HS3ɛγ Lines: Copy Number Corrected ɛ and γ Expression Levels
| Line (F0) . | Copy Number . | Sample . | ε Expression Level* . | ε Silencing Ratio† . | γ Expression Level* . | γ Silencing Fetal/Adult‡ . |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 150 | 2 | d10 yolk sac | 28 ± 9 (2) | 23 | 41 ± 20 (2) | 11.5 |
| d12 yolk sac | 9.4 ± 1.8 (3) | 19 ± 2 (3) | ||||
| d12 fetal liver | 3.7 ± 1.6 (3) | 32 ± 7 (3) | ||||
| d14 fetal liver | 1.6 ± 0.3 (2) | 138 ± 36 (3) | ||||
| d16 fetal liver | 1.2 ± 0.8 (3) | 117 ± 41 (3) | ||||
| 4-week blood | 1.2 ± 0.5 (2) | 12 ± 2 (2) | ||||
| 155 | 7 | d10 yolk sac | 5.0 ± 3.0 (3) | 7.0 | 9.2 ± 1.3 (3) | 8.0 |
| d12 yolk sac | 5.6 ± 2.3 (3) | 11 ± 4 (4) | ||||
| d12 fetal liver | 0.54 ± 0.01 (2) | 5.8 ± 2.1 (3) | ||||
| d14 fetal liver | 0.25 ± 0.06 (3) | 12 ± 9 (3) | ||||
| d16 fetal liver | 0.30 ± 0.17 (3) | 7.6 ± 1.6 (3) | ||||
| 4-week blood | 0.8 ± 0.05 (2) | 1.5 ± 0.5 (3) | ||||
| 2564 | 10 | d10 yolk sac | 21 ± 3 (3) | 140 | 25 ± 4 (3) | 7.4 |
| d12 yolk sac | 9.5 ± 2.5 (3) | 55 ± 22 (3) | ||||
| d12 fetal liver | 1.1 ± 0.5 (3) | 55 ± 29 (3) | ||||
| d14 fetal liver | 0.72 ± 0.12 (3) | 126 ± 59 (4) | ||||
| d16 fetal liver | 0.34 ± 0.04 (2) | 69 ± 44 (2) | ||||
| 4-week blood | 0.15 ± 0.01 (3) | 17 ± 3 (3) | ||||
| 2649 | 25 | d10 yolk sac | 3.2 ± 1.2 (2) | 77 | 6.8 ± 2.5 (2) | 46 |
| d12 yolk sac | 5.8 ± 0.6 (3) | 29 ± 13 (3) | ||||
| d12 fetal liver | 0.34 ± 0.12 (3) | 12 ± 3 (3) | ||||
| d14 fetal liver | 0.33 ± 0.14 (3) | 17 ± 8 (3) | ||||
| d16 fetal liver | 0.15 ± 0.05 (3) | 7.8 ± 4.3 (3) | ||||
| 4-week blood | 0.075 ± 0.041 (3) | 0.37 ± 0.23 (3) |
| Line (F0) . | Copy Number . | Sample . | ε Expression Level* . | ε Silencing Ratio† . | γ Expression Level* . | γ Silencing Fetal/Adult‡ . |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 150 | 2 | d10 yolk sac | 28 ± 9 (2) | 23 | 41 ± 20 (2) | 11.5 |
| d12 yolk sac | 9.4 ± 1.8 (3) | 19 ± 2 (3) | ||||
| d12 fetal liver | 3.7 ± 1.6 (3) | 32 ± 7 (3) | ||||
| d14 fetal liver | 1.6 ± 0.3 (2) | 138 ± 36 (3) | ||||
| d16 fetal liver | 1.2 ± 0.8 (3) | 117 ± 41 (3) | ||||
| 4-week blood | 1.2 ± 0.5 (2) | 12 ± 2 (2) | ||||
| 155 | 7 | d10 yolk sac | 5.0 ± 3.0 (3) | 7.0 | 9.2 ± 1.3 (3) | 8.0 |
| d12 yolk sac | 5.6 ± 2.3 (3) | 11 ± 4 (4) | ||||
| d12 fetal liver | 0.54 ± 0.01 (2) | 5.8 ± 2.1 (3) | ||||
| d14 fetal liver | 0.25 ± 0.06 (3) | 12 ± 9 (3) | ||||
| d16 fetal liver | 0.30 ± 0.17 (3) | 7.6 ± 1.6 (3) | ||||
| 4-week blood | 0.8 ± 0.05 (2) | 1.5 ± 0.5 (3) | ||||
| 2564 | 10 | d10 yolk sac | 21 ± 3 (3) | 140 | 25 ± 4 (3) | 7.4 |
| d12 yolk sac | 9.5 ± 2.5 (3) | 55 ± 22 (3) | ||||
| d12 fetal liver | 1.1 ± 0.5 (3) | 55 ± 29 (3) | ||||
| d14 fetal liver | 0.72 ± 0.12 (3) | 126 ± 59 (4) | ||||
| d16 fetal liver | 0.34 ± 0.04 (2) | 69 ± 44 (2) | ||||
| 4-week blood | 0.15 ± 0.01 (3) | 17 ± 3 (3) | ||||
| 2649 | 25 | d10 yolk sac | 3.2 ± 1.2 (2) | 77 | 6.8 ± 2.5 (2) | 46 |
| d12 yolk sac | 5.8 ± 0.6 (3) | 29 ± 13 (3) | ||||
| d12 fetal liver | 0.34 ± 0.12 (3) | 12 ± 3 (3) | ||||
| d14 fetal liver | 0.33 ± 0.14 (3) | 17 ± 8 (3) | ||||
| d16 fetal liver | 0.15 ± 0.05 (3) | 7.8 ± 4.3 (3) | ||||
| 4-week blood | 0.075 ± 0.041 (3) | 0.37 ± 0.23 (3) |
(Human ε or γ)/(mouse α/4) + (mouse ζ/2)/copy. Mean ± standard deviation (number of independent samples assayed).
Calculated as: Highest expression level in embryonic samples/expression level in adult sample.
Calculated as: Highest expression level in fetal samples/expression level in adult sample.