Table 1

Genetic variants of miRNA genes in AML1

miRNA geneChrPositionRefVarSequence Reads
Location
RefVar
hsa-mir-1231 200044313 69 54 pri-miRNA 
hsa-mir-663b 132731072 59 77 pri-miRNA 
hsa-mir-663b 132731082 56 77 pri-miRNA 
hsa-mir-663b 132731148 94 73 pri-miRNA 
hsa-mir-663b 132731173 94 81 pri-miRNA 
hsa-mir-663b 132731191 92 81 pri-miRNA 
hsa-mir-569 172307120 66 50 pri-miRNA 
hsa-mir-1324 75762663 132 94 1 nucleotide 5′ of mature miRNA 
hsa-mir-1324 75762700 122 105 1 nucleotide 3′ of mature miRNA 
hsa-mir-585 168623242 106 138 pri-miRNA 
hsa-mir-597 9636492 18 27 pri-miRNA 
hsa-mir-620 12 115070799-115070804 ATATAT deletion 50 94 pri-miRNA 
hsa-mir-1283-2 19 58953361 131 107 miRNA star 
hsa-mir-133a-2 20 60572673 124 109 pri-miRNA 
miRNA geneChrPositionRefVarSequence Reads
Location
RefVar
hsa-mir-1231 200044313 69 54 pri-miRNA 
hsa-mir-663b 132731072 59 77 pri-miRNA 
hsa-mir-663b 132731082 56 77 pri-miRNA 
hsa-mir-663b 132731148 94 73 pri-miRNA 
hsa-mir-663b 132731173 94 81 pri-miRNA 
hsa-mir-663b 132731191 92 81 pri-miRNA 
hsa-mir-569 172307120 66 50 pri-miRNA 
hsa-mir-1324 75762663 132 94 1 nucleotide 5′ of mature miRNA 
hsa-mir-1324 75762700 122 105 1 nucleotide 3′ of mature miRNA 
hsa-mir-585 168623242 106 138 pri-miRNA 
hsa-mir-597 9636492 18 27 pri-miRNA 
hsa-mir-620 12 115070799-115070804 ATATAT deletion 50 94 pri-miRNA 
hsa-mir-1283-2 19 58953361 131 107 miRNA star 
hsa-mir-133a-2 20 60572673 124 109 pri-miRNA 

The number of sequence reads supporting the reference and variant alleles in the AML1 (and skin) genomes is shown.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal