Table 5

CNAs containing miRNA genes not identified by routine cytogenetics

UPNAML DiagnosisChrBreakpoint startBreakpoint endCallCNA (bp)miRNA genes in the CNA
327733 De novo 16 30 514 514 31 420 587 d 906 073 4519, 762 
113971 De novo 2 24 395 064 25 807 518 d 1 412 454 1301 
869586 De novo 17 26 063 968 27 437 770 d 1 373 802 4733, 4724, 193a, 4725, 365b 
906708 De novo 9 81 151 141 87 703 853 d 6 552 712 7-1 
169510 Secondary 6 118 096 26 790 111 d 26 672 015 6720, 4645, 3691, 5683, 5689, 4639, 548a-1 
169510 Secondary 6 26 790 111 48 691 459 a 21 901 348 3143, 877, 4640, 4646, 1236, 6721, 3135b, 219-1, 5004, 3934, 1275, 5690, 3925, 4462, 4641, 4647, 4642, 586 
182896 Secondary 12 2 128 232 78 142 425 a 76 014 193 31 miRNAs 
182896 Secondary 12 79 457 892 87 807 120 a 8 349 228 617, 618, 4699 
182896 Secondary 12 95 700 444 121 346 369 a 25 645 925 1251, 135a-2, 4495, 4303, 1827, 3652, 3922, 4496, 619, 4497, 3657, 1302-1,620, 4472-2, 1178, 4498, 4700 
182896 Secondary 12 121 996 058 123 901 827 d 1 905 769 4304, 3908 
182896 Secondary 17 25 505 826 27 326 775 d 1 820 949 4733, 4724, 193a, 4725, 365b 
182896 Secondary 21 13 395 102 33 441 194 a 20 046 092 3156-3, 3118-5, 99a, 7c, 125b-2, 548x, 6130, 155, 4759, 4327 
182896 Secondary 21 36 524 064 46 921 386 a 10 397 322 6508, 4760, 3197, 5692b, 6070 
182896 Secondary Y 0 57 427 648 a 57 427 648 3690-2, 6089-2 
610184 Secondary 2 2 784 13 404 817 d 13 402 033 4261, 4429, 548s, 4262, 3681, 3125 
610184 Secondary 2 27 745 709 30 891 590 d 3 145 881 4263 
610184 Secondary 7 1 273 675 2 400 101 a 1 126 426 4655 
610184 Secondary 17 526 5 781 507 d 5 780 981 3183, 22, 132, 212, 1253 
838538 Secondary 1 61 736 225 115 792 a 225 054 056 121 miRNAs 
838538 Secondary 17 527 51 162 464 d 51 161 937 53 miRNAs 
838538 Secondary 17 51 162 465 78 643 088 a 27 480 623 33 miRNAs 
891669 Secondary 17 26 117 586 27 302 527 d 1 184 941 4733, 4724, 193a, 4725, 365b 
180365 Therapy-related 2 123 372 048 132 969 208 d 9 597 160 663b, 4783, 4784 
180365 Therapy-related 5 121 883 092 138 624 717 d 16 741 625 4633, 4460, 3936, 1289-2, 3661, 4461, 5692c-1, 874 
189941 Therapy-related 3 169 461 120 170 271 699 d 1 513 091 551b 
189941 Therapy-related 3 171 702 102 173 816 191 d 2 114 089 569 
189941 Therapy-related 12 11 708 326 22 796 431 d 11 088 105 1244-2, 613, 614, 3974 
317821 Therapy-related 1 120 308 171 220 764 934 a 100 456 763 3118-1, 3118-2, 3118-3, 6077-1, 5087, 6077-2, 4257, 554, 5698, 190b, 4258, 92b, 555, 9-1, 9-5b, 765, 4259, 5187, 4654, 556, 3658, 921, 1255b-2, 557, 3119-1, 3119-2, 1295, 214, 3120, 199a-2, 488, 4424, 3121, 4426, 1278, 4735, 181b-1, 181a-1, 5191, 1231, 135b, 29c, 29b-2, 205, 4260, 3122, 215, 194-1, 664 
317821 Therapy-related 3 144 186 839 199 381 715 a 55 194 876 5186, 3919, 15b, 16-2, 1263, 551b, 569, 4789, 4448, 1224, 5588, 548aq, 1248, 28, 944, 3137, 570, 4797, 922 
377512 Therapy-related 2 236 856 627 241 034 230 d 4 177 603 4440, 4441, 4269, 2467, 4786 
377512 Therapy-related 15 18 422 770 22 846 333 d 4 423 563 3118-4, 5701-1, 3118-6, 5701-2, 1268a, 4509-1, 4508 
482711 Therapy-related 6 73 561 217 77 720 182 a 4 158 965 4282, 4463 
482711 Therapy-related 19 7 917 000 8 565 000 a 648 000 4999 
482711 Therapy-related 19 9 458 030 12 415 444 a 2 957 414 5589, 4322, 1181, 1238, 638, 4748, 199a-1 
482711 Therapy-related 19 13 331 909 19 078 761 a 5 746 852 24-2, 27a, 23a, 181c, 181d, 639, 1470, 3188, 3189 
530447 Therapy-related 9 28 278 165 29 708 951 d 1 430 786 876, 873 
557772 Therapy-related 21 9 892 286 46 915 712 a 37 023 426 3156-3, 3118-5, 99a, let-7c, 125b-2, 548x, 6130, 155, 4759, 4327, 6501, 802, 6508, 4760, 3197, 5692b, 6070 
706395 Therapy-related 10 42 100 384 57 162 870 d 15 062 486 5100, 3156-1, 4294, 605, 548f-1 
811184 Therapy-related 1 188 612 922 247 171 197 a 58 558 275 4426, 1278, 4735, 181b-1, 181a-1, 5191, 1231, 135b, 29c, 29b-2, 205, 4260, 3122, 215, 194-1, 664, 320b, 4742, 5008, 3620, 4666a, 1182, 4427, 4671, 4753, 1537, 4428, 3123, 4677, 3916, 3124 
811184 Therapy-related 12 33 393 16 168 160 d 16 134 767 3649, 200c, 141, 1244-3, 613, 614 
811184 Therapy-related 13 40 292 732 71 225 257 d 30 932 525 3168, 5006, 3613, 16-1, 15a, 5693, 4703, 759, 1297, 5007, 3169, 548x, 4704 
811184 Therapy-related 17 42 399 786 78 637 123 a 36 237 337 5089, 152, 1203, 10a, 196a-1, 3185, 6129, 6165, 3614, 142, 4736, 454, 301a, 4729, 21, 4737, 633, 3064, 5047, 6080, 4315-2, 634, 548d-2, 635, 4524a, 3615, 3678, 4738, 636, 4316, 4739, 1268b, 4730, 657, 3065, 338, 1250, 4740, 3186, 4525 
856024 Therapy-related 1 120 321 638 247 171 198 a 126 849 560 3118-1, 3118-2, 3118-3, 6077-1, 5087, 6077-2, 4257, 554, 5698, 190b, 4258, 92b, 555, 9-1, 9-5b, 765, 4259, 5187, 4654, 556, 3658, 921, 1255b-2, 557, 3119-1, 3119-2, 1295, 214, 3120, 199a-2, 488, 4424, 3121, 4426, 1278, 4735, 181b-1, 181a-1, 5191, 1231, 135b, 29c, 29b-2, 205, 4260, 3122, 215, 194-1, 664, 320b, 4742, 5008, 3620, 4666a, 1182, 4427, 4671, 4753, 1537, 4428, 3123, 4677, 3916, 3124 
856024 Therapy-related 12 33 393 17 253 192 d 17 219 799 200c, 141, 1244-3, 613, 614 
856024 Therapy-related 12 120 756 138 132 283 286 d 11 527 148 4304, 3908, 5188, 4419b, 3612 
856024 Therapy-related 17 44 017 170 78 637 124 a 34 619 954 196a-1, 3185, 6129, 6165, 3614, 142, 4736, 454, 301a, 4729, 21, 4737, 633, 3064, 5047, 6080, 4315-2, 634, 548d-2, 635, 4524a, 3615, 3678, 4738, 636, 4316, 4739, 1268b, 4730, 657, 3065, 338, 1250, 4740, 3186, 4525 
864484 Therapy-related 14 53 281 577 57 637 143 d 4 355 566 5580, 4308 
864484 Therapy-related X 64 736 865 65 165 635 d 428 770 223 
UPNAML DiagnosisChrBreakpoint startBreakpoint endCallCNA (bp)miRNA genes in the CNA
327733 De novo 16 30 514 514 31 420 587 d 906 073 4519, 762 
113971 De novo 2 24 395 064 25 807 518 d 1 412 454 1301 
869586 De novo 17 26 063 968 27 437 770 d 1 373 802 4733, 4724, 193a, 4725, 365b 
906708 De novo 9 81 151 141 87 703 853 d 6 552 712 7-1 
169510 Secondary 6 118 096 26 790 111 d 26 672 015 6720, 4645, 3691, 5683, 5689, 4639, 548a-1 
169510 Secondary 6 26 790 111 48 691 459 a 21 901 348 3143, 877, 4640, 4646, 1236, 6721, 3135b, 219-1, 5004, 3934, 1275, 5690, 3925, 4462, 4641, 4647, 4642, 586 
182896 Secondary 12 2 128 232 78 142 425 a 76 014 193 31 miRNAs 
182896 Secondary 12 79 457 892 87 807 120 a 8 349 228 617, 618, 4699 
182896 Secondary 12 95 700 444 121 346 369 a 25 645 925 1251, 135a-2, 4495, 4303, 1827, 3652, 3922, 4496, 619, 4497, 3657, 1302-1,620, 4472-2, 1178, 4498, 4700 
182896 Secondary 12 121 996 058 123 901 827 d 1 905 769 4304, 3908 
182896 Secondary 17 25 505 826 27 326 775 d 1 820 949 4733, 4724, 193a, 4725, 365b 
182896 Secondary 21 13 395 102 33 441 194 a 20 046 092 3156-3, 3118-5, 99a, 7c, 125b-2, 548x, 6130, 155, 4759, 4327 
182896 Secondary 21 36 524 064 46 921 386 a 10 397 322 6508, 4760, 3197, 5692b, 6070 
182896 Secondary Y 0 57 427 648 a 57 427 648 3690-2, 6089-2 
610184 Secondary 2 2 784 13 404 817 d 13 402 033 4261, 4429, 548s, 4262, 3681, 3125 
610184 Secondary 2 27 745 709 30 891 590 d 3 145 881 4263 
610184 Secondary 7 1 273 675 2 400 101 a 1 126 426 4655 
610184 Secondary 17 526 5 781 507 d 5 780 981 3183, 22, 132, 212, 1253 
838538 Secondary 1 61 736 225 115 792 a 225 054 056 121 miRNAs 
838538 Secondary 17 527 51 162 464 d 51 161 937 53 miRNAs 
838538 Secondary 17 51 162 465 78 643 088 a 27 480 623 33 miRNAs 
891669 Secondary 17 26 117 586 27 302 527 d 1 184 941 4733, 4724, 193a, 4725, 365b 
180365 Therapy-related 2 123 372 048 132 969 208 d 9 597 160 663b, 4783, 4784 
180365 Therapy-related 5 121 883 092 138 624 717 d 16 741 625 4633, 4460, 3936, 1289-2, 3661, 4461, 5692c-1, 874 
189941 Therapy-related 3 169 461 120 170 271 699 d 1 513 091 551b 
189941 Therapy-related 3 171 702 102 173 816 191 d 2 114 089 569 
189941 Therapy-related 12 11 708 326 22 796 431 d 11 088 105 1244-2, 613, 614, 3974 
317821 Therapy-related 1 120 308 171 220 764 934 a 100 456 763 3118-1, 3118-2, 3118-3, 6077-1, 5087, 6077-2, 4257, 554, 5698, 190b, 4258, 92b, 555, 9-1, 9-5b, 765, 4259, 5187, 4654, 556, 3658, 921, 1255b-2, 557, 3119-1, 3119-2, 1295, 214, 3120, 199a-2, 488, 4424, 3121, 4426, 1278, 4735, 181b-1, 181a-1, 5191, 1231, 135b, 29c, 29b-2, 205, 4260, 3122, 215, 194-1, 664 
317821 Therapy-related 3 144 186 839 199 381 715 a 55 194 876 5186, 3919, 15b, 16-2, 1263, 551b, 569, 4789, 4448, 1224, 5588, 548aq, 1248, 28, 944, 3137, 570, 4797, 922 
377512 Therapy-related 2 236 856 627 241 034 230 d 4 177 603 4440, 4441, 4269, 2467, 4786 
377512 Therapy-related 15 18 422 770 22 846 333 d 4 423 563 3118-4, 5701-1, 3118-6, 5701-2, 1268a, 4509-1, 4508 
482711 Therapy-related 6 73 561 217 77 720 182 a 4 158 965 4282, 4463 
482711 Therapy-related 19 7 917 000 8 565 000 a 648 000 4999 
482711 Therapy-related 19 9 458 030 12 415 444 a 2 957 414 5589, 4322, 1181, 1238, 638, 4748, 199a-1 
482711 Therapy-related 19 13 331 909 19 078 761 a 5 746 852 24-2, 27a, 23a, 181c, 181d, 639, 1470, 3188, 3189 
530447 Therapy-related 9 28 278 165 29 708 951 d 1 430 786 876, 873 
557772 Therapy-related 21 9 892 286 46 915 712 a 37 023 426 3156-3, 3118-5, 99a, let-7c, 125b-2, 548x, 6130, 155, 4759, 4327, 6501, 802, 6508, 4760, 3197, 5692b, 6070 
706395 Therapy-related 10 42 100 384 57 162 870 d 15 062 486 5100, 3156-1, 4294, 605, 548f-1 
811184 Therapy-related 1 188 612 922 247 171 197 a 58 558 275 4426, 1278, 4735, 181b-1, 181a-1, 5191, 1231, 135b, 29c, 29b-2, 205, 4260, 3122, 215, 194-1, 664, 320b, 4742, 5008, 3620, 4666a, 1182, 4427, 4671, 4753, 1537, 4428, 3123, 4677, 3916, 3124 
811184 Therapy-related 12 33 393 16 168 160 d 16 134 767 3649, 200c, 141, 1244-3, 613, 614 
811184 Therapy-related 13 40 292 732 71 225 257 d 30 932 525 3168, 5006, 3613, 16-1, 15a, 5693, 4703, 759, 1297, 5007, 3169, 548x, 4704 
811184 Therapy-related 17 42 399 786 78 637 123 a 36 237 337 5089, 152, 1203, 10a, 196a-1, 3185, 6129, 6165, 3614, 142, 4736, 454, 301a, 4729, 21, 4737, 633, 3064, 5047, 6080, 4315-2, 634, 548d-2, 635, 4524a, 3615, 3678, 4738, 636, 4316, 4739, 1268b, 4730, 657, 3065, 338, 1250, 4740, 3186, 4525 
856024 Therapy-related 1 120 321 638 247 171 198 a 126 849 560 3118-1, 3118-2, 3118-3, 6077-1, 5087, 6077-2, 4257, 554, 5698, 190b, 4258, 92b, 555, 9-1, 9-5b, 765, 4259, 5187, 4654, 556, 3658, 921, 1255b-2, 557, 3119-1, 3119-2, 1295, 214, 3120, 199a-2, 488, 4424, 3121, 4426, 1278, 4735, 181b-1, 181a-1, 5191, 1231, 135b, 29c, 29b-2, 205, 4260, 3122, 215, 194-1, 664, 320b, 4742, 5008, 3620, 4666a, 1182, 4427, 4671, 4753, 1537, 4428, 3123, 4677, 3916, 3124 
856024 Therapy-related 12 33 393 17 253 192 d 17 219 799 200c, 141, 1244-3, 613, 614 
856024 Therapy-related 12 120 756 138 132 283 286 d 11 527 148 4304, 3908, 5188, 4419b, 3612 
856024 Therapy-related 17 44 017 170 78 637 124 a 34 619 954 196a-1, 3185, 6129, 6165, 3614, 142, 4736, 454, 301a, 4729, 21, 4737, 633, 3064, 5047, 6080, 4315-2, 634, 548d-2, 635, 4524a, 3615, 3678, 4738, 636, 4316, 4739, 1268b, 4730, 657, 3065, 338, 1250, 4740, 3186, 4525 
864484 Therapy-related 14 53 281 577 57 637 143 d 4 355 566 5580, 4308 
864484 Therapy-related X 64 736 865 65 165 635 d 428 770 223 

a, amplification; Chr, chromosome; d, deletion.

View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal