Table 1

Clinical and molecular characteristics of the 25 PACE CP-CML patients harboring compound mutations at baseline

Pt IDAchieved primary end pointTime on study (d)Prior TKI*Baseline SSBaseline NGSBest responseTime to response (d)Response duration (d)PADD (mg)Reason discontinuedPostbaseline SS
Mutation%Mutation%Mutation%Time
191 I D N V379I 100 V379I 90 None N/A N/A 45 Adverse event V379I 100 EOT 
V379I/H396P 
V379I/E459K 
264 11 I D H396R 100 H396R 88 None N/A N/A 45 Progressive disease Not evaluable (o postbaseline sample) 
H396R/V299L 
49 27 I N D F359C 100 F359C/T315I 76 None N/A N/A 45 Progressive disease Not evaluable (no postbaseline sample) 
T315I 90 F359C 12 
  F359C/V299L 
263 226 I D N F359V 90 F359V 82 None N/A N/A 35 Progressive disease T315I 100 EOT 
T315I 
F359V/E255K 
149 245 I D F359C 100 F359C/F317L 73 None N/A N/A 31 Adverse event F359C 100 EOT 
F317L 80 F359C/T315I 21 
T315I 40 F359C 
249 840+ I D N Y253H 100 Y253H 94 None N/A N/A 13 Ongoing Y253H 10 1 y 
G250E/F317L 
242 N§ 924+ I D N T315I 50 T315I/F317L 34 CCyR 506 417+ 43 Ongoing Not evaluable (no amplification)†† 1 y 
F317L 40 T315I 
35 N 1007+ I D N F317L 100 F317L/H396R 75 MMR 259 664+ 26 Ongoing Not evaluable (no amplification)†† 1y 
H396R 80 F317L/E279K 20 
E279K 10 F317L/E281K 
  F317L 
125 1014+ I D N V299L 100 H396R/V299L 97 None N/A N/A 27 Ongoing No mutation detected 1 y 
H396R 100 
262 224 I N D V299L 100 F359V/V299L 97 CCyR 83 1# 26 Progressive disease Y253H 100 EOT 
F359V 100 F359V 100 
247 298 I (D N) B G250E 20 G250E 27 CCyR 175 78 43 Death Not evaluable (no amplification)†† 
G250E/E279V 
115 594 T315I 100 T315I 95 MMR 167 433 45 Adverse event Not evaluable (no amplification)†† 
T315I/I432M 
T315I/R386M 
83 848 I D N F317L 100 F317L/E459K 95 MMR 583 82 32 Withdrawal Not evaluable (no amplification)†† 
E459K 100 F317L 
101 875 I D T315I 100 T315I 93 CCyR 168 587 29 Adverse event Not evaluable (no amplification)†† 
T315I/E275D 
7 903 I N D F317L 100 F317L/E450G 92 PCyR 252 170 Withdrawal F317L/ E450G 10 EOT 
E450G 90 F359V 
185 928+ I D N   F359I 84 MMR 524 322+ 43 Ongoing N/A** 
F359I 90 F359I/T277I 
G250E 10 G250E 
  E507G 
228 937+ I D V299L 100 V299L 95 MMR 55 785+ 44 Ongoing N/A** 
V299L/P310L 
76 944+ I (D N) B M244V 100 M244V 89 MMR 85 841+ 16 Ongoing N/A** 
F359V 
M244V/G250W 
234 951+ I D N F359V 100 F359V 91 MMR 336 576+ 28 Ongoing N/A** 
F359V/M244V 
113 953+ I D N F317L 100 F317L/E459K 99 MMR 87 845+ 45 Ongoing N/A** 
E459K 100 
112 967+ T315I 100 T315I 92 MMR 81 842+ 44 Ongoing N/A** 
C475W 
T315I/K262N 
89 992+ I N B   F359V 60 MMR 84 832+ 31 Ongoing N/A** 
F359V 90 T315I 29 
T315I 20 F359V/M237R 
  F359V/R362T 
36 1012+ I N F317L 100 E459K/F317L 98 MMR 168 762+ 42 Ongoing N/A** 
E459K 100 
159 1055+ (D N) I T315I 100 T315I 65 MMR 249 759+ 16 Ongoing N/A** 
T315I/M237V 
10 1119+ I N Y253H 100 Y253H 96 MMR 83 1016+ 18 Ongoing N/A** 
Y253H/A287V 
Y253H/E282D 
Y456C 
Pt IDAchieved primary end pointTime on study (d)Prior TKI*Baseline SSBaseline NGSBest responseTime to response (d)Response duration (d)PADD (mg)Reason discontinuedPostbaseline SS
Mutation%Mutation%Mutation%Time
191 I D N V379I 100 V379I 90 None N/A N/A 45 Adverse event V379I 100 EOT 
V379I/H396P 
V379I/E459K 
264 11 I D H396R 100 H396R 88 None N/A N/A 45 Progressive disease Not evaluable (o postbaseline sample) 
H396R/V299L 
49 27 I N D F359C 100 F359C/T315I 76 None N/A N/A 45 Progressive disease Not evaluable (no postbaseline sample) 
T315I 90 F359C 12 
  F359C/V299L 
263 226 I D N F359V 90 F359V 82 None N/A N/A 35 Progressive disease T315I 100 EOT 
T315I 
F359V/E255K 
149 245 I D F359C 100 F359C/F317L 73 None N/A N/A 31 Adverse event F359C 100 EOT 
F317L 80 F359C/T315I 21 
T315I 40 F359C 
249 840+ I D N Y253H 100 Y253H 94 None N/A N/A 13 Ongoing Y253H 10 1 y 
G250E/F317L 
242 N§ 924+ I D N T315I 50 T315I/F317L 34 CCyR 506 417+ 43 Ongoing Not evaluable (no amplification)†† 1 y 
F317L 40 T315I 
35 N 1007+ I D N F317L 100 F317L/H396R 75 MMR 259 664+ 26 Ongoing Not evaluable (no amplification)†† 1y 
H396R 80 F317L/E279K 20 
E279K 10 F317L/E281K 
  F317L 
125 1014+ I D N V299L 100 H396R/V299L 97 None N/A N/A 27 Ongoing No mutation detected 1 y 
H396R 100 
262 224 I N D V299L 100 F359V/V299L 97 CCyR 83 1# 26 Progressive disease Y253H 100 EOT 
F359V 100 F359V 100 
247 298 I (D N) B G250E 20 G250E 27 CCyR 175 78 43 Death Not evaluable (no amplification)†† 
G250E/E279V 
115 594 T315I 100 T315I 95 MMR 167 433 45 Adverse event Not evaluable (no amplification)†† 
T315I/I432M 
T315I/R386M 
83 848 I D N F317L 100 F317L/E459K 95 MMR 583 82 32 Withdrawal Not evaluable (no amplification)†† 
E459K 100 F317L 
101 875 I D T315I 100 T315I 93 CCyR 168 587 29 Adverse event Not evaluable (no amplification)†† 
T315I/E275D 
7 903 I N D F317L 100 F317L/E450G 92 PCyR 252 170 Withdrawal F317L/ E450G 10 EOT 
E450G 90 F359V 
185 928+ I D N   F359I 84 MMR 524 322+ 43 Ongoing N/A** 
F359I 90 F359I/T277I 
G250E 10 G250E 
  E507G 
228 937+ I D V299L 100 V299L 95 MMR 55 785+ 44 Ongoing N/A** 
V299L/P310L 
76 944+ I (D N) B M244V 100 M244V 89 MMR 85 841+ 16 Ongoing N/A** 
F359V 
M244V/G250W 
234 951+ I D N F359V 100 F359V 91 MMR 336 576+ 28 Ongoing N/A** 
F359V/M244V 
113 953+ I D N F317L 100 F317L/E459K 99 MMR 87 845+ 45 Ongoing N/A** 
E459K 100 
112 967+ T315I 100 T315I 92 MMR 81 842+ 44 Ongoing N/A** 
C475W 
T315I/K262N 
89 992+ I N B   F359V 60 MMR 84 832+ 31 Ongoing N/A** 
F359V 90 T315I 29 
T315I 20 F359V/M237R 
  F359V/R362T 
36 1012+ I N F317L 100 E459K/F317L 98 MMR 168 762+ 42 Ongoing N/A** 
E459K 100 
159 1055+ (D N) I T315I 100 T315I 65 MMR 249 759+ 16 Ongoing N/A** 
T315I/M237V 
10 1119+ I N Y253H 100 Y253H 96 MMR 83 1016+ 18 Ongoing N/A** 
Y253H/A287V 
Y253H/E282D 
Y456C 

B, bosutinib; CCyR, complete cytogenetic response; D, dasatinib; EOT, end of treatment; I, imatinib; MMR, major molecular response; N, nilotinib; N/A, not applicable; PADD, ponatinib average daily dose; PCyR, partial cytogenetic response; Pt, patient; TKI, tyrosine kinase inhibitor.

Patients who did not achieve the primary end point are listed first, with each subgroup then arranged by time on study. Bold font denotes exact or alternate (also underlined) substitutions at amino acids previously associated with TKI resistance; nonbolded font denotes substitutions at amino acids not previously associated with TKI resistance.

*

The order of TKIs from left to right indicates the sequence of TKI treatment in the patient’s history (first to last); parentheses indicate that the treatment order is unknown.

The percentage indicates the mutation allele frequency in the patient sample.

Best response does not include hematologic response.

§

Cytogenetic response for this patient was only assessed at 9 months (no MCyR) and 18 months (CCyR).

In this patient, MMR was achieved at 9 months; however, cytogenetic response was not assessed between months 3 and 12; SS was conducted at 1 year and no amplification of the transcript was achieved.

Patients with atypical transcripts in whom molecular response could not be assessed.

#

1-day duration indicates patient had one assessment at which criteria for response were met and no further evaluable cytogenetic assessments.

**

Postbaseline mutation status was not evaluated for patients who achieved and remain on study in continuous MCyR.

††

Patients are in CCyR and/or <1% BCR-ABL1 transcript levels at the time of sample analysis.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal