DP-14 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFT SYGIS WVRQAPGQGLEWMG WISAYNGNTNYAQKLQG RVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCAR
 
EL-5  ---- L--AT--------M----M----P-- --D-- ------------V- ---------H----F-- ---------RR--------------------- DGGGGAYEDVWSGEYPEYYAMDV WGQGTTVTVSS
 
EL-16 ---- L--AT--------M----M----P-- --D-- -------------- ---I-S---D----F-- ---------RR--------------------- ----------------------- -----------
 
EL-25 ---- L--A---R---------------P-- --D-- -------------- ---I-S---D----F-- ---------RR--------------------- ----------------------- -----------
 
DP-88 QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFS SYAIS WVRQAPGQGLEWMG GIIPIFGTANYAQKFQG RVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR
 
EL-9 -----------------------T----L- ----- ---------P--I- ------D-SKS--R--D ------NI----T-------------M-F-V- GASGIRYIDWP...PIPVDAFDI WGQGTMVTVSS
 
 
Light chains
 
FR1 CDR1 FR2 CDR2 FR3 CDR3 FR4
 
----------------------- ----------- --------------- ------- -------------------------------- --------- -----------
 
1
 
12 3 4 5 678 9 0
 
12345678901234567890123 45678901234 567890123456789 0123456 78901234567890123456789012345678 901234567 89012345678
 
DPK5 DIQMTQSPSSVSASVGDRVTITC RASQGISSWLA WYQQKPGKAPKLLIY AASSLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQANSFP
 
EL-14 --V-------------------- ----------- --------------- ------- -------------------------------- -------LT FGGGTKVEIKR
 
L12a DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITC RASQSISSWLA WYQQKPGKAPKLLIY KASSLES GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYC QQYNSYS
 
EL-5 E-VL----------I-------- ---EG-YH--- --------------- -----A- -A-----------D------------------ -HL---PLT FGGGTKVEIKR
 
DPK7 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISSWLA WYQQKP EKAPKSLIY AASSLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQYNSYP
 
EL-25 ---------F------------- ----H-N---- ------G----L--- ---R--- -------------E------------------ --L----LT FGGGTKLEIKR
 
DPK8 DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC RASQGISSYLA WYQQKPGKAPKLLIY AASTLQS GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYC QQLNSYP
 
EL-9 ETT------S------------- ---R-L-R--- --------T------ ------- ------------------V----A---G---- --YHTISRT FGPGTKLEIKR
 
EL-16 --VM---------F----I---- -------G--- --------------- ------- --------------------G-----V----- -KY--A-WT FGQGTKVEIKR 
Heavy chains
 
FR1 CDR1 FR2 CDR2 FR3 CDR3 FR4  
------------------------------ ----- -------------- ----------------- -------------------------------- ----------------------- -----------  
111
 
12 3 4 56 789001
 
123456789012345678901234567890 12345 67890123456789 012a3456789012345 67890123456789012abc345678901234 567890abcdefghijklmno12 34567890123  
DP-10 QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFS SYAIS WVRQAPGOGLEWMG GIIPIFGTANYAQKFQG RVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR
 
EL-14 ----------A---------------D--N -FP-- -------------- -------STK------- ---M---G---------N--------I----- QQNGGWYEGPLLE..PRPDALDI WGQGTMVTVSS
 
DP-14 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFT SYGIS WVRQAPGQGLEWMG WISAYNGNTNYAQKLQG RVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCAR
 
EL-5  ---- L--AT--------M----M----P-- --D-- ------------V- ---------H----F-- ---------RR--------------------- DGGGGAYEDVWSGEYPEYYAMDV WGQGTTVTVSS
 
EL-16 ---- L--AT--------M----M----P-- --D-- -------------- ---I-S---D----F-- ---------RR--------------------- ----------------------- -----------
 
EL-25 ---- L--A---R---------------P-- --D-- -------------- ---I-S---D----F-- ---------RR--------------------- ----------------------- -----------
 
DP-88 QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFS SYAIS WVRQAPGQGLEWMG GIIPIFGTANYAQKFQG RVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR
 
EL-9 -----------------------T----L- ----- ---------P--I- ------D-SKS--R--D ------NI----T-------------M-F-V- GASGIRYIDWP...PIPVDAFDI WGQGTMVTVSS
 
 
Light chains
 
FR1 CDR1 FR2 CDR2 FR3 CDR3 FR4
 
----------------------- ----------- --------------- ------- -------------------------------- --------- -----------
 
1
 
12 3 4 5 678 9 0
 
12345678901234567890123 45678901234 567890123456789 0123456 78901234567890123456789012345678 901234567 89012345678
 
DPK5 DIQMTQSPSSVSASVGDRVTITC RASQGISSWLA WYQQKPGKAPKLLIY AASSLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQANSFP
 
EL-14 --V-------------------- ----------- --------------- ------- -------------------------------- -------LT FGGGTKVEIKR
 
L12a DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITC RASQSISSWLA WYQQKPGKAPKLLIY KASSLES GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYC QQYNSYS
 
EL-5 E-VL----------I-------- ---EG-YH--- --------------- -----A- -A-----------D------------------ -HL---PLT FGGGTKVEIKR
 
DPK7 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISSWLA WYQQKP EKAPKSLIY AASSLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQYNSYP
 
EL-25 ---------F------------- ----H-N---- ------G----L--- ---R--- -------------E------------------ --L----LT FGGGTKLEIKR
 
DPK8 DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC RASQGISSYLA WYQQKPGKAPKLLIY AASTLQS GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYC QQLNSYP
 
EL-9 ETT------S------------- ---R-L-R--- --------T------ ------- ------------------V----A---G---- --YHTISRT FGPGTKLEIKR
 
EL-16 --VM---------F----I---- -------G--- --------------- ------- --------------------G-----V----- -KY--A-WT FGQGTKVEIKR 

FR, framework region; CDR, complementarity-determining region. Dashes indicate sequence identity to germline. Residues encoded by JH gene segments are underlined. Sequence numbering is according to Kabat.24 Sequences are available from GenBank under accession numbers AF146400 (VH EL-5); AF146401 (VH EL-9); AF146402 (VH EL-14); AF146403 (VH EL-16); AF146404 (VH EL-25); AF146405 (VL EL-5);AF146406 (VL EL-9); AF146407 (VL EL-14); AF146408 (VL EL-16); AF146409(VL EL-25).

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