Table 1.

Representative ddPCR analyses of NCF1 in gDNA from normal subjects and CGD patients and carriers

RowDiagnosis (a priori)No. of GTGT dropletsNo. of ΔGT dropletsGTGT/(GTGT + ΔGT)ΔGT/(GTGT + ΔGT)No. of NCF1/NCF1B/NCF1C dropletsNo. of TERT dropletsTotal NCF1/NCF1B/NCF1C copiesNo. of GTGT copiesNo. of ΔGT copiesGTGT copies/(GTGT + ΔGT)Predicted genotype
Normal 724 1416 0.34 0.66 271 92 5.9 2.0 3.9 2/6 — 
Normal 212 436 0.33 0.67 212 74 5.7 1.9 3.9 2/6 — 
Normal 362 358 0.50 0.50 201 70 5.7 2.8 2.8 3/6 — 
Normal 535 267 0.67 0.33 227 78 5.9 3.9 2.0 4/6 — 
Normal 555 1357 0.29 0.71 502 140 7.2 2.1 5.1 2/7 — 
p47phox CGD 1080 0.00 1.0 5290 1793 6.0 0.0 6.0 0/6 Homozygous ΔGT mutation 
p47phox CGD 2640 0.00 1.0 1921 637 6.0 0.0 6.0 0/6 Homozygous ΔGT mutation 
p47phox CGD 852 4340 0.16 0.84 862 268 6.4 1.1 5.4 1/6 Compound heterozygous for ΔGT and non-ΔGT mutations 
p47phox CGD 843 1731 0.33 0.67 127 42 6.0 2.0 4.1 2/6 Non-ΔGT mutation(s) 
10 Obligate p47phox carrier 429 2098 0.17 0.83 226 79 5.7 1.0 4.8 1/6 Heterozygous ΔGT mutation 
11 Obligate p47phox carrier 646 1144 0.36 0.64 215 70 6.1 2.2 3.9 2/6 Het non-ΔGT mutation 
RowDiagnosis (a priori)No. of GTGT dropletsNo. of ΔGT dropletsGTGT/(GTGT + ΔGT)ΔGT/(GTGT + ΔGT)No. of NCF1/NCF1B/NCF1C dropletsNo. of TERT dropletsTotal NCF1/NCF1B/NCF1C copiesNo. of GTGT copiesNo. of ΔGT copiesGTGT copies/(GTGT + ΔGT)Predicted genotype
Normal 724 1416 0.34 0.66 271 92 5.9 2.0 3.9 2/6 — 
Normal 212 436 0.33 0.67 212 74 5.7 1.9 3.9 2/6 — 
Normal 362 358 0.50 0.50 201 70 5.7 2.8 2.8 3/6 — 
Normal 535 267 0.67 0.33 227 78 5.9 3.9 2.0 4/6 — 
Normal 555 1357 0.29 0.71 502 140 7.2 2.1 5.1 2/7 — 
p47phox CGD 1080 0.00 1.0 5290 1793 6.0 0.0 6.0 0/6 Homozygous ΔGT mutation 
p47phox CGD 2640 0.00 1.0 1921 637 6.0 0.0 6.0 0/6 Homozygous ΔGT mutation 
p47phox CGD 852 4340 0.16 0.84 862 268 6.4 1.1 5.4 1/6 Compound heterozygous for ΔGT and non-ΔGT mutations 
p47phox CGD 843 1731 0.33 0.67 127 42 6.0 2.0 4.1 2/6 Non-ΔGT mutation(s) 
10 Obligate p47phox carrier 429 2098 0.17 0.83 226 79 5.7 1.0 4.8 1/6 Heterozygous ΔGT mutation 
11 Obligate p47phox carrier 646 1144 0.36 0.64 215 70 6.1 2.2 3.9 2/6 Het non-ΔGT mutation 
Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal