Table 2.

Transcripts Increased in Human Monocyte-Derived DCs

Fold Tag Sequence n*GenBank Match (accession no.)
Mono GM DC
125  TCACCGGTCA  0  72  125  Gelsolin (X04412
122  GGCACAAAGG  0  1  122  TARC (D43767)  
61 AGAAGTGTCC  2  79  121  Lysosomal acid lipase (Z31690)  
47  AGCCACCGCA  2  2  94  No match 
41  CGTGAGCCAC  0  10  41  No match  
40 GCCTGCAGTC  0  4  40  Hepatocyte growth factor activator inhibitor type 2 (AB006534)  
36  GCCCTGAAAG 0  3  36  No match  
35  TTGGAACAAT  0  35  No match  
34  CCTCTGGGCA  0  0  34  No match  
33  AACGGGGCCC  0  117  33  MDC (U83171
33  CCAAGACTTC  0  3  33  No match  
32 CAGCTATTTC  0  15  32  Fatty acid binding protein homologue (M94856)  
31  TTACTTCCCC  0  31  EST (AA927388)  
31  CTTTCAGATG  0  0  31 Platelet-type phosphofructokinase (D25328)  
30 TTGAGACCTC  1  0  30  Factor XIII subunit α (M14539)  
28  CTGTTAGTGT  2  20  55  Malate dehydrogenase (U20352)  
25  TGTCCCAGCC  0  64  25 Acid phosphatase type 5 (X14618
25  TCTTGATTTA  0  31 25  α-2 macroglobulin (M11313)  
23  CCCCCGTAAT  3  23  EST (AI203963)  
22  ATGGAAGTCT  0  22  Inositol polyphosphate 5-phosphatase (X98429
21  CTAAAAAAAA  0  9  21  No match  
21 CAAGCATCCC  21  166  430  No match  
20 TGTGAACAAC  0  1  20  EST (AI001049)  
20 ACTCACCTTA  0  0  20  EST (AA742376)  
20 GATACAGCCA  0  0  20  CD23 (M14766)  
20 ACCCAGGGTA  0  19  19  EST (N30858)  
19 CTGATCTCCA  0  5  19  No match  
19  TTTGCTCTCC 2  3  37  Vinculin (M33308)  
18  GATGACCCCC  34  18  No match  
18  GCCTACCCGA  0  15  18 GA733-1 (X13425)  
18  CCCTCGGTCC  0  3  18  No match  
18  AACGAGGAAT  0  2  18  No match  
18 CTATATTTTT  0  1  18  Cathepsin C (X87212)  
18 AAGGGATGCT  0  0  18  MCP-4 (U46767)  
17 AAGATTGGTG  0  32  17  CD9 (M38690)  
17 CCCAAGCTAG  1  9  17  HSP27 (X54079)  
17 CCGGGCGTGG  0  5  17  EST (R49492)  
17 GGTGTGCTTG  0  1  17  EST (AF055021)  
17 AGTGCAGGGC  0  0  17  No match  
17  CCTCACTACC 0  0  17  EST (AI288509)  
17  TGCAGAAGAA  0  17  Multiple match  
16  TGGCGTACGG  3  7  48 No match  
16  GCCAGCCCAG  1  4  16  Zinc finger protein (X97548)  
16  GGTCCCCTAC  0  4  16  EST (AI343615)  
16  TGTACCTGTA  9  61  140  No match 
16  TGGCCCCAGG  6  1,515  93  Apolipoprotein C-1 (X00570)  
15  TTTTCTGAAA  0  6  15  Thioredoxin (J04026)  
15  CTCTGTAAGT  0  0  15  Metalloproteinase (L23808)  
15  GGAGGCAGGA  0  0  15  No match  
15 ATGAGCTGAC  7  105  104  Cystatin B (L03558
Fold Tag Sequence n*GenBank Match (accession no.)
Mono GM DC
125  TCACCGGTCA  0  72  125  Gelsolin (X04412
122  GGCACAAAGG  0  1  122  TARC (D43767)  
61 AGAAGTGTCC  2  79  121  Lysosomal acid lipase (Z31690)  
47  AGCCACCGCA  2  2  94  No match 
41  CGTGAGCCAC  0  10  41  No match  
40 GCCTGCAGTC  0  4  40  Hepatocyte growth factor activator inhibitor type 2 (AB006534)  
36  GCCCTGAAAG 0  3  36  No match  
35  TTGGAACAAT  0  35  No match  
34  CCTCTGGGCA  0  0  34  No match  
33  AACGGGGCCC  0  117  33  MDC (U83171
33  CCAAGACTTC  0  3  33  No match  
32 CAGCTATTTC  0  15  32  Fatty acid binding protein homologue (M94856)  
31  TTACTTCCCC  0  31  EST (AA927388)  
31  CTTTCAGATG  0  0  31 Platelet-type phosphofructokinase (D25328)  
30 TTGAGACCTC  1  0  30  Factor XIII subunit α (M14539)  
28  CTGTTAGTGT  2  20  55  Malate dehydrogenase (U20352)  
25  TGTCCCAGCC  0  64  25 Acid phosphatase type 5 (X14618
25  TCTTGATTTA  0  31 25  α-2 macroglobulin (M11313)  
23  CCCCCGTAAT  3  23  EST (AI203963)  
22  ATGGAAGTCT  0  22  Inositol polyphosphate 5-phosphatase (X98429
21  CTAAAAAAAA  0  9  21  No match  
21 CAAGCATCCC  21  166  430  No match  
20 TGTGAACAAC  0  1  20  EST (AI001049)  
20 ACTCACCTTA  0  0  20  EST (AA742376)  
20 GATACAGCCA  0  0  20  CD23 (M14766)  
20 ACCCAGGGTA  0  19  19  EST (N30858)  
19 CTGATCTCCA  0  5  19  No match  
19  TTTGCTCTCC 2  3  37  Vinculin (M33308)  
18  GATGACCCCC  34  18  No match  
18  GCCTACCCGA  0  15  18 GA733-1 (X13425)  
18  CCCTCGGTCC  0  3  18  No match  
18  AACGAGGAAT  0  2  18  No match  
18 CTATATTTTT  0  1  18  Cathepsin C (X87212)  
18 AAGGGATGCT  0  0  18  MCP-4 (U46767)  
17 AAGATTGGTG  0  32  17  CD9 (M38690)  
17 CCCAAGCTAG  1  9  17  HSP27 (X54079)  
17 CCGGGCGTGG  0  5  17  EST (R49492)  
17 GGTGTGCTTG  0  1  17  EST (AF055021)  
17 AGTGCAGGGC  0  0  17  No match  
17  CCTCACTACC 0  0  17  EST (AI288509)  
17  TGCAGAAGAA  0  17  Multiple match  
16  TGGCGTACGG  3  7  48 No match  
16  GCCAGCCCAG  1  4  16  Zinc finger protein (X97548)  
16  GGTCCCCTAC  0  4  16  EST (AI343615)  
16  TGTACCTGTA  9  61  140  No match 
16  TGGCCCCAGG  6  1,515  93  Apolipoprotein C-1 (X00570)  
15  TTTTCTGAAA  0  6  15  Thioredoxin (J04026)  
15  CTCTGTAAGT  0  0  15  Metalloproteinase (L23808)  
15  GGAGGCAGGA  0  0  15  No match  
15 ATGAGCTGAC  7  105  104  Cystatin B (L03558

The 50 transcripts displaying the biggest increase in expression in DCs are listed by fold induction. The tag sequence represents the 10-bp SAGE tag. The most probable GenBank matches are listed. n indicates the number of times the tag was identified. Fold changes in expression were calculated as described in Fig 2. More information is available on the Internet athttp://www.prevent.m.u-tokyo.ac.jp/SAGE.html.

Abbreviations: Mono, monocytes; GM, GM-CSF–induced macrophages.

*

In this table, the tag numbers are 57,560, 57,463, and 58,540 from Mo, GM-Mφ, and DCs, respectively.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal