Table 6

Risk allele frequencies in each haplotype blocks

SNPs and risk allele
Frequency of risk alleles (%)
BlockGeneChromo-someSNP IDPositionRisk allele0123456
CSF3 17 rs25645 35426669 46* 54* 119 90 43   
   rs1042658 35427428 (13.1) (15.3) (33.8) (25.6) (12.2)   
VEGFA rs699947 43844367 43* 41* 29* 100 61 1 77 
   rs833061 43845464 (12.2) (11.6) (8.2) (28.4) (17.3) (0.3) (21.9) 
   rs2010963 43846328        
BCL2 18 rs1801018 59136859 59* 32* 144 41 76   
   rs2279115 59137817 (16.8) (9.1) (40.9) (11.6) (21.6)   
FAS 10 rs2234767 90739236 2* 4* 145 159 42   
   rs1800682 90739943 (0.6) (1.1) (41.2) (45.2) (11.9)   
13 CASP10 rs13010627 201782343 104* 4* 141 28 54 19 2 
   rs13006529 201790704 (29.5) (1.1) (40.1) (8.0) (15.3) (5.4) (0.6) 
   rs3834129 201805777        
SNPs and risk allele
Frequency of risk alleles (%)
BlockGeneChromo-someSNP IDPositionRisk allele0123456
CSF3 17 rs25645 35426669 46* 54* 119 90 43   
   rs1042658 35427428 (13.1) (15.3) (33.8) (25.6) (12.2)   
VEGFA rs699947 43844367 43* 41* 29* 100 61 1 77 
   rs833061 43845464 (12.2) (11.6) (8.2) (28.4) (17.3) (0.3) (21.9) 
   rs2010963 43846328        
BCL2 18 rs1801018 59136859 59* 32* 144 41 76   
   rs2279115 59137817 (16.8) (9.1) (40.9) (11.6) (21.6)   
FAS 10 rs2234767 90739236 2* 4* 145 159 42   
   rs1800682 90739943 (0.6) (1.1) (41.2) (45.2) (11.9)   
13 CASP10 rs13010627 201782343 104* 4* 141 28 54 19 2 
   rs13006529 201790704 (29.5) (1.1) (40.1) (8.0) (15.3) (5.4) (0.6) 
   rs3834129 201805777        

Frequencies are categorized into 3 groups:

*

indicates low-risk or reference group;

, intermediate-risk group; and

, high-risk group.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal