Identified Genes Detected in Peripheral Granulocytes
| GS . | PM . | GR . | HL . | MO . | HE . | FL . | IL . | AL . | AP . | VF . | LG . | CM . | KC . | CO . | RE . | Gene Name . |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| A. Energy production | ||||||||||||||||
| 00943 | 1 | 1 | 3 | Phosphoglycerate kinase 1 | ||||||||||||
| 02200 | 1 | 1 | 1 | Transaldolase | ||||||||||||
| Total | 2 | 1 | 3 | 1 | 1 | |||||||||||
| B. Miscellaneous | ||||||||||||||||
| 00402 | 19 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 2 | Spermidine/spermine N1-acetyltransferase | |||||||
| 02161 | 4 | 1 | AMP deaminase isoform L (AMPD2) | |||||||||||||
| 00304 | 3 | 2 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 3 | 4 | 1 | 3 | 3 | Ubiquitin | |||
| 03216 | 3 | 1 | Long-chain acyl-CoA synthetase | |||||||||||||
| 01202 | 2 | 1 | Neutrophil oxidase factor (NCF2)/p67-phox | |||||||||||||
| 00483 | 2 | 1 | IMP dehydrogenase type 1 | |||||||||||||
| 03596 | 2 | Spermidine/spermine N1-acetyltransferase | ||||||||||||||
| 07377 | 2 | 1 | Inosine monophosphate dehydrogenase type II | |||||||||||||
| 08337 | 2 | Grancalcin | ||||||||||||||
| 08513 | 2 | Proteasome subunit p40 (Mov34) | ||||||||||||||
| 01263 | 1 | 2 | Vacuolar H+-ATPase Mr 56,000 subunit (HO57) | |||||||||||||
| 00253 | 1 | 2 | 1 | 2 | 1 | 2 | Importin beta subunit | |||||||||
| 01328 | 1 | 1 | Calpastatin=glycoprotein BS-17 component | |||||||||||||
| 02147 | 1 | 1 | 2 | Protein disulfide isomerase related protein (ERp72) | ||||||||||||
| 00154 | 1 | 1 | 1 | Glutaredoxin | ||||||||||||
| 00533 | 1 | 1 | 2 | 3 | 6 | 1 | Ferritin H chain | |||||||||
| 01766 | 1 | 6 | 15 | 2 | 4 | 1 | 2 | 5 | 10 | 1 | Metallothionein from cadmium-treated cells | |||||
| 07546 | 1 | Type 1 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor | ||||||||||||||
| 08483 | 1 | Ubiquitin conjugating enzyme (UBC4) | ||||||||||||||
| 08328 | 1 | Ribonuclease A | ||||||||||||||
| 08418 | 1 | Erythrocyte-type AMP deaminase | ||||||||||||||
| 08504 | 1 | Lysyl hydroxylase (PLOD) | ||||||||||||||
| 08643 | 1 | Histidase | ||||||||||||||
| 08690 | 1 | Ferritin H chain | ||||||||||||||
| Total | 55 | 8 | 3 | 9 | 7 | 20 | 3 | 5 | 6 | 9 | 4 | 10 | 14 | 12 | 2 | |
| C. Lysosomal | ||||||||||||||||
| 01809 | 5 | 3 | 6 | 1 | Lysosomal membrane glycoprotein CD63 | |||||||||||
| 01106 | 2 | 4 | 3 | Lysozyme | ||||||||||||
| 01533 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 1 | 1 | 1 | Lysosomal membrane glycoprotein-1 | |||||||
| 08663 | 1 | Arylsulphatase A | ||||||||||||||
| 08679 | 1 | 26S protease (S4) regulatory subunit | ||||||||||||||
| 08396 | 1 | Giantin/golgi antigen gcp372 | ||||||||||||||
| 08464 | 1 | Iduronate sulphate sulphatase (IDS) | ||||||||||||||
| 08664 | 1 | Iduronate sulphate sulphatase (IDS) | ||||||||||||||
| Total | 13 | 5 | 8 | 2 | 3 | 7 | 2 | 1 | ||||||||
| D. Signal transduction | ||||||||||||||||
| 02821 | 15 | 1 | 2 | 2 | 1 | CL 100 protein tyrosine phosphatase | ||||||||||
| 01724 | 6 | 2 | Pleckstrin (P47) | |||||||||||||
| 00816 | 5 | 5 | 1 | 1 | 1 | Lymphocyte-specific protein 1 (LSP1) | ||||||||||
| 01919 | 3 | 5 | 1 | 5 | 6 | 3 | 2 | 5 | 19 | Calcyclin | ||||||
| 00651 | 2 | 1 | 4 | 1 | Rho GDP-dissociation Inhibitor 2 | |||||||||||
| 01089 | 2 | 1 | Tyrosine kinase (HCK) | |||||||||||||
| 07614 | 2 | Cyclin G2 | ||||||||||||||
| 01524 | 1 | 1 | 1 | TSE1=protein kinase A regulatory subunit | ||||||||||||
| 00124 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | Ras-related protein (Krev-1) | ||||||||||
| 00286 | 1 | 2 | ERK activator kinase (MEK1) | |||||||||||||
| 00637 | 1 | 1 | 56K autoantigen annexin XI | |||||||||||||
| 01687 | 1 | 1 | c-raf-1 proto-oncogene | |||||||||||||
| 02144 | 1 | 1 | 1 | Protein kinase C ζ | ||||||||||||
| 03705 | 1 | α-subunit of Gi2 | ||||||||||||||
| 04134 | 1 | 1 | Rapamycin- and FK506-binding protein | |||||||||||||
| 06319 | 1 | 1 | Protein kinase | |||||||||||||
| 08680 | 1 | 5-lipoxygenase | ||||||||||||||
| Total | 45 | 8 | 7 | 9 | 4 | 2 | 1 | 1 | 5 | 8 | 6 | 5 | 6 | 22 | ||
| E. Ribosomal component and translation factor | ||||||||||||||||
| 01325 | 3 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | sui1iso1 | |||||||||
| 00314 | 2 | 1 | 3 | 3 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | 5 | 3 | 2 | Ribosomal protein S11 | |||
| 00919 | 2 | 1 | 1 | 1 | Splicing factor (CC1.4) | |||||||||||
| 00305 | 2 | 6 | 2 | 1 | 2 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 4 | 1 | Ribosomal protein L28 | ||
| 00995 | 1 | 3 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | Eukaryotic initiation factor 4AII | |||||
| 00650 | 1 | 2 | 14 | 5 | 2 | 1 | 2 | 1 | 6 | 1 | 2 | 2 | Ribosomal protein S18 | |||
| 00418 | 1 | 1 | 22 | 10 | 5 | 1 | 5 | 1 | 10 | 1 | 7 | 9 | Ribosomal protein L9 | |||
| 00795 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 2 | 5 | 3 | 6 | 3 | Ribosomal protein L30 | |||||
| 00818 | 1 | 1 | 4 | 1 | 2 | 1 | 2 | 2 | Ribosomal protein L5 | |||||||
| 00889 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | EF-1 δ | ||||||||
| 00356 | 1 | 16 | 2 | 1 | 2 | 1 | 2 | 1 | 1 | L23 putative ribosomal protein | ||||||
| 03424 | 1 | 1 | Translational initiation factor 2 β subunit | |||||||||||||
| Total | 17 | 11 | 68 | 26 | 8 | 7 | 17 | 10 | 19 | 14 | 10 | 13 | 9 | 22 | 20 | |
| GS | PM | GR | HL | MO | HE | FL | IL | AL | AP | VF | LG | CM | KC | CO | RE | Gene Name |
| F. Cytoskeltal | ||||||||||||||||
| 00155 | 6 | 3 | 8 | 1 | 3 | 2 | 2 | 4 | 1 | 4 | Thymosin β-4 | |||||
| 00244 | 4 | 14 | 1 | 2 | 1 | 3 | 4 | 1 | 1 | β-actin | ||||||
| 00685 | 3 | 5 | 2 | 4 | 1 | L-plastin | ||||||||||
| 01877 | 3 | 1 | 1 | 1 | Paxillin | |||||||||||
| 04080 | 2 | 1 | 1 | Cofilin | ||||||||||||
| 01030 | 1 | 2 | 1 | 2 | 1 | Myosin regulatory light chain | ||||||||||
| 01507 | 1 | 1 | α-actinin | |||||||||||||
| 00258 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2.5-kb cytoskeletal tropomyosin TM30 (nm) | |||||||||
| 01702 | 1 | 1 | Alkali myosin light chain | |||||||||||||
| 01726 | 1 | 2 | 1 | Striated muscle contraction regulatory protein | ||||||||||||
| 02833 | 1 | 1 | 1 | 1 | Nonmuscle myosin heavy chain (NMHC) | |||||||||||
| Total | 24 | 25 | 2 | 18 | 4 | 3 | 2 | 5 | 3 | 5 | 9 | 9 | 5 | 1 | ||
| G. Mitochondrial | ||||||||||||||||
| 00994 | 5 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | Glutamine synthetase | |||||||||
| 00313 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | SOD-2 manganese superoxide dismutase | ||||||||||
| 00360 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 1 | Mitochondrial phosphate carrier protein | ||||||||
| 00934 | 1 | 1 | 3 | 1 | 1 | 3 | 1 | 5 | 2 | coxVIb | ||||||
| 08345 | 1 | ATP synthase c subunit | ||||||||||||||
| 08434 | 1 | Manganese superoxide dismutase | ||||||||||||||
| 08667 | 1 | Glutamine synthetase | ||||||||||||||
| 01995 | 1 | 3 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | Glutathione peroxidase | ||||||||
| 08536 | 1 | SOD-2 gene for manganese superoxide dismutase | ||||||||||||||
| 04986 | 1 | Catalase | ||||||||||||||
| Total | 15 | 5 | 5 | 5 | 3 | 1 | 2 | 3 | 4 | 6 | 2 | 1 | 6 | 3 | ||
| H. Nuclear | ||||||||||||||||
| 01811 | 8 | 1 | 2 | 1 | H3.3 histone | |||||||||||
| 01367 | 7 | 3 | 1 | 1 | 1 | 3 | 1 | hnRNP-E1 | ||||||||
| 07795 | 5 | 1 | B-cell lymphoma 3-encoded protein (bc1-3) | |||||||||||||
| 08383 | 5 | Zinc-finger protein (bc1-6) | ||||||||||||||
| 05014 | 4 | H3.3 histone | ||||||||||||||
| 03575 | 3 | 1 | 2 | H3.3 histone | ||||||||||||
| 04074 | 3 | 1 | 1 | Transcription factor ETR101 | ||||||||||||
| 08375 | 3 | MAD-3 | ||||||||||||||
| 08389 | 3 | E4BP4 gene | ||||||||||||||
| 01431 | 2 | 1 | 3 | jun-D | ||||||||||||
| 01719 | 2 | 1 | Myeloid cell nuclear differentiation antigen | |||||||||||||
| 06259 | 2 | spi-1 proto-oncogene | ||||||||||||||
| 08044 | 2 | 1 | Zinc finger transcriptional regulator | |||||||||||||
| 01566 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | fus | ||||||||||
| 00827 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | dUTP pyrophosphatase (hdut) | ||||||||||
| 08621 | 1 | hnRNP A2/hnRNP B1 | ||||||||||||||
| 04003 | 1 | 1 | Receptor of retinoic acid | |||||||||||||
| 01772 | 1 | 1 | Interferon-γ induced protein (IFI 16) | |||||||||||||
| 01912 | 1 | 1 | 1 | CDEI binding protein/amyloid protein homologue | ||||||||||||
| 02730 | 1 | 2 | 2 | fos proto-oncogene | ||||||||||||
| 00487 | 1 | 1 | 1 | Transformation upregulated nuclear protein | ||||||||||||
| 00648 | 1 | 1 | 2 | 1 | Proliferating cell nucleolar protein P120 | |||||||||||
| 01803 | 1 | 1 | BAT1 nuclear RNA helicase (DEAD family) | |||||||||||||
| 01832 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | jun-B | |||||||||
| 03413 | 1 | tpr | ||||||||||||||
| 06299 | 1 | Arginine-rich nuclear protein | ||||||||||||||
| 08013 | 1 | 1 | Replication protein A 70 kD subunit | |||||||||||||
| 08366 | 1 | Pre-mRNA splicing factor SR p75 | ||||||||||||||
| 08411 | 1 | Transcription factor SUPT4H | ||||||||||||||
| 08454 | 1 | Nuclear factor erythroid 2 isoform f | ||||||||||||||
| 08546 | 1 | Transcription factor | ||||||||||||||
| 08647 | 1 | Putative RNA helicase HRH1 | ||||||||||||||
| Total | 68 | 6 | 2 | 7 | 1 | 3 | 1 | 1 | 7 | 7 | 7 | 5 | 6 | 5 | ||
| I. Secretory and granular | ||||||||||||||||
| 01823 | 18 | 2 | Pre-B cell enhancing factor (PBEF) | |||||||||||||
| 08339 | 9 | IL-8 | ||||||||||||||
| 02015 | 5 | 11 | LD78 α/macrophage inflammatory protein | |||||||||||||
| 08336 | 3 | Secretory granule proteoglycan peptide | ||||||||||||||
| 08638 | 2 | N-formylpeptide receptor (fMLP-R26) | ||||||||||||||
| 01820 | 2 | 1 | Antisecretory factor-1 | |||||||||||||
| 00592 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | ATL-derived factor/thioredoxin | |||||||||
| 01616 | 1 | 1 | 3 | 1 | 1 | Cystatin B | ||||||||||
| 08342 | 1 | Neutrophil peptide/defensin1/HP-1 | ||||||||||||||
| 08553 | 1 | Cathepsin S | ||||||||||||||
| 08318 | 1 | N-formylpeptide receptor (fMLP-R98) | ||||||||||||||
| 00111 | 1 | 1 | 7 | 9 | 13 | 6 | α 1-antitrypsin | |||||||||
| 02007 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | Globin | ||||||||||
| 08501 | 1 | Metalloproteinase-2 inhibitor (TIMP-2) | ||||||||||||||
| 08530 | 1 | Platelet-derived endothelial cell growth factor | ||||||||||||||
| 08644 | 1 | Platelet-derived endothelial cell growth factor | ||||||||||||||
| 08674 | 1 | Monocyte/neutrophil elastase inhibitor | ||||||||||||||
| Total | 50 | 2 | 1 | 20 | 7 | 10 | 14 | 6 | 1 | 2 | 2 | |||||
| GS | PM | GR | HL | MO | HE | FL | IL | AL | AP | VF | LG | CM | KC | CO | RE | Gene Name |
| J. Surface membrane | ||||||||||||||||
| 00565 | 24 | 3 | 4 | 5 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | 2 | 1 | β-2-microglobulin | ||||
| 00254 | 18 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 3 | MHC class I HLA-Cw1 | |||||||
| 00937 | 14 | 4 | 1 | 5 | 11 | 1 | HLA-E heavy chain | |||||||||
| 08362 | 13 | Granulocyte colony-stimulating factor receptor | ||||||||||||||
| 08438 | 4 | Nramp | ||||||||||||||
| 01187 | 3 | 2 | 1 | 1 | Monocyte activation antigen (Mo3) | |||||||||||
| 01585 | 3 | 2 | 3 | Tumor necrosis factor receptor | ||||||||||||
| 01304 | 3 | 1 | 2 | 1 | Transmembrane glycoprotein (CD53) | |||||||||||
| 01594 | 3 | 1 | Leukocyte common antigen T200 (CD45) | |||||||||||||
| 04103 | 3 | 1 | HLA-B27 antigen | |||||||||||||
| 05103 | 3 | ICAM-3 | ||||||||||||||
| 01624 | 2 | 2 | Aminopeptidase N/CD13 encoding aminopeptidase N | |||||||||||||
| 00303 | 2 | 2 | 2 | 1 | 1 | (chromosome 3p25) membrane protein | ||||||||||
| 08355 | 2 | C5a anaphylatoxin receptor | ||||||||||||||
| 08594 | 2 | TAP1 | ||||||||||||||
| 01048 | 1 | 1 | MHC antigen (HLA-B) | |||||||||||||
| 01395 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | Transmembrane receptor protein | ||||||||||
| 01229 | 1 | 1 | Migration inhibitory factor-related protein 8 | |||||||||||||
| 00474 | 1 | 1 | Transmembrane carcinoembryonic antigen BGPb | |||||||||||||
| 02079 | 1 | 1 | Palmitoylated erythrocyte membrane protein (MPP1) | |||||||||||||
| 02156 | 1 | 1 | 1 | CD14 myelid cell-specific leucine-rich glycoprotein | ||||||||||||
| 06689 | 1 | 1 | Leukocyte antigen CD97 | |||||||||||||
| 08349 | 1 | Leukocyte adhesion molecule-1 (LAM-1) | ||||||||||||||
| 08524 | 1 | Interferon-γ receptor | ||||||||||||||
| 08563 | 1 | Low-affinity IgG Fc receptor | ||||||||||||||
| 08564 | 1 | Complement receptor type 1 | ||||||||||||||
| 08592 | 1 | Common acute lymphoblastic leukemia antigen (CALLA) | ||||||||||||||
| 08661 | 1 | Putative voltage-gated potassium channel (KVLQT1) | ||||||||||||||
| 08678 | 1 | MHC class I-related protein | ||||||||||||||
| 08686 | 1 | IL-8 receptor β (IL8RB) | ||||||||||||||
| Total | 114 | 18 | 7 | 14 | 4 | 4 | 1 | 3 | 2 | 7 | 16 | 7 | 4 | 3 | 1 | |
| K. Unknown Function | ||||||||||||||||
| 03341 | 11 | 1 | 2 | B94 protein | ||||||||||||
| 01267 | 8 | 1 | 1-8D | |||||||||||||
| 04345 | 6 | B4-2 protein | ||||||||||||||
| 01087 | 3 | 6 | 2 | 1 | Brain-expressed HHCPA78 homolog | |||||||||||
| 00273 | 3 | 4 | 6 | 11 | 9 | 2 | 11 | 2 | 12 | 2 | 1 | 5 | 3 | 3 | 5 | Translationally controlled tumor protein |
| 01228 | 3 | 4 | 1 | 1 | Anonymous mRNA | |||||||||||
| 00729 | 3 | 2 | 1 | CLP | ||||||||||||
| 01288 | 2 | 1 | Bcl-2 related (Bfl-1) mRNA | |||||||||||||
| 00080 | 2 | 1 | Myeloid cell differentiation protein (MCL1) | |||||||||||||
| 00600 | 2 | 2 | 1 | 1 | CIRP | |||||||||||
| 01926 | 2 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | ras-related C3 botulinum toxin substrate (rac) mRNA | |||||||||
| 08056 | 2 | 1 | Helix-loop-helix basic phosphoprotein (GOS8) | |||||||||||||
| 08235 | 2 | 1 | ERF-1 | |||||||||||||
| 08444 | 2 | GLUDP2 | ||||||||||||||
| 00543 | 1 | 4 | 9 | 5 | 2 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 23-kD highly basic protein | |||
| 01224 | 1 | 4 | 1 | KIAA0184 protein | ||||||||||||
| 01609 | 1 | 4 | 1 | 2 | 1 | γ-interferon-inducible protein (IP-30) | ||||||||||
| 00185 | 1 | 2 | 1 | 1 | 2 | 1 | 2 | Putative p64 CLCP protein | ||||||||
| 01032 | 1 | 2 | 1 | 1 | 4 | 2 | polyA binding protein | |||||||||
| 01608 | 1 | 2 | 1 | 2 | 1 | 5 | APPH-amyloid precursor protein homolog | |||||||||
| 01665 | 1 | 2 | KIAAO168 protein | |||||||||||||
| 00751 | 1 | 1 | 1 | (clone SAA7C) sequence | ||||||||||||
| 00936 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | MLN51 | ||||||||||
| 01000 | 1 | 1 | EVI2B3P | |||||||||||||
| 00129 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | fau | |||||||||
| 00241 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | Acute myeloid leukemia associated protein (AML1/EAP) | |||||||||
| 00363 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | ORF (complete cds) and HepG2 identical sequence | |||||
| 00434 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | MLN50 | ||||||||
| 02011 | 1 | 1 | 1 | SH3 domain-containing proline-rich kinase (sprk) | ||||||||||||
| 02135 | 1 | 1 | 1 | KIAA0183 protein | ||||||||||||
| 02443 | 1 | 1 | HVLCAD gene | |||||||||||||
| 02662 | 1 | 1 | Anonymous mRNA | |||||||||||||
| 02820 | 1 | 1 | 3 | 1 | 1 | 1-8U | ||||||||||
| 02835 | 1 | 1 | 1 | Transformer-2 α (htra-2 α) mRNA | ||||||||||||
| 03864 | 1 | 1 | (clone 05) liver expressed protein fragment | |||||||||||||
| 04100 | 1 | 1 | Anonymous mRNA | |||||||||||||
| 05241 | 1 | 1 | 1 | ZFM1 protein | ||||||||||||
| 06150 | 1 | 1 | OS-9 precursor mRNA | |||||||||||||
| 07841 | 1 | 2 | Brain-expressed HHCPA78 homolog | |||||||||||||
| 08011 | 1 | 1 | Phorbolin I | |||||||||||||
| 08353 | 1 | H sapiens (clone pS6) Alu repeat | ||||||||||||||
| 08372 | 1 | DNA sequence from cosmid U61B11 | ||||||||||||||
| 08393 | 1 | fus-chop fusion protein | ||||||||||||||
| 08400 | 1 | MG44 | ||||||||||||||
| 08410 | 1 | Putative 32-kD heart protein PHP32 mRNA | ||||||||||||||
| GS | PM | GR | HL | MO | HE | FL | IL | AL | AP | VF | LG | CM | KC | CO | RE | Gene Name |
| 08472 | 1 | Retinoic acid-inducible E3 protein | ||||||||||||||
| 08492 | 1 | Fetal brain cDNA 5′-end | ||||||||||||||
| 08529 | 1 | Bcl-2 related (Bfl-1) mRNA | ||||||||||||||
| 08558 | 1 | Anonymous mRNA | ||||||||||||||
| 08600 | 1 | ftp-3 | ||||||||||||||
| 08627 | 1 | Fragile × mental retardation protein (FMR-1) | ||||||||||||||
| 08696 | 1 | Transcript ch138 | ||||||||||||||
| 12544 | 1 | Sp17 gene | ||||||||||||||
| Total | 90 | 39 | 23 | 25 | 16 | 6 | 13 | 7 | 20 | 23 | 12 | 16 | 19 | 17 | 16 |
| GS . | PM . | GR . | HL . | MO . | HE . | FL . | IL . | AL . | AP . | VF . | LG . | CM . | KC . | CO . | RE . | Gene Name . |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| A. Energy production | ||||||||||||||||
| 00943 | 1 | 1 | 3 | Phosphoglycerate kinase 1 | ||||||||||||
| 02200 | 1 | 1 | 1 | Transaldolase | ||||||||||||
| Total | 2 | 1 | 3 | 1 | 1 | |||||||||||
| B. Miscellaneous | ||||||||||||||||
| 00402 | 19 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 2 | Spermidine/spermine N1-acetyltransferase | |||||||
| 02161 | 4 | 1 | AMP deaminase isoform L (AMPD2) | |||||||||||||
| 00304 | 3 | 2 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 3 | 4 | 1 | 3 | 3 | Ubiquitin | |||
| 03216 | 3 | 1 | Long-chain acyl-CoA synthetase | |||||||||||||
| 01202 | 2 | 1 | Neutrophil oxidase factor (NCF2)/p67-phox | |||||||||||||
| 00483 | 2 | 1 | IMP dehydrogenase type 1 | |||||||||||||
| 03596 | 2 | Spermidine/spermine N1-acetyltransferase | ||||||||||||||
| 07377 | 2 | 1 | Inosine monophosphate dehydrogenase type II | |||||||||||||
| 08337 | 2 | Grancalcin | ||||||||||||||
| 08513 | 2 | Proteasome subunit p40 (Mov34) | ||||||||||||||
| 01263 | 1 | 2 | Vacuolar H+-ATPase Mr 56,000 subunit (HO57) | |||||||||||||
| 00253 | 1 | 2 | 1 | 2 | 1 | 2 | Importin beta subunit | |||||||||
| 01328 | 1 | 1 | Calpastatin=glycoprotein BS-17 component | |||||||||||||
| 02147 | 1 | 1 | 2 | Protein disulfide isomerase related protein (ERp72) | ||||||||||||
| 00154 | 1 | 1 | 1 | Glutaredoxin | ||||||||||||
| 00533 | 1 | 1 | 2 | 3 | 6 | 1 | Ferritin H chain | |||||||||
| 01766 | 1 | 6 | 15 | 2 | 4 | 1 | 2 | 5 | 10 | 1 | Metallothionein from cadmium-treated cells | |||||
| 07546 | 1 | Type 1 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor | ||||||||||||||
| 08483 | 1 | Ubiquitin conjugating enzyme (UBC4) | ||||||||||||||
| 08328 | 1 | Ribonuclease A | ||||||||||||||
| 08418 | 1 | Erythrocyte-type AMP deaminase | ||||||||||||||
| 08504 | 1 | Lysyl hydroxylase (PLOD) | ||||||||||||||
| 08643 | 1 | Histidase | ||||||||||||||
| 08690 | 1 | Ferritin H chain | ||||||||||||||
| Total | 55 | 8 | 3 | 9 | 7 | 20 | 3 | 5 | 6 | 9 | 4 | 10 | 14 | 12 | 2 | |
| C. Lysosomal | ||||||||||||||||
| 01809 | 5 | 3 | 6 | 1 | Lysosomal membrane glycoprotein CD63 | |||||||||||
| 01106 | 2 | 4 | 3 | Lysozyme | ||||||||||||
| 01533 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 1 | 1 | 1 | Lysosomal membrane glycoprotein-1 | |||||||
| 08663 | 1 | Arylsulphatase A | ||||||||||||||
| 08679 | 1 | 26S protease (S4) regulatory subunit | ||||||||||||||
| 08396 | 1 | Giantin/golgi antigen gcp372 | ||||||||||||||
| 08464 | 1 | Iduronate sulphate sulphatase (IDS) | ||||||||||||||
| 08664 | 1 | Iduronate sulphate sulphatase (IDS) | ||||||||||||||
| Total | 13 | 5 | 8 | 2 | 3 | 7 | 2 | 1 | ||||||||
| D. Signal transduction | ||||||||||||||||
| 02821 | 15 | 1 | 2 | 2 | 1 | CL 100 protein tyrosine phosphatase | ||||||||||
| 01724 | 6 | 2 | Pleckstrin (P47) | |||||||||||||
| 00816 | 5 | 5 | 1 | 1 | 1 | Lymphocyte-specific protein 1 (LSP1) | ||||||||||
| 01919 | 3 | 5 | 1 | 5 | 6 | 3 | 2 | 5 | 19 | Calcyclin | ||||||
| 00651 | 2 | 1 | 4 | 1 | Rho GDP-dissociation Inhibitor 2 | |||||||||||
| 01089 | 2 | 1 | Tyrosine kinase (HCK) | |||||||||||||
| 07614 | 2 | Cyclin G2 | ||||||||||||||
| 01524 | 1 | 1 | 1 | TSE1=protein kinase A regulatory subunit | ||||||||||||
| 00124 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | Ras-related protein (Krev-1) | ||||||||||
| 00286 | 1 | 2 | ERK activator kinase (MEK1) | |||||||||||||
| 00637 | 1 | 1 | 56K autoantigen annexin XI | |||||||||||||
| 01687 | 1 | 1 | c-raf-1 proto-oncogene | |||||||||||||
| 02144 | 1 | 1 | 1 | Protein kinase C ζ | ||||||||||||
| 03705 | 1 | α-subunit of Gi2 | ||||||||||||||
| 04134 | 1 | 1 | Rapamycin- and FK506-binding protein | |||||||||||||
| 06319 | 1 | 1 | Protein kinase | |||||||||||||
| 08680 | 1 | 5-lipoxygenase | ||||||||||||||
| Total | 45 | 8 | 7 | 9 | 4 | 2 | 1 | 1 | 5 | 8 | 6 | 5 | 6 | 22 | ||
| E. Ribosomal component and translation factor | ||||||||||||||||
| 01325 | 3 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | sui1iso1 | |||||||||
| 00314 | 2 | 1 | 3 | 3 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | 5 | 3 | 2 | Ribosomal protein S11 | |||
| 00919 | 2 | 1 | 1 | 1 | Splicing factor (CC1.4) | |||||||||||
| 00305 | 2 | 6 | 2 | 1 | 2 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 4 | 1 | Ribosomal protein L28 | ||
| 00995 | 1 | 3 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | Eukaryotic initiation factor 4AII | |||||
| 00650 | 1 | 2 | 14 | 5 | 2 | 1 | 2 | 1 | 6 | 1 | 2 | 2 | Ribosomal protein S18 | |||
| 00418 | 1 | 1 | 22 | 10 | 5 | 1 | 5 | 1 | 10 | 1 | 7 | 9 | Ribosomal protein L9 | |||
| 00795 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 2 | 5 | 3 | 6 | 3 | Ribosomal protein L30 | |||||
| 00818 | 1 | 1 | 4 | 1 | 2 | 1 | 2 | 2 | Ribosomal protein L5 | |||||||
| 00889 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | EF-1 δ | ||||||||
| 00356 | 1 | 16 | 2 | 1 | 2 | 1 | 2 | 1 | 1 | L23 putative ribosomal protein | ||||||
| 03424 | 1 | 1 | Translational initiation factor 2 β subunit | |||||||||||||
| Total | 17 | 11 | 68 | 26 | 8 | 7 | 17 | 10 | 19 | 14 | 10 | 13 | 9 | 22 | 20 | |
| GS | PM | GR | HL | MO | HE | FL | IL | AL | AP | VF | LG | CM | KC | CO | RE | Gene Name |
| F. Cytoskeltal | ||||||||||||||||
| 00155 | 6 | 3 | 8 | 1 | 3 | 2 | 2 | 4 | 1 | 4 | Thymosin β-4 | |||||
| 00244 | 4 | 14 | 1 | 2 | 1 | 3 | 4 | 1 | 1 | β-actin | ||||||
| 00685 | 3 | 5 | 2 | 4 | 1 | L-plastin | ||||||||||
| 01877 | 3 | 1 | 1 | 1 | Paxillin | |||||||||||
| 04080 | 2 | 1 | 1 | Cofilin | ||||||||||||
| 01030 | 1 | 2 | 1 | 2 | 1 | Myosin regulatory light chain | ||||||||||
| 01507 | 1 | 1 | α-actinin | |||||||||||||
| 00258 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2.5-kb cytoskeletal tropomyosin TM30 (nm) | |||||||||
| 01702 | 1 | 1 | Alkali myosin light chain | |||||||||||||
| 01726 | 1 | 2 | 1 | Striated muscle contraction regulatory protein | ||||||||||||
| 02833 | 1 | 1 | 1 | 1 | Nonmuscle myosin heavy chain (NMHC) | |||||||||||
| Total | 24 | 25 | 2 | 18 | 4 | 3 | 2 | 5 | 3 | 5 | 9 | 9 | 5 | 1 | ||
| G. Mitochondrial | ||||||||||||||||
| 00994 | 5 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | Glutamine synthetase | |||||||||
| 00313 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | SOD-2 manganese superoxide dismutase | ||||||||||
| 00360 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 1 | Mitochondrial phosphate carrier protein | ||||||||
| 00934 | 1 | 1 | 3 | 1 | 1 | 3 | 1 | 5 | 2 | coxVIb | ||||||
| 08345 | 1 | ATP synthase c subunit | ||||||||||||||
| 08434 | 1 | Manganese superoxide dismutase | ||||||||||||||
| 08667 | 1 | Glutamine synthetase | ||||||||||||||
| 01995 | 1 | 3 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | Glutathione peroxidase | ||||||||
| 08536 | 1 | SOD-2 gene for manganese superoxide dismutase | ||||||||||||||
| 04986 | 1 | Catalase | ||||||||||||||
| Total | 15 | 5 | 5 | 5 | 3 | 1 | 2 | 3 | 4 | 6 | 2 | 1 | 6 | 3 | ||
| H. Nuclear | ||||||||||||||||
| 01811 | 8 | 1 | 2 | 1 | H3.3 histone | |||||||||||
| 01367 | 7 | 3 | 1 | 1 | 1 | 3 | 1 | hnRNP-E1 | ||||||||
| 07795 | 5 | 1 | B-cell lymphoma 3-encoded protein (bc1-3) | |||||||||||||
| 08383 | 5 | Zinc-finger protein (bc1-6) | ||||||||||||||
| 05014 | 4 | H3.3 histone | ||||||||||||||
| 03575 | 3 | 1 | 2 | H3.3 histone | ||||||||||||
| 04074 | 3 | 1 | 1 | Transcription factor ETR101 | ||||||||||||
| 08375 | 3 | MAD-3 | ||||||||||||||
| 08389 | 3 | E4BP4 gene | ||||||||||||||
| 01431 | 2 | 1 | 3 | jun-D | ||||||||||||
| 01719 | 2 | 1 | Myeloid cell nuclear differentiation antigen | |||||||||||||
| 06259 | 2 | spi-1 proto-oncogene | ||||||||||||||
| 08044 | 2 | 1 | Zinc finger transcriptional regulator | |||||||||||||
| 01566 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | fus | ||||||||||
| 00827 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | dUTP pyrophosphatase (hdut) | ||||||||||
| 08621 | 1 | hnRNP A2/hnRNP B1 | ||||||||||||||
| 04003 | 1 | 1 | Receptor of retinoic acid | |||||||||||||
| 01772 | 1 | 1 | Interferon-γ induced protein (IFI 16) | |||||||||||||
| 01912 | 1 | 1 | 1 | CDEI binding protein/amyloid protein homologue | ||||||||||||
| 02730 | 1 | 2 | 2 | fos proto-oncogene | ||||||||||||
| 00487 | 1 | 1 | 1 | Transformation upregulated nuclear protein | ||||||||||||
| 00648 | 1 | 1 | 2 | 1 | Proliferating cell nucleolar protein P120 | |||||||||||
| 01803 | 1 | 1 | BAT1 nuclear RNA helicase (DEAD family) | |||||||||||||
| 01832 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | jun-B | |||||||||
| 03413 | 1 | tpr | ||||||||||||||
| 06299 | 1 | Arginine-rich nuclear protein | ||||||||||||||
| 08013 | 1 | 1 | Replication protein A 70 kD subunit | |||||||||||||
| 08366 | 1 | Pre-mRNA splicing factor SR p75 | ||||||||||||||
| 08411 | 1 | Transcription factor SUPT4H | ||||||||||||||
| 08454 | 1 | Nuclear factor erythroid 2 isoform f | ||||||||||||||
| 08546 | 1 | Transcription factor | ||||||||||||||
| 08647 | 1 | Putative RNA helicase HRH1 | ||||||||||||||
| Total | 68 | 6 | 2 | 7 | 1 | 3 | 1 | 1 | 7 | 7 | 7 | 5 | 6 | 5 | ||
| I. Secretory and granular | ||||||||||||||||
| 01823 | 18 | 2 | Pre-B cell enhancing factor (PBEF) | |||||||||||||
| 08339 | 9 | IL-8 | ||||||||||||||
| 02015 | 5 | 11 | LD78 α/macrophage inflammatory protein | |||||||||||||
| 08336 | 3 | Secretory granule proteoglycan peptide | ||||||||||||||
| 08638 | 2 | N-formylpeptide receptor (fMLP-R26) | ||||||||||||||
| 01820 | 2 | 1 | Antisecretory factor-1 | |||||||||||||
| 00592 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | ATL-derived factor/thioredoxin | |||||||||
| 01616 | 1 | 1 | 3 | 1 | 1 | Cystatin B | ||||||||||
| 08342 | 1 | Neutrophil peptide/defensin1/HP-1 | ||||||||||||||
| 08553 | 1 | Cathepsin S | ||||||||||||||
| 08318 | 1 | N-formylpeptide receptor (fMLP-R98) | ||||||||||||||
| 00111 | 1 | 1 | 7 | 9 | 13 | 6 | α 1-antitrypsin | |||||||||
| 02007 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | Globin | ||||||||||
| 08501 | 1 | Metalloproteinase-2 inhibitor (TIMP-2) | ||||||||||||||
| 08530 | 1 | Platelet-derived endothelial cell growth factor | ||||||||||||||
| 08644 | 1 | Platelet-derived endothelial cell growth factor | ||||||||||||||
| 08674 | 1 | Monocyte/neutrophil elastase inhibitor | ||||||||||||||
| Total | 50 | 2 | 1 | 20 | 7 | 10 | 14 | 6 | 1 | 2 | 2 | |||||
| GS | PM | GR | HL | MO | HE | FL | IL | AL | AP | VF | LG | CM | KC | CO | RE | Gene Name |
| J. Surface membrane | ||||||||||||||||
| 00565 | 24 | 3 | 4 | 5 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | 2 | 1 | β-2-microglobulin | ||||
| 00254 | 18 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 3 | MHC class I HLA-Cw1 | |||||||
| 00937 | 14 | 4 | 1 | 5 | 11 | 1 | HLA-E heavy chain | |||||||||
| 08362 | 13 | Granulocyte colony-stimulating factor receptor | ||||||||||||||
| 08438 | 4 | Nramp | ||||||||||||||
| 01187 | 3 | 2 | 1 | 1 | Monocyte activation antigen (Mo3) | |||||||||||
| 01585 | 3 | 2 | 3 | Tumor necrosis factor receptor | ||||||||||||
| 01304 | 3 | 1 | 2 | 1 | Transmembrane glycoprotein (CD53) | |||||||||||
| 01594 | 3 | 1 | Leukocyte common antigen T200 (CD45) | |||||||||||||
| 04103 | 3 | 1 | HLA-B27 antigen | |||||||||||||
| 05103 | 3 | ICAM-3 | ||||||||||||||
| 01624 | 2 | 2 | Aminopeptidase N/CD13 encoding aminopeptidase N | |||||||||||||
| 00303 | 2 | 2 | 2 | 1 | 1 | (chromosome 3p25) membrane protein | ||||||||||
| 08355 | 2 | C5a anaphylatoxin receptor | ||||||||||||||
| 08594 | 2 | TAP1 | ||||||||||||||
| 01048 | 1 | 1 | MHC antigen (HLA-B) | |||||||||||||
| 01395 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | Transmembrane receptor protein | ||||||||||
| 01229 | 1 | 1 | Migration inhibitory factor-related protein 8 | |||||||||||||
| 00474 | 1 | 1 | Transmembrane carcinoembryonic antigen BGPb | |||||||||||||
| 02079 | 1 | 1 | Palmitoylated erythrocyte membrane protein (MPP1) | |||||||||||||
| 02156 | 1 | 1 | 1 | CD14 myelid cell-specific leucine-rich glycoprotein | ||||||||||||
| 06689 | 1 | 1 | Leukocyte antigen CD97 | |||||||||||||
| 08349 | 1 | Leukocyte adhesion molecule-1 (LAM-1) | ||||||||||||||
| 08524 | 1 | Interferon-γ receptor | ||||||||||||||
| 08563 | 1 | Low-affinity IgG Fc receptor | ||||||||||||||
| 08564 | 1 | Complement receptor type 1 | ||||||||||||||
| 08592 | 1 | Common acute lymphoblastic leukemia antigen (CALLA) | ||||||||||||||
| 08661 | 1 | Putative voltage-gated potassium channel (KVLQT1) | ||||||||||||||
| 08678 | 1 | MHC class I-related protein | ||||||||||||||
| 08686 | 1 | IL-8 receptor β (IL8RB) | ||||||||||||||
| Total | 114 | 18 | 7 | 14 | 4 | 4 | 1 | 3 | 2 | 7 | 16 | 7 | 4 | 3 | 1 | |
| K. Unknown Function | ||||||||||||||||
| 03341 | 11 | 1 | 2 | B94 protein | ||||||||||||
| 01267 | 8 | 1 | 1-8D | |||||||||||||
| 04345 | 6 | B4-2 protein | ||||||||||||||
| 01087 | 3 | 6 | 2 | 1 | Brain-expressed HHCPA78 homolog | |||||||||||
| 00273 | 3 | 4 | 6 | 11 | 9 | 2 | 11 | 2 | 12 | 2 | 1 | 5 | 3 | 3 | 5 | Translationally controlled tumor protein |
| 01228 | 3 | 4 | 1 | 1 | Anonymous mRNA | |||||||||||
| 00729 | 3 | 2 | 1 | CLP | ||||||||||||
| 01288 | 2 | 1 | Bcl-2 related (Bfl-1) mRNA | |||||||||||||
| 00080 | 2 | 1 | Myeloid cell differentiation protein (MCL1) | |||||||||||||
| 00600 | 2 | 2 | 1 | 1 | CIRP | |||||||||||
| 01926 | 2 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | ras-related C3 botulinum toxin substrate (rac) mRNA | |||||||||
| 08056 | 2 | 1 | Helix-loop-helix basic phosphoprotein (GOS8) | |||||||||||||
| 08235 | 2 | 1 | ERF-1 | |||||||||||||
| 08444 | 2 | GLUDP2 | ||||||||||||||
| 00543 | 1 | 4 | 9 | 5 | 2 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 23-kD highly basic protein | |||
| 01224 | 1 | 4 | 1 | KIAA0184 protein | ||||||||||||
| 01609 | 1 | 4 | 1 | 2 | 1 | γ-interferon-inducible protein (IP-30) | ||||||||||
| 00185 | 1 | 2 | 1 | 1 | 2 | 1 | 2 | Putative p64 CLCP protein | ||||||||
| 01032 | 1 | 2 | 1 | 1 | 4 | 2 | polyA binding protein | |||||||||
| 01608 | 1 | 2 | 1 | 2 | 1 | 5 | APPH-amyloid precursor protein homolog | |||||||||
| 01665 | 1 | 2 | KIAAO168 protein | |||||||||||||
| 00751 | 1 | 1 | 1 | (clone SAA7C) sequence | ||||||||||||
| 00936 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | MLN51 | ||||||||||
| 01000 | 1 | 1 | EVI2B3P | |||||||||||||
| 00129 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | fau | |||||||||
| 00241 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | Acute myeloid leukemia associated protein (AML1/EAP) | |||||||||
| 00363 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | ORF (complete cds) and HepG2 identical sequence | |||||
| 00434 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | MLN50 | ||||||||
| 02011 | 1 | 1 | 1 | SH3 domain-containing proline-rich kinase (sprk) | ||||||||||||
| 02135 | 1 | 1 | 1 | KIAA0183 protein | ||||||||||||
| 02443 | 1 | 1 | HVLCAD gene | |||||||||||||
| 02662 | 1 | 1 | Anonymous mRNA | |||||||||||||
| 02820 | 1 | 1 | 3 | 1 | 1 | 1-8U | ||||||||||
| 02835 | 1 | 1 | 1 | Transformer-2 α (htra-2 α) mRNA | ||||||||||||
| 03864 | 1 | 1 | (clone 05) liver expressed protein fragment | |||||||||||||
| 04100 | 1 | 1 | Anonymous mRNA | |||||||||||||
| 05241 | 1 | 1 | 1 | ZFM1 protein | ||||||||||||
| 06150 | 1 | 1 | OS-9 precursor mRNA | |||||||||||||
| 07841 | 1 | 2 | Brain-expressed HHCPA78 homolog | |||||||||||||
| 08011 | 1 | 1 | Phorbolin I | |||||||||||||
| 08353 | 1 | H sapiens (clone pS6) Alu repeat | ||||||||||||||
| 08372 | 1 | DNA sequence from cosmid U61B11 | ||||||||||||||
| 08393 | 1 | fus-chop fusion protein | ||||||||||||||
| 08400 | 1 | MG44 | ||||||||||||||
| 08410 | 1 | Putative 32-kD heart protein PHP32 mRNA | ||||||||||||||
| GS | PM | GR | HL | MO | HE | FL | IL | AL | AP | VF | LG | CM | KC | CO | RE | Gene Name |
| 08472 | 1 | Retinoic acid-inducible E3 protein | ||||||||||||||
| 08492 | 1 | Fetal brain cDNA 5′-end | ||||||||||||||
| 08529 | 1 | Bcl-2 related (Bfl-1) mRNA | ||||||||||||||
| 08558 | 1 | Anonymous mRNA | ||||||||||||||
| 08600 | 1 | ftp-3 | ||||||||||||||
| 08627 | 1 | Fragile × mental retardation protein (FMR-1) | ||||||||||||||
| 08696 | 1 | Transcript ch138 | ||||||||||||||
| 12544 | 1 | Sp17 gene | ||||||||||||||
| Total | 90 | 39 | 23 | 25 | 16 | 6 | 13 | 7 | 20 | 23 | 12 | 16 | 19 | 17 | 16 |
Two hundred sixteen gene species matched to known genes were categorized according to their functions and subcellular localizations. Numbers represent frequency of appearance of the gene transcripts among 1,000 cDNA analyzed. Abundances of the GSs that appeared in other libraries are also shown for comparison’s sake. For some cells, see legend to Table 1. The bottom line (total) shows the total count of the collection. Numbers of the expressed genes shown in columns PM through RE are from about 1,000 mRNA analyzed in each library.
Abbreviation: PM, peripheral granulocytes.