Table 1.

Functional characterization of C/EBP target genes

GenBank accession no., by gene function
Fold change
Probe set
Gene symbol
C/EBPα
C/EBPβ
C/EBPδ
C/EBPϵ
Immune response       
M63695  103422_at  Cd1d1  53.47   3.05   7.36   2.42  
AW124547  96092_at  Hp*  28.05   2.72   3.76   1.85  
M27008  100436_at  Orm1†  14.20   1.03   3.25   1.23  
M83218  103448_at  S100a8  12.99   0.99   1.72   2.12  
M63697  101897_g_at  Cd1d2  11.76   1.63   2.65   2.27  
A1786089   93837_at  Kng  9.13   1.74   2.15   2.16  
K02782  95910_f_at  C3†  8.43   2.18   3.39   1.62  
X81627  160564_at  Lcn2†  5.84   0.75   1.16   3.82  
U27267  98772_at  Cxcl5‡  4.21   2.03   2.48   5.02  
M74123  94224_s_at  Ifi205‡  3.90   1.23   1.88   3.34  
X57349  X57349_M_at  Trfr  3.70   3.46   1.61   2.78  
M21050  100611_at  Lyzs†*  3.69   1.34   1.00   1.12  
M31419  98465_f_at  Ifi204*  3.07   1.03   1.50   2.51  
M32486  100477_at  M32486  3.06   1.15   1.30   2.74  
AB012693  103611_at  Cd47†  2.91   2.09   1.61   2.52  
X83601  92731_at  Ptx3  2.82   1.28   2.44   4.19  
L09737  102313_at  Gch  0.31   0.50   0.89   0.39  
X68273  103016_s_at  Cd68  0.25   0.50   0.91   0.36  
L39017  98018_at  Procr  0.16   0.29   0.90   0.15  
AJ242830  102948_at  Hemt1  0.08   0.19   0.86   0.07  
Cell proliferation       
AF099973  92472_f_at  Slfn2  8.85   2.48   2.12   6.82  
AF036893  93694_at  Per2*  4.85   1.73   1.75   11.40  
AF099977  92315_at  Slfn4  4.98   1.10   2.36   2.27  
Z22703  99435_at  Fgf7  4.28   1.59   2.46   4.75  
X72307  102898_at  Hgf*  4.07   1.17   0.86   1.31  
X53929  93534_at  Dcn  3.93   3.09   1.73   9.75  
A1834950   98507_at  Nr1d1*  0.31   0.44   0.69   0.31  
M64292  101583_at  Btg2  0.30   0.49   0.92   0.28  
X61940  104598_at  Dusp1*  0.27   0.44   0.98   0.28  
AV373612  161980_f_at  Bag3  0.25   0.38   0.74   0.25  
D14077  95286_at  Clu  0.24   0.41   0.75   0.31  
sX67083   101429_at  Ddit3*  0.22   0.42   0.93   0.22  
AA770736  161067_at  Ifld2*  0.20   0.36   0.93   0.07  
M17298  102298_at  Ngfb  0.16   0.49   0.65   0.16  
X54149  102779_at  Gadd45b*§  0.16   0.46   1.03   0.07  
U21673  99134_at  Tcte3  0.16   0.23   0.97   0.16  
L31958  100548_at  Pea15  0.11   0.46   1.09   0.28  
AF061972  103671_at  Htatip2  0.10   0.34   0.78   0.11  
V00727  160901_at  Fos*  0.08   0.20   1.12   0.06  
AF055638  101979_at  Gadd45g*‡§  0.05   0.19   0.94   0.04  
Metabolism       
AA726364  95611_at  Lp1  38.65   3.49   6.44   3.99  
Z48670  92913_at  Abcd2†  13.46   2.52   2.73   3.44  
AI849718  160111_at  elF1A  6.81   6.02   1.60   5.63  
AW048512  95426_at  Echs1  6.38   4.35   3.45   6.12  
AW049778  160770_at  Mvd  5.69   6.38   1.59   6.09  
U15977  94507_at  Facl2  5.40   1.22   1.39   1.48  
L16992  102302_at  Bckdhb  3.05   1.73   1.06   1.62  
X07888  99425_at  HMGCR  2.91   2.39   1.30   1.68  
AW106745  98631_g_at  Nsdh1  2.74   2.91   1.39   3.54  
AW122523  103665_at  Lce-pending   2.67   3.22   1.19   2.95  
AW047343  160841_at  Dbp  0.69   2.10   0.91   0.41  
X05862  93833_s_at  Hist1h2bc†  0.62   0.58   0.97   0.36  
M18070  100606_at  Prnp*  0.36   0.50   0.76   0.41  
Y11092  92473_at  Mknk2  0.35   0.45   0.74   0.22  
M18070  100606_at  Prnp*  0.36   0.50   0.76   0.41  
AI835630  96680_at  Dnajb9  0.34   0.48   1.33   0.35  
AI845732  101007_at  Mknk2  0.30   0.47   0.77   0.25  
L46651  102341_at  Gla  0.25   0.37   0.71   0.07  
M74495  98435_at  Adss1  0.21   0.32   0.65   0.27  
J03520  93981_at  Plat  0.19   0.37   0.96   0.31  
AB028272  96254_at  Dnajb1  0.09   0.25   0.76   0.10  
Differentiation/development       
L10385  96566_at  Tgm3*  47.62   1.20   2.87   2.83  
U10374  97926_s_at  Pparg*‡  44.91   1.72   4.92   0.39  
AJ001700  99494_at  Serpini1  14.00   3.66   3.33   2.26  
X16490  92978_s_at  Serpinb2  10.94   1.31   1.36   1.54  
Y12293  99846_at  Foxf2*  4.96   2.22   1.51   2.21  
X75129  97950_at  Xdh  4.14   2.49   2.31   3.82  
U36760  161049_at  Foxg1*†  2.80   3.17   1.36   2.19  
M35523  100127_at  Crabp2†  0.39   0.59   0.78   0.26  
V00756  160092_at  Ifrd1  0.35   0.47   1.12   0.33  
AA41985   9277_at  Cyr61†  0.34   1.09   1.02   0.81  
X13297  93100_at  Acta2†  0.34   0.47   0.84   0.37  
AF077861  93013_at  Idb2  0.32   0.39   1.05   0.46  
M60523  92614_at  Idb3*  0.25   0.39   1.14   0.36  
X51829  160463_at  Myd116‡  0.18   0.24   0.82   0.17  
AV138783
 		 161666_f_at
 		Gadd45b†*
 		 0.09
 		 0.22
 		 1.15
 		 0.06
 
GenBank accession no., by gene function
Fold change
Probe set
Gene symbol
C/EBPα
C/EBPβ
C/EBPδ
C/EBPϵ
Immune response       
M63695  103422_at  Cd1d1  53.47   3.05   7.36   2.42  
AW124547  96092_at  Hp*  28.05   2.72   3.76   1.85  
M27008  100436_at  Orm1†  14.20   1.03   3.25   1.23  
M83218  103448_at  S100a8  12.99   0.99   1.72   2.12  
M63697  101897_g_at  Cd1d2  11.76   1.63   2.65   2.27  
A1786089   93837_at  Kng  9.13   1.74   2.15   2.16  
K02782  95910_f_at  C3†  8.43   2.18   3.39   1.62  
X81627  160564_at  Lcn2†  5.84   0.75   1.16   3.82  
U27267  98772_at  Cxcl5‡  4.21   2.03   2.48   5.02  
M74123  94224_s_at  Ifi205‡  3.90   1.23   1.88   3.34  
X57349  X57349_M_at  Trfr  3.70   3.46   1.61   2.78  
M21050  100611_at  Lyzs†*  3.69   1.34   1.00   1.12  
M31419  98465_f_at  Ifi204*  3.07   1.03   1.50   2.51  
M32486  100477_at  M32486  3.06   1.15   1.30   2.74  
AB012693  103611_at  Cd47†  2.91   2.09   1.61   2.52  
X83601  92731_at  Ptx3  2.82   1.28   2.44   4.19  
L09737  102313_at  Gch  0.31   0.50   0.89   0.39  
X68273  103016_s_at  Cd68  0.25   0.50   0.91   0.36  
L39017  98018_at  Procr  0.16   0.29   0.90   0.15  
AJ242830  102948_at  Hemt1  0.08   0.19   0.86   0.07  
Cell proliferation       
AF099973  92472_f_at  Slfn2  8.85   2.48   2.12   6.82  
AF036893  93694_at  Per2*  4.85   1.73   1.75   11.40  
AF099977  92315_at  Slfn4  4.98   1.10   2.36   2.27  
Z22703  99435_at  Fgf7  4.28   1.59   2.46   4.75  
X72307  102898_at  Hgf*  4.07   1.17   0.86   1.31  
X53929  93534_at  Dcn  3.93   3.09   1.73   9.75  
A1834950   98507_at  Nr1d1*  0.31   0.44   0.69   0.31  
M64292  101583_at  Btg2  0.30   0.49   0.92   0.28  
X61940  104598_at  Dusp1*  0.27   0.44   0.98   0.28  
AV373612  161980_f_at  Bag3  0.25   0.38   0.74   0.25  
D14077  95286_at  Clu  0.24   0.41   0.75   0.31  
sX67083   101429_at  Ddit3*  0.22   0.42   0.93   0.22  
AA770736  161067_at  Ifld2*  0.20   0.36   0.93   0.07  
M17298  102298_at  Ngfb  0.16   0.49   0.65   0.16  
X54149  102779_at  Gadd45b*§  0.16   0.46   1.03   0.07  
U21673  99134_at  Tcte3  0.16   0.23   0.97   0.16  
L31958  100548_at  Pea15  0.11   0.46   1.09   0.28  
AF061972  103671_at  Htatip2  0.10   0.34   0.78   0.11  
V00727  160901_at  Fos*  0.08   0.20   1.12   0.06  
AF055638  101979_at  Gadd45g*‡§  0.05   0.19   0.94   0.04  
Metabolism       
AA726364  95611_at  Lp1  38.65   3.49   6.44   3.99  
Z48670  92913_at  Abcd2†  13.46   2.52   2.73   3.44  
AI849718  160111_at  elF1A  6.81   6.02   1.60   5.63  
AW048512  95426_at  Echs1  6.38   4.35   3.45   6.12  
AW049778  160770_at  Mvd  5.69   6.38   1.59   6.09  
U15977  94507_at  Facl2  5.40   1.22   1.39   1.48  
L16992  102302_at  Bckdhb  3.05   1.73   1.06   1.62  
X07888  99425_at  HMGCR  2.91   2.39   1.30   1.68  
AW106745  98631_g_at  Nsdh1  2.74   2.91   1.39   3.54  
AW122523  103665_at  Lce-pending   2.67   3.22   1.19   2.95  
AW047343  160841_at  Dbp  0.69   2.10   0.91   0.41  
X05862  93833_s_at  Hist1h2bc†  0.62   0.58   0.97   0.36  
M18070  100606_at  Prnp*  0.36   0.50   0.76   0.41  
Y11092  92473_at  Mknk2  0.35   0.45   0.74   0.22  
M18070  100606_at  Prnp*  0.36   0.50   0.76   0.41  
AI835630  96680_at  Dnajb9  0.34   0.48   1.33   0.35  
AI845732  101007_at  Mknk2  0.30   0.47   0.77   0.25  
L46651  102341_at  Gla  0.25   0.37   0.71   0.07  
M74495  98435_at  Adss1  0.21   0.32   0.65   0.27  
J03520  93981_at  Plat  0.19   0.37   0.96   0.31  
AB028272  96254_at  Dnajb1  0.09   0.25   0.76   0.10  
Differentiation/development       
L10385  96566_at  Tgm3*  47.62   1.20   2.87   2.83  
U10374  97926_s_at  Pparg*‡  44.91   1.72   4.92   0.39  
AJ001700  99494_at  Serpini1  14.00   3.66   3.33   2.26  
X16490  92978_s_at  Serpinb2  10.94   1.31   1.36   1.54  
Y12293  99846_at  Foxf2*  4.96   2.22   1.51   2.21  
X75129  97950_at  Xdh  4.14   2.49   2.31   3.82  
U36760  161049_at  Foxg1*†  2.80   3.17   1.36   2.19  
M35523  100127_at  Crabp2†  0.39   0.59   0.78   0.26  
V00756  160092_at  Ifrd1  0.35   0.47   1.12   0.33  
AA41985   9277_at  Cyr61†  0.34   1.09   1.02   0.81  
X13297  93100_at  Acta2†  0.34   0.47   0.84   0.37  
AF077861  93013_at  Idb2  0.32   0.39   1.05   0.46  
M60523  92614_at  Idb3*  0.25   0.39   1.14   0.36  
X51829  160463_at  Myd116‡  0.18   0.24   0.82   0.17  
AV138783
 		 161666_f_at
 		Gadd45b†*
 		 0.09
 		 0.22
 		 1.15
 		 0.06
 

Shown are the top 20 genes in each category. Mean fold changes were calculated using a simple division of the raw expression values between experimental sample and control.

*

Gene also involved in metabolism.

†

Gene also involved in cell proliferation.

‡

Gene also involved in immune response.

§

Gene also involved in differentiation/development.

View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal