Table 1

Top 25 upregulated and downregulated genes in U0126-treated MDDCs at 4, 10, and 24 hours posttreatment

4 hours10 hours24 hours
Gene symbolLog2 fold changeAdjusted pGene symbolLog2 fold changeAdjusted pGene symbolLog2 fold changeAdjusted P
Upregulated genes PLAT 2.39 1.69 E-07 PLAT 3.39 1.78 E-10 ANGPT2 5.48 0.012988 
 SHF 1.95 7.79 E-06 PTGER3 3.06 1.44 E-08 RBMXL3 5.09 0.043762 
 AHRR 1.83 0.011751 ATP1B2 2.71 3.64 E-08 NR4A3 4.85 0.011564 
 ROR2 1.70 0.014002 TTC9 2.61 2.89 E-12 RALGAPA1 4.38 0.020438 
 TTC9 1.67 1.50 E-08 SHF 2.50 7.10 E-08 ATP1B2 4.06 2.16 E-10 
 LRG1 1.64 1.69 E-07 AHRR 2.23 1.53 E-11 A4GALT 3.97 0.000855 
 ATP1B2 1.59 0.000199 CYP1B1 2.21 1.39 E-09 TMPRSS6 3.71 1.95 E-05 
 GAD1 1.48 4.16 E-07 GAD1 2.21 2.31 E-10 GSTT1 3.41 7.67 E-10 
 RASAL1 1.38 0.0001908 SYTL3 2.13 2.36 E-05 TTC9 3.10 7.46 E-13 
 ZNF395 1.38 1.69 E-07 ROR2 2.06 0.001021 MUC1 2.78 1.96 E-09 
 RARG 1.36 0.0005075 CD163L1 2.01 5.72 E-05 CD163L1 2.76 2.74 E-06 
 ARL4C 1.33 0.0491981 CSRP2 1.94 3.14 E-09 XPNPEP2 2.71 0.000513 
 CXCL2 1.33 0.0020045 RARG 1.85 4.36 E-06 ARL4C 2.64 5.30 E-05 
 TIPARP 1.24 7.11 E-07 MUC1 1.82 4.68 E-07 PTGER3 2.64 8.52 E-07 
 PDGFB 1.20 0.0109397 THBS1 1.78 1.05 E-05 SLC26A1 2.62 0.04403 
 PTGER2 1.17 3.49 E-07 ARL4C 1.77 0.002025 CYP1B1 2.49 9.26 E-10 
 NINL 1.16 0.0108421 TIPARP 1.69 1.96 E-09 CSRP2 2.46 2.81 E-10 
 PRDM1 1.14 0.000317 LPAR6 1.64 4.57 E-09 HES1 2.43 2.46 E-05 
 THBS1 1.14 0.0048596 ANK3 1.61 0.020469 PTP4A3 2.41 1.80 E-05 
 SYTL3 1.13 0.0417727 RASAL1 1.60 1.27 E-05 ITGB7 2.41 4.05 E-10 
 CYP1B1 1.10 0.000145 ITGB7 1.59 9.34 E-08 SHF 2.41 6.22 E-07 
 NCF1 1.08 0.0274784 GSG1 1.59 0.002054 RPS4Y1 2.41 8.68 E-05 
 XYLT1 1.08 0.0172593 NCF1 1.54 0.000415 CCDC108 2.38 0.031671 
 MUC1 1.02 0.0020864 PLA2G16 1.52 1.31 E-09 BDH2 2.29 0.009805 
 LPAR6 1.01 2.03 E-05 ZNF395 1.51 1.36 E-08 EPHB2 2.28 8.15 E-09 
Downregulated genes SPRED2 −1.50 1.66 E-05 HIVEP3 −1.57 1.55 E-03 GATAD1 −2.57 3.01 E-08 
 KMO −1.50 9.46 E-08 ASPHD2 −1.57 3.05 E-09 NDP −2.60 1.19 E-08 
 CDC42EP2 −1.54 3.71 E-05 KMO −1.59 1.53 E-07 TDG −2.65 2.81 E-10 
 CCR2 −1.55 3.61 E-04 LEPREL1 −1.61 1.00 E-08 MYO1D −2.74 1.77 E-08 
 ASPHD2 −1.56 1.04 E-08 ARAP3 −1.61 6.63 E-08 PDLIM7 −2.77 5.34 E-10 
 EGR1 −1.56 9.69 E-06 SLAMF8 −1.64 8.99 E-08 EBPL −2.77 1.21 E-12 
 CLDN1 −1.57 3.34 E-06 PLA2G4A −1.64 1.76 E-07 MTERFD1 −2.81 2.61 E-10 
 TAGAP −1.61 1.53 E-08 KCNN4 −1.66 1.74 E-07 PPIAL4A −2.84 1.61 E-04 
 PLA2G4A −1.65 3.49 E-07 EXT1 −1.70 2.85 E-05 STEAP3 −2.92 1.91 E-10 
 FNIP2 −1.69 8.25 E-08 DMPK −1.70 6.05 E-06 EBAG9 −2.94 1.34 E-11 
 KCNN4 −1.69 3.23 E-07 ADORA2B −1.72 8.57 E-03 FAM26F −2.96 1.56 E-12 
 DAB2 −1.69 2.95 E-06 CCR2 −1.74 3.98 E-02 CHCHD10 −3.00 1.81 E-09 
 CDR2 −1.70 3.63 E-04 SLC4A7 −1.76 1.81 E-03 TMEM41B −3.02 9.03 E-12 
 SPRY2 −1.71 1.45 E-04 CLDN1 −1.81 1.53 E-07 EPCAM −3.03 1.80 E-11 
 PTX3 −1.73 7.12 E-09 ENTPD1 −1.86 3.14 E-09 GRHPR −3.08 9.66 E-11 
 TRIB2 −1.81 4.97 E-10 TRIB2 −1.95 4.13 E-11 IGSF6 −3.16 5.83 E-10 
 MYC −1.83 2.08 E-08 ZC3H8 −1.97 9.34 E-08 CLK1 −3.22 6.68 E-10 
 ADORA2B −1.86 8.93 E-03 PPAP2B −2.04 1.73 E-10 PATZ1 −3.39 8.81 E-13 
 FLT1 −1.88 1.69 E-07 FOS −2.20 1.00 E-08 MTFMT −3.41 1.21 E-12 
 PPAP2B −2.08 4.25 E-10 FLT1 −2.32 5.60 E-09 DNM1L −3.43 1.42 E-13 
 CCL7 −2.18 9.23 E-07 IL1R2 −2.43 1.00 E-08 PNKD −3.44 2.71 E-14 
 FOS −2.26 1.62 E-08 EHD1 −2.43 2.21 E-12 CCR2 −3.61 7.47 E-05 
 CCL2 −2.46 1.79 E-06 PTX3 −2.47 3.75 E-12 TMEM167A −3.77 2.79 E-13 
 EHD1 −2.81 1.34 E-13 CCL2 −2.61 3.05 E-07 G3BP2 −3.83 2.71 E-14 
 DUSP6 −3.80 1.34 E-13 DUSP6 −3.05 4.66 E-12 MRPL33 −3.88 2.49 E-13 
4 hours10 hours24 hours
Gene symbolLog2 fold changeAdjusted pGene symbolLog2 fold changeAdjusted pGene symbolLog2 fold changeAdjusted P
Upregulated genes PLAT 2.39 1.69 E-07 PLAT 3.39 1.78 E-10 ANGPT2 5.48 0.012988 
 SHF 1.95 7.79 E-06 PTGER3 3.06 1.44 E-08 RBMXL3 5.09 0.043762 
 AHRR 1.83 0.011751 ATP1B2 2.71 3.64 E-08 NR4A3 4.85 0.011564 
 ROR2 1.70 0.014002 TTC9 2.61 2.89 E-12 RALGAPA1 4.38 0.020438 
 TTC9 1.67 1.50 E-08 SHF 2.50 7.10 E-08 ATP1B2 4.06 2.16 E-10 
 LRG1 1.64 1.69 E-07 AHRR 2.23 1.53 E-11 A4GALT 3.97 0.000855 
 ATP1B2 1.59 0.000199 CYP1B1 2.21 1.39 E-09 TMPRSS6 3.71 1.95 E-05 
 GAD1 1.48 4.16 E-07 GAD1 2.21 2.31 E-10 GSTT1 3.41 7.67 E-10 
 RASAL1 1.38 0.0001908 SYTL3 2.13 2.36 E-05 TTC9 3.10 7.46 E-13 
 ZNF395 1.38 1.69 E-07 ROR2 2.06 0.001021 MUC1 2.78 1.96 E-09 
 RARG 1.36 0.0005075 CD163L1 2.01 5.72 E-05 CD163L1 2.76 2.74 E-06 
 ARL4C 1.33 0.0491981 CSRP2 1.94 3.14 E-09 XPNPEP2 2.71 0.000513 
 CXCL2 1.33 0.0020045 RARG 1.85 4.36 E-06 ARL4C 2.64 5.30 E-05 
 TIPARP 1.24 7.11 E-07 MUC1 1.82 4.68 E-07 PTGER3 2.64 8.52 E-07 
 PDGFB 1.20 0.0109397 THBS1 1.78 1.05 E-05 SLC26A1 2.62 0.04403 
 PTGER2 1.17 3.49 E-07 ARL4C 1.77 0.002025 CYP1B1 2.49 9.26 E-10 
 NINL 1.16 0.0108421 TIPARP 1.69 1.96 E-09 CSRP2 2.46 2.81 E-10 
 PRDM1 1.14 0.000317 LPAR6 1.64 4.57 E-09 HES1 2.43 2.46 E-05 
 THBS1 1.14 0.0048596 ANK3 1.61 0.020469 PTP4A3 2.41 1.80 E-05 
 SYTL3 1.13 0.0417727 RASAL1 1.60 1.27 E-05 ITGB7 2.41 4.05 E-10 
 CYP1B1 1.10 0.000145 ITGB7 1.59 9.34 E-08 SHF 2.41 6.22 E-07 
 NCF1 1.08 0.0274784 GSG1 1.59 0.002054 RPS4Y1 2.41 8.68 E-05 
 XYLT1 1.08 0.0172593 NCF1 1.54 0.000415 CCDC108 2.38 0.031671 
 MUC1 1.02 0.0020864 PLA2G16 1.52 1.31 E-09 BDH2 2.29 0.009805 
 LPAR6 1.01 2.03 E-05 ZNF395 1.51 1.36 E-08 EPHB2 2.28 8.15 E-09 
Downregulated genes SPRED2 −1.50 1.66 E-05 HIVEP3 −1.57 1.55 E-03 GATAD1 −2.57 3.01 E-08 
 KMO −1.50 9.46 E-08 ASPHD2 −1.57 3.05 E-09 NDP −2.60 1.19 E-08 
 CDC42EP2 −1.54 3.71 E-05 KMO −1.59 1.53 E-07 TDG −2.65 2.81 E-10 
 CCR2 −1.55 3.61 E-04 LEPREL1 −1.61 1.00 E-08 MYO1D −2.74 1.77 E-08 
 ASPHD2 −1.56 1.04 E-08 ARAP3 −1.61 6.63 E-08 PDLIM7 −2.77 5.34 E-10 
 EGR1 −1.56 9.69 E-06 SLAMF8 −1.64 8.99 E-08 EBPL −2.77 1.21 E-12 
 CLDN1 −1.57 3.34 E-06 PLA2G4A −1.64 1.76 E-07 MTERFD1 −2.81 2.61 E-10 
 TAGAP −1.61 1.53 E-08 KCNN4 −1.66 1.74 E-07 PPIAL4A −2.84 1.61 E-04 
 PLA2G4A −1.65 3.49 E-07 EXT1 −1.70 2.85 E-05 STEAP3 −2.92 1.91 E-10 
 FNIP2 −1.69 8.25 E-08 DMPK −1.70 6.05 E-06 EBAG9 −2.94 1.34 E-11 
 KCNN4 −1.69 3.23 E-07 ADORA2B −1.72 8.57 E-03 FAM26F −2.96 1.56 E-12 
 DAB2 −1.69 2.95 E-06 CCR2 −1.74 3.98 E-02 CHCHD10 −3.00 1.81 E-09 
 CDR2 −1.70 3.63 E-04 SLC4A7 −1.76 1.81 E-03 TMEM41B −3.02 9.03 E-12 
 SPRY2 −1.71 1.45 E-04 CLDN1 −1.81 1.53 E-07 EPCAM −3.03 1.80 E-11 
 PTX3 −1.73 7.12 E-09 ENTPD1 −1.86 3.14 E-09 GRHPR −3.08 9.66 E-11 
 TRIB2 −1.81 4.97 E-10 TRIB2 −1.95 4.13 E-11 IGSF6 −3.16 5.83 E-10 
 MYC −1.83 2.08 E-08 ZC3H8 −1.97 9.34 E-08 CLK1 −3.22 6.68 E-10 
 ADORA2B −1.86 8.93 E-03 PPAP2B −2.04 1.73 E-10 PATZ1 −3.39 8.81 E-13 
 FLT1 −1.88 1.69 E-07 FOS −2.20 1.00 E-08 MTFMT −3.41 1.21 E-12 
 PPAP2B −2.08 4.25 E-10 FLT1 −2.32 5.60 E-09 DNM1L −3.43 1.42 E-13 
 CCL7 −2.18 9.23 E-07 IL1R2 −2.43 1.00 E-08 PNKD −3.44 2.71 E-14 
 FOS −2.26 1.62 E-08 EHD1 −2.43 2.21 E-12 CCR2 −3.61 7.47 E-05 
 CCL2 −2.46 1.79 E-06 PTX3 −2.47 3.75 E-12 TMEM167A −3.77 2.79 E-13 
 EHD1 −2.81 1.34 E-13 CCL2 −2.61 3.05 E-07 G3BP2 −3.83 2.71 E-14 
 DUSP6 −3.80 1.34 E-13 DUSP6 −3.05 4.66 E-12 MRPL33 −3.88 2.49 E-13 
View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal