Table 1.

Expression Profile of Active Genes in Human Peripheral Granulocytes (A) and Granulocytoids by Inducing HL60 With DMSO (B)

(A)
GS lib PM GR HL MOHE FL IL AL AP VF LG CM KC CORE Gene Name
00565  ▪  24  3  4    1  1  1   1  4  2   1  β 2-microglobulin* 
00402  ▪  19    1  2     1  1   1   Spermidine/spermine N1-acetyltransferase  
00254  ▪ 18    2  1    1  1  1    3   MHC class I HLA-Cw1  
01823   18   2             Pre-B cell enhancing factor (PBEF)  
02821   15         1  2  2   1   CL 100 protein tyrosine phosphatase  
00937  ▪  14  1        5  11   1    HLA-E heavy chain (3′ untranslated region)  
08362  □  13               Granulocyte colony-stimulating factor receptor* 
03341   11        1  2       B94 protein  
01476   10  3       1  1  
08339  □                IL-8* 
01267   8               1-8D 
01811   8    1           1  H3.3 histone  
08347  □  8  
01367 ▪  7  3   1      1  1     1  hnRNP-E1  
00155  ▪  6   8  1   3   2   2  4  1   Thymosin β-4  
02490  ▪        1  1  1  2    2  
04345  □                B4-2 protein  
05209  □  6  
01724                Pleckstrin (P47) 
00816   5  5  1  1            Lymphocyte-specific protein 1 (LSP1)  
00994 ▪  5  2   1          1  1  Glutamine synthetase  
01809  5    3         6    Lysosomal membrane glycoprotein CD63  
04290  □ 5  
02015   5    11            LD78 α/macrophage inflammatory protein (GOS19-1)* 
07795           1       B-cell lymphoma 3-encoded protein (bcl-3)  
08383  □                Zinc-finger protein (bc1-6)  
00244  ▪  4  14   1      1   3  4  1  1  β-actin 
01371  □  4  1  
02161       1           AMP deaminase isoform L (AMPD2)  
05014  □                Histone H3.3  
05242  □  4  
03554  □  4  
08325 □  4  
08395  □  4  
08438  □                Nramp 
01087   3  6        2       Brain-expressed HHCPA78 homolog  
00685  3  5  2  4            L-plastin  
00273  ▪  4  6  11  9  2  11  2  12  2  1  3  3  5  Translationally controlled tumor protein 
01228   3  4          1     Anonymous mRNA  
00304  ▪ 3  2  1  2  2  1   1  3  4  1   3   Ubiquitin  
01473   3   2        1  
01187   3   1        1      Monocyte activation antigen (Mo3)  
01334   3  2   
01406   3  2   1  
01585   3   3             Tumor necrosis factor receptor* 
01325  ▪  3         1   1   2  sui1iso1  
00239   3  1    1  
01304  3  1   2            Transmembrane glycoprotein (CD53) 
01594  □  3               Leukocyte common antigen T200 (CD45)* 
01919  ▪  3      1   5  6  3  2  5  19  Calcyclin  
03575             1  2    Histone H3.3  
01877   3          1   1    Paxillin 
00729   3            1    CLP mRNA 
06701   3            
04074   3             1   Transcription factor ETR101  
04103   3               HLA-B27 antigen  
01826     1  
03216   3               Long-chain acyl-CoA synthetase 
08336  □                Secretory granule proteoglycan peptide  
05103  □                ICAM-3* 
08389  □                E4BP4 gene  
08375  □                MAD-3 
08424  □  3  
08548  □  3  
Total   370 74  17  75  17  6  16  8  32  30  33 37  21  43  12   
(B)  
GS  lib  GR  PM  HL  MO  HE FL  IL  AL  AP  VF  LG  CM  KC  CO  RE Gene Name  
00565  ▪  3  24  4  5    1  1   1  4  2   β-2-microglobulin  
00937  ▪  4  14        5  11   1    HLA-E heavy chain (3′ untranslated region)  
01476   3  10  2      1  1  
01367  ▪  3   1      1  1  3     hnRNP-E1  
00155  ▪  3  6   8   3   2   2  4  1  4   Thymosin β-4  
00816   5  5  1        1      Lymphocyte-specific protein 1 (LSP1)  
00244  ▪  14  4   1      1   3  4  1  1  β-actin 
01087   6  3        2       Brain-expressed HHCPA78 homolog  
00685  5  3  2  4            L-plastin  
01228   3       1        Anonymous mRNA  
00273  ▪  4  3  11  9  2  11  2  12  2  1  5  3  5  Translationally controlled tumor protein  
01394 □  4              1  
01106   4  2              Lysozyme  
01321 ▪  3  2   2   1  2   1   1   2  2  
01007  ▪  3        1   1  2    Stimulatory GTP-binding protein alpha subunit 
01609   4  1       1    1     γ-interferon-inducible protein (IP-30) 
01603  □  4  1  
01224   4          1      KIAAO184 protein  
01075   4  1       1  
00543  ▪  4  1  9  5    1  2  2   2  2  2  3  23-kD highly basic protein  
01365  □  3  1  
00995  ▪  1   1   1   1  1   1  2   1  Eukaryotic initiation factor 4AII  
00783   3  1  1  
00383  ▪  3  1  1  3   1   2    1  2  
total  □  6  2  3  31  14  25  16  56  30  42  49 34  37  29  
00583  ▪  5   2     1  1  2  3  2  1   4  Ribosomal protein L3  
00249   5        1  1    1    Liver glycogen phosphorylase type IV  
00114  ▪  5   1   1     1  3  1     Cytoskeletal gamma-actin  
01572  □  4  
01345  □                Bactericidal permeability increasing protein (BPI)  
01445          1    1  
01024     2             Leukocyte adhesion protein/LFA-1/Mac-1  
00096  ▪  4   2  6    1  6  2  2  3  3   α NAC  
01478                hnRNP-E2  
01372           1     2   Antigen migration inhibitory factor-related protein 14  
01244 ▪  3    1      2  2   2  1  2  Mitochondrial ubiquinone-binding protein  
01141  3      1    2     7  
01091          1       Transcriptional coactivator PC4  
00997  □ 3  
00875  ▪  3   2  1   1       1  
00839   3            1  1   Cercopithecus aethiops UV-damaged DNA-binding protein  
00732  ▪   6  4    1  4  1   1  1   1  Ribosomal protein L38  
00716  ▪  3   3      1  3  2  1  2  1  
00697   3   2             Plasminogen activator inhibitor-2 (PAI-2)  
00687   3   1             Glycoprotein 
00335  ▪  3   15  3  1  1  1   2  3  6  1  5  1  Ribosomal protein L7a 
00290  ▪  3   9  8  5  4  2  1   1  1  5  2  4  Ribosomal protein L37a 
00162  ▪  3   4  2  1  1   1  2  2  4  1  1   Acidic ribosomal phosphoprotein P2  
00071   3                
(A)
GS lib PM GR HL MOHE FL IL AL AP VF LG CM KC CORE Gene Name
00565  ▪  24  3  4    1  1  1   1  4  2   1  β 2-microglobulin* 
00402  ▪  19    1  2     1  1   1   Spermidine/spermine N1-acetyltransferase  
00254  ▪ 18    2  1    1  1  1    3   MHC class I HLA-Cw1  
01823   18   2             Pre-B cell enhancing factor (PBEF)  
02821   15         1  2  2   1   CL 100 protein tyrosine phosphatase  
00937  ▪  14  1        5  11   1    HLA-E heavy chain (3′ untranslated region)  
08362  □  13               Granulocyte colony-stimulating factor receptor* 
03341   11        1  2       B94 protein  
01476   10  3       1  1  
08339  □                IL-8* 
01267   8               1-8D 
01811   8    1           1  H3.3 histone  
08347  □  8  
01367 ▪  7  3   1      1  1     1  hnRNP-E1  
00155  ▪  6   8  1   3   2   2  4  1   Thymosin β-4  
02490  ▪        1  1  1  2    2  
04345  □                B4-2 protein  
05209  □  6  
01724                Pleckstrin (P47) 
00816   5  5  1  1            Lymphocyte-specific protein 1 (LSP1)  
00994 ▪  5  2   1          1  1  Glutamine synthetase  
01809  5    3         6    Lysosomal membrane glycoprotein CD63  
04290  □ 5  
02015   5    11            LD78 α/macrophage inflammatory protein (GOS19-1)* 
07795           1       B-cell lymphoma 3-encoded protein (bcl-3)  
08383  □                Zinc-finger protein (bc1-6)  
00244  ▪  4  14   1      1   3  4  1  1  β-actin 
01371  □  4  1  
02161       1           AMP deaminase isoform L (AMPD2)  
05014  □                Histone H3.3  
05242  □  4  
03554  □  4  
08325 □  4  
08395  □  4  
08438  □                Nramp 
01087   3  6        2       Brain-expressed HHCPA78 homolog  
00685  3  5  2  4            L-plastin  
00273  ▪  4  6  11  9  2  11  2  12  2  1  3  3  5  Translationally controlled tumor protein 
01228   3  4          1     Anonymous mRNA  
00304  ▪ 3  2  1  2  2  1   1  3  4  1   3   Ubiquitin  
01473   3   2        1  
01187   3   1        1      Monocyte activation antigen (Mo3)  
01334   3  2   
01406   3  2   1  
01585   3   3             Tumor necrosis factor receptor* 
01325  ▪  3         1   1   2  sui1iso1  
00239   3  1    1  
01304  3  1   2            Transmembrane glycoprotein (CD53) 
01594  □  3               Leukocyte common antigen T200 (CD45)* 
01919  ▪  3      1   5  6  3  2  5  19  Calcyclin  
03575             1  2    Histone H3.3  
01877   3          1   1    Paxillin 
00729   3            1    CLP mRNA 
06701   3            
04074   3             1   Transcription factor ETR101  
04103   3               HLA-B27 antigen  
01826     1  
03216   3               Long-chain acyl-CoA synthetase 
08336  □                Secretory granule proteoglycan peptide  
05103  □                ICAM-3* 
08389  □                E4BP4 gene  
08375  □                MAD-3 
08424  □  3  
08548  □  3  
Total   370 74  17  75  17  6  16  8  32  30  33 37  21  43  12   
(B)  
GS  lib  GR  PM  HL  MO  HE FL  IL  AL  AP  VF  LG  CM  KC  CO  RE Gene Name  
00565  ▪  3  24  4  5    1  1   1  4  2   β-2-microglobulin  
00937  ▪  4  14        5  11   1    HLA-E heavy chain (3′ untranslated region)  
01476   3  10  2      1  1  
01367  ▪  3   1      1  1  3     hnRNP-E1  
00155  ▪  3  6   8   3   2   2  4  1  4   Thymosin β-4  
00816   5  5  1        1      Lymphocyte-specific protein 1 (LSP1)  
00244  ▪  14  4   1      1   3  4  1  1  β-actin 
01087   6  3        2       Brain-expressed HHCPA78 homolog  
00685  5  3  2  4            L-plastin  
01228   3       1        Anonymous mRNA  
00273  ▪  4  3  11  9  2  11  2  12  2  1  5  3  5  Translationally controlled tumor protein  
01394 □  4              1  
01106   4  2              Lysozyme  
01321 ▪  3  2   2   1  2   1   1   2  2  
01007  ▪  3        1   1  2    Stimulatory GTP-binding protein alpha subunit 
01609   4  1       1    1     γ-interferon-inducible protein (IP-30) 
01603  □  4  1  
01224   4          1      KIAAO184 protein  
01075   4  1       1  
00543  ▪  4  1  9  5    1  2  2   2  2  2  3  23-kD highly basic protein  
01365  □  3  1  
00995  ▪  1   1   1   1  1   1  2   1  Eukaryotic initiation factor 4AII  
00783   3  1  1  
00383  ▪  3  1  1  3   1   2    1  2  
total  □  6  2  3  31  14  25  16  56  30  42  49 34  37  29  
00583  ▪  5   2     1  1  2  3  2  1   4  Ribosomal protein L3  
00249   5        1  1    1    Liver glycogen phosphorylase type IV  
00114  ▪  5   1   1     1  3  1     Cytoskeletal gamma-actin  
01572  □  4  
01345  □                Bactericidal permeability increasing protein (BPI)  
01445          1    1  
01024     2             Leukocyte adhesion protein/LFA-1/Mac-1  
00096  ▪  4   2  6    1  6  2  2  3  3   α NAC  
01478                hnRNP-E2  
01372           1     2   Antigen migration inhibitory factor-related protein 14  
01244 ▪  3    1      2  2   2  1  2  Mitochondrial ubiquinone-binding protein  
01141  3      1    2     7  
01091          1       Transcriptional coactivator PC4  
00997  □ 3  
00875  ▪  3   2  1   1       1  
00839   3            1  1   Cercopithecus aethiops UV-damaged DNA-binding protein  
00732  ▪   6  4    1  4  1   1  1   1  Ribosomal protein L38  
00716  ▪  3   3      1  3  2  1  2  1  
00697   3   2             Plasminogen activator inhibitor-2 (PAI-2)  
00687   3   1             Glycoprotein 
00335  ▪  3   15  3  1  1  1   2  3  6  1  5  1  Ribosomal protein L7a 
00290  ▪  3   9  8  5  4  2  1   1  1  5  2  4  Ribosomal protein L37a 
00162  ▪  3   4  2  1  1   1  2  2  4  1  1   Acidic ribosomal phosphoprotein P2  
00071   3                

Genes are registered according to their order of abundance. Numbers represent the frequency among 1142 cDNA clones analyzed in (A) and 1042 cDNA analyzed in (B). For simplicity’s sake, only those genes that appeared three times or more are listed. The expression profile of low abundant genes can be accessed electronically in www bodymapper server (http://www.imcb.osaka-u.ac.jp/bodymap). Abundances of the GSs that appeared in other libraries are also shown for comparison’s sake. Numbers represent abundance among 1142 cDNA clones. Number of libraries in which a given GS has been detected is shown in the column ‘lib’ by the shading pattern: (solid area) the GS has been detected in 6 libraries or more representing ubiquitous expression; (open area) only in the PM and GR libraries, possibly representing granulocyte-specific expression; (hatched area) in 2 through 5 libraries, possibly representing common expression. Genes that have so far been reported in GenBank are listed in the column “Gene Name.”

Abbreviations: PM, peripheral granulocytes; GR, granulocytoid cells induced by DMSO; HL, HL60 cells; MO, monocytoid cells obtained by inducing HL60 with tetradecanoylphorbol-13 acetate (TPA); HE, HepG2 cells; FL, fetal liver; IL, infant liver; AL, adult liver; AP, subcutaneous fat; VF, visceral fat; LG, lung; CM, colonic mucosa; KC, kerationcyte; CO, cornea; RE, retina.

*Active in granulocytes (only in A).

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal