Table 2

Genes with an MC-restricted expression pattern newly identified by FANTOM5

GeneMC ex vivo*MC culturedCultured + stimulated(Next) Primary sample§Mean all||
D2D3D4D1D8D5D1D8D5
MRGPRX2 1059 938 949 32 220 21 146 4 (fetal skin) 0.1 
RGS13 942 1090 902 385 747 604 620 472 1636 89 (appendix) 
C1orf150 1231 822 1059 1680 482 1256 6440 1949 2779 313 (basophil) 
SIGLEC6 673 518 1190 1887 1634 1614 360 1166 1422 265 (placenta) 
ERVFRD-1 65 89 75 734 176 315 1745 463 916 355 (retinal pigment epithelial cell), 132 (placenta) 
SVOPL 31 52 40 173 105 217 104 93 113 18 (CD34+ HPC) 0.6 
C20orf118 46 80 69 100 27 172 19 22 107 46 (small intestine) 0.4 
VWA5A 1400 1180 1308 1646 1469 1908 453 749 2079 257 (amniotic membrane) 14 
GeneMC ex vivo*MC culturedCultured + stimulated(Next) Primary sample§Mean all||
D2D3D4D1D8D5D1D8D5
MRGPRX2 1059 938 949 32 220 21 146 4 (fetal skin) 0.1 
RGS13 942 1090 902 385 747 604 620 472 1636 89 (appendix) 
C1orf150 1231 822 1059 1680 482 1256 6440 1949 2779 313 (basophil) 
SIGLEC6 673 518 1190 1887 1634 1614 360 1166 1422 265 (placenta) 
ERVFRD-1 65 89 75 734 176 315 1745 463 916 355 (retinal pigment epithelial cell), 132 (placenta) 
SVOPL 31 52 40 173 105 217 104 93 113 18 (CD34+ HPC) 0.6 
C20orf118 46 80 69 100 27 172 19 22 107 46 (small intestine) 0.4 
VWA5A 1400 1180 1308 1646 1469 1908 453 749 2079 257 (amniotic membrane) 14 

Gene ranking by fold change = mean (MCs)*,, / mean (all)||.

D, donor; HPC, hematopoietic progenitor cell.

*

Donor 2/donor 3/donor 4 (directly upon isolation from skin).

Donor 1/donor 8/donor 5 (MCs expanded in culture for 4-5 weeks).

Donor 1 stimulated for 2.5 hours/donor 8 stimulated for 5 hours/donor 5 stimulated for 16 hours.

§

Nontransformed cell/tissue sample with (second) highest expression of the gene.

||

Mean expression of all non-MC FANTOM5 samples. The values are given in (rounded) tags per million tags; if <1, 1 decimal place is given.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal