Table 2

Selected significantly modified GO categories in adult and hyperplastic thymus

GO IDNCD
I. Adult/NB BP 
    1. RNA metabolism 16070 59 ↓ ↓ 
    2. Morphogenesis 9653 263 ↓ ↓ 
    3. RNA splicing 8380 17 ↓ ↓ 
    4. Cell-cell signaling 7267 134 ↓ ↓ 
    5. Development 7275 359 ↓ ↓ 
    6. DNA replication and chromosome cycle* 67 42 ↓ — 
    7. Cell adhesion* 7155 137 ↓ — 
    8. Cell proliferation* 8283 247 ↓ — 
II. ML/NB BP 
    1. Transcription 6350 374 ↑ — 
    2. Protein modification 6464 261 ↑ — 
    3. Transport 6810 372 ↑ — 
    4. Signal transduction 7165 519 ↑ — 
    5. Physiologic process 7582 1942 ↑ — 
    6. Cellular process 9987 1245 ↑ — 
    7. Regulation of programmed cell death 43067 54 ↑ — 
    8. Morphogenesis 9653 263 ↑ — 
    9. Cell homeostasis 19725 18 ↑ — 
    10. Cell differentiation 30154 44 ↑ — 
    11. Lymphocyte differentiation 30098 15 ↑ — 
    12. Development 7275 359 ↑ ↓ 
    13. Regulation of transcription from RNA polymerase II promoter 6357 45 — ↑ 
    14. Response to wounding* 9611 89 — ↓ 
    15. M phase 279 33 ↓ — 
    16. Nuclear division 280 30 ↓ — 
    17. DNA metabolism 6259 88 ↓ — 
    18. Response to stress 6950 220 ↓ — 
    19. Protein biosynthesis 6412 78 — ↓ 
    20. Protein metabolism 19538 514 ↑ — 
    21. Cell differentiation 30154 44 ↑ — 
    22. Maintenance of fidelity during DNA-dependent DNA* 45005 2 ↑ — 
III. ML/NB MF 
    1. DNA binding 3677 388 ↑ — 
    2. Transcription factor activity 3700 159 ↑ — 
    3. Transporter activity 5215 367 ↑ — 
    4. Binding 5488 1364 ↑ — 
    5. Acyltransferase activity 8415 24 ↑ — 
IV. MH/NB BP 
    1. DNA replication and chromosome cycle* 67 42 ↓ — 
    2. RNA metabolism 16070 59 ↓ — 
    3. Regulation of cell differentiation 45595 7 ↓ — 
    4. Regulation of T-cell differentiation 45580 4 ↓ — 
    5. Cell differentiation 30154 44 ↓ — 
    6. RNA metabolism 16070 59 ↓ — 
    7. Regulation of development 50793 19 ↓ — 
V. MH/NB MF 
    1. Signal transducer activity 4871 486 ↑ — 
    2. Oxidoreductase activity 16491 119 ↓ — 
GO IDNCD
I. Adult/NB BP 
    1. RNA metabolism 16070 59 ↓ ↓ 
    2. Morphogenesis 9653 263 ↓ ↓ 
    3. RNA splicing 8380 17 ↓ ↓ 
    4. Cell-cell signaling 7267 134 ↓ ↓ 
    5. Development 7275 359 ↓ ↓ 
    6. DNA replication and chromosome cycle* 67 42 ↓ — 
    7. Cell adhesion* 7155 137 ↓ — 
    8. Cell proliferation* 8283 247 ↓ — 
II. ML/NB BP 
    1. Transcription 6350 374 ↑ — 
    2. Protein modification 6464 261 ↑ — 
    3. Transport 6810 372 ↑ — 
    4. Signal transduction 7165 519 ↑ — 
    5. Physiologic process 7582 1942 ↑ — 
    6. Cellular process 9987 1245 ↑ — 
    7. Regulation of programmed cell death 43067 54 ↑ — 
    8. Morphogenesis 9653 263 ↑ — 
    9. Cell homeostasis 19725 18 ↑ — 
    10. Cell differentiation 30154 44 ↑ — 
    11. Lymphocyte differentiation 30098 15 ↑ — 
    12. Development 7275 359 ↑ ↓ 
    13. Regulation of transcription from RNA polymerase II promoter 6357 45 — ↑ 
    14. Response to wounding* 9611 89 — ↓ 
    15. M phase 279 33 ↓ — 
    16. Nuclear division 280 30 ↓ — 
    17. DNA metabolism 6259 88 ↓ — 
    18. Response to stress 6950 220 ↓ — 
    19. Protein biosynthesis 6412 78 — ↓ 
    20. Protein metabolism 19538 514 ↑ — 
    21. Cell differentiation 30154 44 ↑ — 
    22. Maintenance of fidelity during DNA-dependent DNA* 45005 2 ↑ — 
III. ML/NB MF 
    1. DNA binding 3677 388 ↑ — 
    2. Transcription factor activity 3700 159 ↑ — 
    3. Transporter activity 5215 367 ↑ — 
    4. Binding 5488 1364 ↑ — 
    5. Acyltransferase activity 8415 24 ↑ — 
IV. MH/NB BP 
    1. DNA replication and chromosome cycle* 67 42 ↓ — 
    2. RNA metabolism 16070 59 ↓ — 
    3. Regulation of cell differentiation 45595 7 ↓ — 
    4. Regulation of T-cell differentiation 45580 4 ↓ — 
    5. Cell differentiation 30154 44 ↓ — 
    6. RNA metabolism 16070 59 ↓ — 
    7. Regulation of development 50793 19 ↓ — 
V. MH/NB MF 
    1. Signal transducer activity 4871 486 ↑ — 
    2. Oxidoreductase activity 16491 119 ↓ — 

Shown are selected, MG-relevant identified GO categories. Expression changes were identified in adult or hyperplastic thymus (MH and ML) compared with newborns; transcript numbers (N) and the direction of changes (decrease: downward arrows; increase: upward arrows) are marked for the continuous (C) or discrete (D) analyses. A category is considered as changed if one of the statistical tests used indicated significant (P < .05) results. Note increases in signal transduction-related mechanisms, morphogenesis, cell differentiation, and specifically in lymphocyte differentiation in the thymus of MG patients compared with healthy adults.

—

indicates no change.

*

AChE-related categories.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal