Table 3

Top 100 genes overexpressed in plasmablasts relative to memory B cells and proposed B-1 cells

ranking according to overexpressionPlasmablast vs memoryPlasmablast vs B1
PRDM1 FNDC3B 
SLAMF7 SLC7A11 
MKi-67 PSAT1 
TNFRSF17 HRASLS2 
SEMA4A APOBEC3B 
HIST1H3B ALDH1L2 
BUB1 AQP3 
APOBEC3B DENND2C 
DCAF12 DCAF12 
10 TYMS IGKV6-21 
11 IGKV6-21 GLDC 
12 IGKV2-40 SLAMF7 
13 KIAA0101 NUCB2 
14 TRIB1 ITGA6 
15 FNDC3B SLC1A4 
16 CD38 FKBP11 
17 HPGD HPGD 
18 AQP3 PRDM1 
19 SLC1A4 TNFRSF17 
20 NUCB2 NT5DC2 
21 SLC7A11 MKI-67 
22 NT5DC2 CDC6 
23 CCNB2 TYMS 
24 HRASLS2 BMP8B 
25 SLCO3A1 BUB1 
26 DLGAP5 SLC41A2 
27 XBP1 DLGAP5 
28 SPN SLCO3A1 
29 ASPM CCNB2 
30 GLDC KIAA0101 
31 V3-3 ELL2 
32 TOP2A TRIB1 
33 RRM2 ESCO2 
34 PSAT1 RRM2 
35 HIST1H2BB PDIA5 
36 TP63 TNFRSF17 
37 ELL2 SLC44A1 
38 ALDH1L2 AMPD1 
39 GPRC5D SEC11C 
40 GAB1 ASPM 
41 ESCO2 VDR 
42 MGC29506 CDC20 
43 MANEA IGLV7-46 
44 MYBL2 DTL 
45 DTL C14orf145 
46 MAN1A1 GPRIN3 
47 ITGA6 HIST1H2AJ 
48 TPX2 SEMA4A 
49 DENND2C ELL2 
50 SKA3 MANEA 
51 CDC6 CDKN3 
52 HIST1H1B GPR155 
53 BMP8B SEC24D 
54 GPRIN3 IGKV2-40 
55 FKBP11 XBP1 
56 IGLV6-57 SPN 
57 VDR IGLV6-57 
58 SLC44A1 MGC29506 
59 PDIA4 GPRC5D 
60 GRCh37:15 SEPT10 
61 ELL2 LMAN1 
62 TNFRSF17 HSPA13 
63 CDK1 WIPI1 
64 LEF1 CNKSR1 
65 WARS CHAC2 
66 SEC11C TSHR 
67 IGKV2-24 TP63 
68 PDIA5 FAM172B 
69 κ constant C17orf28 
70 SLC4A12 BHLHA15 
71 CDC20 IL6ST 
72 HSPA13 SLC7A5 
73 SEC24D RCC1 
74 NCAPG FKBP14 
75 RCC1 SELS 
76 GRCH37:2 GRCH37:15 
77 GPR155 WARS 
78 NCRNA00152 PDIA4 
79 C14orf145 HIST1H3B 
80 CDKN3 IL2RB 
81 CASP3 EIF4E3 
82 WIPI1 CDK1 
83 MGC:178074 HYOU1 
84 HIST1H3F HIST1H2BB 
85 HIST1H2AJ SPATS2 
86 SELS CASP3 
87 BHLA15 CAV1 
88 LDLR GRCh37e:3 
89 CENPF DERL3 
90 PLK1 GRCH37:14 
91 NUSAP1 TXNDC11 
92 RUNX2 LARP1B 
93 SELPLG GGH 
94 HIST1H3J CCR10 
95 CAV1 CCNA2 
96 NCRNA00152 PERP 
97 C17orf28 NCAPG 
98 KIF23 TOP2A 
99 CNKSR1 IGKV2OR22-4 
100 IL2RB ADA 
ranking according to overexpressionPlasmablast vs memoryPlasmablast vs B1
PRDM1 FNDC3B 
SLAMF7 SLC7A11 
MKi-67 PSAT1 
TNFRSF17 HRASLS2 
SEMA4A APOBEC3B 
HIST1H3B ALDH1L2 
BUB1 AQP3 
APOBEC3B DENND2C 
DCAF12 DCAF12 
10 TYMS IGKV6-21 
11 IGKV6-21 GLDC 
12 IGKV2-40 SLAMF7 
13 KIAA0101 NUCB2 
14 TRIB1 ITGA6 
15 FNDC3B SLC1A4 
16 CD38 FKBP11 
17 HPGD HPGD 
18 AQP3 PRDM1 
19 SLC1A4 TNFRSF17 
20 NUCB2 NT5DC2 
21 SLC7A11 MKI-67 
22 NT5DC2 CDC6 
23 CCNB2 TYMS 
24 HRASLS2 BMP8B 
25 SLCO3A1 BUB1 
26 DLGAP5 SLC41A2 
27 XBP1 DLGAP5 
28 SPN SLCO3A1 
29 ASPM CCNB2 
30 GLDC KIAA0101 
31 V3-3 ELL2 
32 TOP2A TRIB1 
33 RRM2 ESCO2 
34 PSAT1 RRM2 
35 HIST1H2BB PDIA5 
36 TP63 TNFRSF17 
37 ELL2 SLC44A1 
38 ALDH1L2 AMPD1 
39 GPRC5D SEC11C 
40 GAB1 ASPM 
41 ESCO2 VDR 
42 MGC29506 CDC20 
43 MANEA IGLV7-46 
44 MYBL2 DTL 
45 DTL C14orf145 
46 MAN1A1 GPRIN3 
47 ITGA6 HIST1H2AJ 
48 TPX2 SEMA4A 
49 DENND2C ELL2 
50 SKA3 MANEA 
51 CDC6 CDKN3 
52 HIST1H1B GPR155 
53 BMP8B SEC24D 
54 GPRIN3 IGKV2-40 
55 FKBP11 XBP1 
56 IGLV6-57 SPN 
57 VDR IGLV6-57 
58 SLC44A1 MGC29506 
59 PDIA4 GPRC5D 
60 GRCh37:15 SEPT10 
61 ELL2 LMAN1 
62 TNFRSF17 HSPA13 
63 CDK1 WIPI1 
64 LEF1 CNKSR1 
65 WARS CHAC2 
66 SEC11C TSHR 
67 IGKV2-24 TP63 
68 PDIA5 FAM172B 
69 κ constant C17orf28 
70 SLC4A12 BHLHA15 
71 CDC20 IL6ST 
72 HSPA13 SLC7A5 
73 SEC24D RCC1 
74 NCAPG FKBP14 
75 RCC1 SELS 
76 GRCH37:2 GRCH37:15 
77 GPR155 WARS 
78 NCRNA00152 PDIA4 
79 C14orf145 HIST1H3B 
80 CDKN3 IL2RB 
81 CASP3 EIF4E3 
82 WIPI1 CDK1 
83 MGC:178074 HYOU1 
84 HIST1H3F HIST1H2BB 
85 HIST1H2AJ SPATS2 
86 SELS CASP3 
87 BHLA15 CAV1 
88 LDLR GRCh37e:3 
89 CENPF DERL3 
90 PLK1 GRCH37:14 
91 NUSAP1 TXNDC11 
92 RUNX2 LARP1B 
93 SELPLG GGH 
94 HIST1H3J CCR10 
95 CAV1 CCNA2 
96 NCRNA00152 PERP 
97 C17orf28 NCAPG 
98 KIF23 TOP2A 
99 CNKSR1 IGKV2OR22-4 
100 IL2RB ADA 

Different B cell subsets were sorted and gene expression analysis was performed on sorted populations. The top 100 genes that were overexpressed in plasmablasts compared with memory B cells (left column) and in plasmablasts compared with proposed B-1 cells (right column) are listed, ranked in descending order of difference in expression. Genes depicted in bold have been associated with plasma cell differentiation23-25  or have been associated with a plasma cell–specific biological network, as defined by Jourdan et al, 2009.25 

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal