Table 2.

MMSET Exon Structure

Exon Size bp First nt First Codon4p16 Cosmid First nt Last nt
1a 218    75b9b  8204  7986  
1  244   gap a-b  −3008  −2743  
2a  100   184d6  14925  14803  
2b  139   184d6  14339  14200  
2c  200   184d6  13376  13199  
2d  174   184d6  7888  7714  
2e  41?   184d6  7536  7496?  
3  626  1  1 184d6  6483  5858  
4  163  627  200  184d6 2893  2731  
5  167  790  254  190b4  19885 19719  
6  483  957  310  190b4  18615  18133 
7  145  1440  471  190b4  6129  5985  
8 119  1585  519  190b4  1610  1492  
9  82 1704  559  19h1  38351  38270  
10  125  1786 586  19h1  37148  37024  
11  6454  1911  628 19h1  34463  27985  
12  132  1911  628  19h1 25731  25601  
13  124  2043  672  19h1  24719 24596  
14  201  2167  713  19h1  23503  23303 
15  180  2368  780  19h1  21666  21487  
16 157  2548  840  19h1  21134  20978  
17  206 2705  893  19h1  20844  20639  
18  104  2911 961  19h1  18894  18791  
19  270  3015  996 19h1  17356  17087  
20  118  3285  1086  19h1 15792  15676  
21  142  3402  1125  19h1  1956 1815  
22  107  3544  1172  19h1  1525  1419 
23  205  3651  1208  19h1  344  140  
24 3563  3856  1276  96a2  33362  29800 
Exon Size bp First nt First Codon4p16 Cosmid First nt Last nt
1a 218    75b9b  8204  7986  
1  244   gap a-b  −3008  −2743  
2a  100   184d6  14925  14803  
2b  139   184d6  14339  14200  
2c  200   184d6  13376  13199  
2d  174   184d6  7888  7714  
2e  41?   184d6  7536  7496?  
3  626  1  1 184d6  6483  5858  
4  163  627  200  184d6 2893  2731  
5  167  790  254  190b4  19885 19719  
6  483  957  310  190b4  18615  18133 
7  145  1440  471  190b4  6129  5985  
8 119  1585  519  190b4  1610  1492  
9  82 1704  559  19h1  38351  38270  
10  125  1786 586  19h1  37148  37024  
11  6454  1911  628 19h1  34463  27985  
12  132  1911  628  19h1 25731  25601  
13  124  2043  672  19h1  24719 24596  
14  201  2167  713  19h1  23503  23303 
15  180  2368  780  19h1  21666  21487  
16 157  2548  840  19h1  21134  20978  
17  206 2705  893  19h1  20844  20639  
18  104  2911 961  19h1  18894  18791  
19  270  3015  996 19h1  17356  17087  
20  118  3285  1086  19h1 15792  15676  
21  142  3402  1125  19h1  1956 1815  
22  107  3544  1172  19h1  1525  1419 
23  205  3651  1208  19h1  344  140  
24 3563  3856  1276  96a2  33362  29800 

In the first column are listed the MMSET exons; a double line separates exon 11 and 12, indicating that they are contained in two alternative MMSET transcripts (type I and II, respectively). In the second column is reported the size of each exon. In the third column is indicated the first nucleotide of the exon, numbered starting from exon 3. The fourth column shows the first codon of the exon; the first Methionine in exon 3 corresponds to nucleotide 30. The fifth column lists in which 4p16 cosmid the exon is contained, with the first and last nucleotide indicated in columns six and seven. The position of exon 1 is arbitrarily given as distance in nt from the firstSst I site (at position 2501) of 75b9b.

View Large