Table 1

circRNA read support for structures and their frequency in all samples

circRNA readsBladderLiverSkinMuscleKidneyBreastProstateBrainHeartOvaryLungColonK562_1GM12878_1K562_2GM12878_2Fibroblasts_U1Fibroblasts_U2H9_DFibroblasts_D1Fibroblasts_D2Platelet_FPlatelet_M2Platelet_M1RBCs
>10 55 308 164 136 196 186 71 670 235 263 521 190 11 125 141 227 2797 3052 7281 9605 8459 1272 
>100 11 19 200 224 1197 1686 1325 96 
>1000 83 147 95 
K/M 66 295 170 69 104 126 59 447 148 125 172 84 45 36 427 546 464 8469 11 138 7579 597 
circRNA readsBladderLiverSkinMuscleKidneyBreastProstateBrainHeartOvaryLungColonK562_1GM12878_1K562_2GM12878_2Fibroblasts_U1Fibroblasts_U2H9_DFibroblasts_D1Fibroblasts_D2Platelet_FPlatelet_M2Platelet_M1RBCs
>10 55 308 164 136 196 186 71 670 235 263 521 190 11 125 141 227 2797 3052 7281 9605 8459 1272 
>100 11 19 200 224 1197 1686 1325 96 
>1000 83 147 95 
K/M 66 295 170 69 104 126 59 447 148 125 172 84 45 36 427 546 464 8469 11 138 7579 597 

For each sample, the number of distinct circRNA structures supported by >10, 100, and 1000 circRNA (back-splice) reads are shown, together with the number of circRNA reads per million reads (K/M).

D, digested with RNAse R; U, undigested, matched sample.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal