Table 1

Differentially expressed genes in SclΔ/Δ MkPs

Gene symbolFold change*Accession no.
Adhesion/migration   
    Col18a1 7.77 NM_009929.2 
    Megf10 3.63 NM_001001979 
    Emilin2 3.29 NM_145158 
    Cd72 2.73 NM_007654.1 
    Serpine2 2.22 AK045954 
    Map17 2.12 NM_026018.1 
    Cd63 1.77 NM_007653.1 
    Emid1 1.75 NM_080595.1 
    Cxcr4 1.75 NM_009911.2 
    Ltbp1 1.61 NM_019919.2 
    Mfge8 1.45 NM_008594 
    Tens1 0.66 XM_109868 
    Elmo1 0.6 NM_080288.1 
    Esam1 0.55 NM_027102.1 
    Selp 0.4 NM_011347.1 
Cell cycle/apoptosis   
    Cdkn1a 3.26 NM_007669.2 
    Tnfrsf18 1.97 NM_009400.1 
    Rassf2 1.64 NM_175445.3 
    Bin1 1.62 AK041729.1 
    Bcl2 1.59 NM_177410.1 
    Ndg2 1.5 NM_175329.3 
    Tmbim4 1.5 NM_026617.1 
    Cryab 1.37 NM_009964.1 
    Nalp6 0.65 NM_133946.1 
    Catnal1 0.47 NM_018761.2 
Transcription   
    Mta3 2.2 NM_054082.1 
    Carhsp1 2.04 NM_025821.2 
    Lyl1 1.77 NM_008535.1 
    Rcor1 1.66 NM_054048.1 
    Gata2 1.57 NM_008090.3 
    Hes6 1.52 NM_019479.2 
    Foxp1 1.48 NM_053202.1 
    Mta2 1.48 NM_011842.2 
    Chd7 0.71 XM_149413.3 
    Fhl1 0.69 NM_010211.1 
    Ccndbp1 0.68 NM_010761.1 
    Hoxb5 0.67 NM_008268.1 
    Mysm1 0.65 NM_177239.1 
    Fos 0.61 NM_010234.2 
    Ctdspl2 0.59 XM_283758.1 
    Tle1 0.52 NM_011599.2 
    Ear10 0.35 NM_053112.1 
    Ear2 0.34 NM_007895 
    Tal1 0.2 NM_011527.1 
Immune response   
    Igh-6 6.66 XM_354710.1 
    Cst7 2.57 NM_009977.1 
    Clecsf8 2.44 NM_010819.1 
    Cd59a 0.54 NM_007652.2 
Signal transduction   
    Fcer1g NM_010185.2 
    P2ry14 2.84 NM_133200.2 
    Wbscr5 2.51 NM_022964.2 
    Ppp1r1c 2.13 NM_033264.1 
    Cd69 1.98 XM_132882.1 
    Mrvi1 1.97 NM_194464.1 
    Itgb3bp 1.88 NM_026348.2 
    Il15 1.87 NM_008357.1 
    Centd1 1.81 XM_132099.5 
    Rpel1 1.79 NM_198419.2 
    Dok4 1.75 NM_053246.1 
    Tas1r1 1.7 NM_031867.1 
    Fgf3 1.69 NM_008007.1 
    Irak3 1.69 NM_028679.2 
    Dusp4 1.69 NM_176933 
    Cysltr1 1.63 NM_021476.2 
    Diras2 1.68 NM_001024474 
    Lat 1.54 NM_010689.2 
    Plekhg5 1.5 NM_001004156 
    Agtrap 1.48 NM_009642.3 
    Rab27a 1.48 NM_023635.2 
    Ly6e 1.46 NM_008529 
    Il18r1 1.45 NM_008365.1 
    Cd244 1.36 NM_018729.1 
    Dusp1 0.69 NM_013642.1 
    Grb10 0.67 AK012646 
    Gucy1a3 0.62 NM_021896.3 
    Rab11a 0.62 NM_017382 
    Fcgr2b 0.6 NM_010187.1 
    Pdgfb 0.57 NM_011057.2 
    Drctnnb1a 0.56 NM_053090 
    Il6ra 0.48 AK020663 
    Gnaz 0.45 NM_010311.2 
    Pde10a 0.37 NM_011866.1 
Transport   
    Alox5 5.53 XM_132832.3 
    Tnni1 2.04 NM_021467 
    Emid1 1.98 NM_080595.1 
    Tnni3 1.97 NM_009406.2 
    Slc6a13 1.85 NM_144512.1 
    Hbb-b1 1.79 AK005442 
    Tpcn1 1.73 NM_145853.2 
    Ddx25 1.72 NM_013932.2 
    Spns3 1.71 XM_126365.3 
    Igf2r 1.56 NM_010515.1 
    Slc5a9 1.56 NM_145551.2 
    Slc14a1 0.68 NM_028122.2 
    Abcc5 0.67 NM_176839.1 
    Car2 0.53 NM_009801.3 
    Hebp1 0.51 NM_013546.1 
Cytoskeleton organization   
    Myo18b 4.84 XM_144513.3 
    Tpm2 2.4 NM_009416.2 
    Cap1 2.07 NM_007598.2 
    Myo6 1.65 NM_008662.1 
    Ehd2 1.53 AK029240 
    Homer2 0.46 XM_133550.4 
Ubiquitination   
    Usp20 1.56 NM_028846.1 
    Usp40 0.54 XM_129956.2 
Metabolism   
    Chst1 4.71 NM_023850.1 
    Alox5 3.95 XM_132832 
    Abat 2.31 NM_172961.2 
    Padi2 2.2 NM_008812.1 
    Hmgcs2 1.88 NM_008256.2 
    Acas2l 1.65 NM_080575.1 
    Ltc4s 1.65 NM_008521.1 
    Rsdr1-pending 1.64 AK087137 
    Dhrs3 1.45 NM_011303.2 
    Gchfr 0.71 NM_177157.2 
    Chsy3 0.65 NM_178636 
    Oxr1 0.63 AK040881 
    Hyi 0.6 XM_489058 
    Mtap 0.6 NM_024433.1 
    Serpinb1a 0.56 NM_025429.1 
    Gucy1a3 0.47 NM_021896.3 
    Sdh1 0.45 NM_146126.1 
    Serpina3g 0.4 XM_354694.1 
    Serpina3b 0.38 NM_173024.1 
Unidentified   
    9830134C10Rik 3.43 AK036563 
    2310047A01Rik 2.56 XM_484355 
    LOC381142 2.09 XM_355058.1 
    6430559E15Rik 1.99 XM_131537.4 
    C130080K17Rik 1.71 AK081831 
    LOC382231 1.69 XM_356343.1 
    1110012N22Rik 1.68 XM_126634.3 
    BC023181 1.6 XM_194180.3 
    4930427A07Rik 1.51 NM_134041.1 
    BC057022 1.5 NM_001004180.1 
    0610037L13Rik 0.72 NM_028754.1 
    5730446C15Rik 0.69 NM_146096 
    B930074N03Rik 0.68 AK047478 
    BC023823 0.68 NM_153566.1 
    C530050O22Rik 0.68 NM_172871.1 
    AY078069 0.66 NM_172142.1 
    D8Ertd594e 0.66 NM_133791.3 
    2900008M13Rik 0.63 XM_110121 
    2010300G19Rik 0.61 NM_028097.2 
    BC049975 0.59 XM_138237.2 
    9030611O19Rik 0.57 NM_027828.2 
Gene symbolFold change*Accession no.
Adhesion/migration   
    Col18a1 7.77 NM_009929.2 
    Megf10 3.63 NM_001001979 
    Emilin2 3.29 NM_145158 
    Cd72 2.73 NM_007654.1 
    Serpine2 2.22 AK045954 
    Map17 2.12 NM_026018.1 
    Cd63 1.77 NM_007653.1 
    Emid1 1.75 NM_080595.1 
    Cxcr4 1.75 NM_009911.2 
    Ltbp1 1.61 NM_019919.2 
    Mfge8 1.45 NM_008594 
    Tens1 0.66 XM_109868 
    Elmo1 0.6 NM_080288.1 
    Esam1 0.55 NM_027102.1 
    Selp 0.4 NM_011347.1 
Cell cycle/apoptosis   
    Cdkn1a 3.26 NM_007669.2 
    Tnfrsf18 1.97 NM_009400.1 
    Rassf2 1.64 NM_175445.3 
    Bin1 1.62 AK041729.1 
    Bcl2 1.59 NM_177410.1 
    Ndg2 1.5 NM_175329.3 
    Tmbim4 1.5 NM_026617.1 
    Cryab 1.37 NM_009964.1 
    Nalp6 0.65 NM_133946.1 
    Catnal1 0.47 NM_018761.2 
Transcription   
    Mta3 2.2 NM_054082.1 
    Carhsp1 2.04 NM_025821.2 
    Lyl1 1.77 NM_008535.1 
    Rcor1 1.66 NM_054048.1 
    Gata2 1.57 NM_008090.3 
    Hes6 1.52 NM_019479.2 
    Foxp1 1.48 NM_053202.1 
    Mta2 1.48 NM_011842.2 
    Chd7 0.71 XM_149413.3 
    Fhl1 0.69 NM_010211.1 
    Ccndbp1 0.68 NM_010761.1 
    Hoxb5 0.67 NM_008268.1 
    Mysm1 0.65 NM_177239.1 
    Fos 0.61 NM_010234.2 
    Ctdspl2 0.59 XM_283758.1 
    Tle1 0.52 NM_011599.2 
    Ear10 0.35 NM_053112.1 
    Ear2 0.34 NM_007895 
    Tal1 0.2 NM_011527.1 
Immune response   
    Igh-6 6.66 XM_354710.1 
    Cst7 2.57 NM_009977.1 
    Clecsf8 2.44 NM_010819.1 
    Cd59a 0.54 NM_007652.2 
Signal transduction   
    Fcer1g NM_010185.2 
    P2ry14 2.84 NM_133200.2 
    Wbscr5 2.51 NM_022964.2 
    Ppp1r1c 2.13 NM_033264.1 
    Cd69 1.98 XM_132882.1 
    Mrvi1 1.97 NM_194464.1 
    Itgb3bp 1.88 NM_026348.2 
    Il15 1.87 NM_008357.1 
    Centd1 1.81 XM_132099.5 
    Rpel1 1.79 NM_198419.2 
    Dok4 1.75 NM_053246.1 
    Tas1r1 1.7 NM_031867.1 
    Fgf3 1.69 NM_008007.1 
    Irak3 1.69 NM_028679.2 
    Dusp4 1.69 NM_176933 
    Cysltr1 1.63 NM_021476.2 
    Diras2 1.68 NM_001024474 
    Lat 1.54 NM_010689.2 
    Plekhg5 1.5 NM_001004156 
    Agtrap 1.48 NM_009642.3 
    Rab27a 1.48 NM_023635.2 
    Ly6e 1.46 NM_008529 
    Il18r1 1.45 NM_008365.1 
    Cd244 1.36 NM_018729.1 
    Dusp1 0.69 NM_013642.1 
    Grb10 0.67 AK012646 
    Gucy1a3 0.62 NM_021896.3 
    Rab11a 0.62 NM_017382 
    Fcgr2b 0.6 NM_010187.1 
    Pdgfb 0.57 NM_011057.2 
    Drctnnb1a 0.56 NM_053090 
    Il6ra 0.48 AK020663 
    Gnaz 0.45 NM_010311.2 
    Pde10a 0.37 NM_011866.1 
Transport   
    Alox5 5.53 XM_132832.3 
    Tnni1 2.04 NM_021467 
    Emid1 1.98 NM_080595.1 
    Tnni3 1.97 NM_009406.2 
    Slc6a13 1.85 NM_144512.1 
    Hbb-b1 1.79 AK005442 
    Tpcn1 1.73 NM_145853.2 
    Ddx25 1.72 NM_013932.2 
    Spns3 1.71 XM_126365.3 
    Igf2r 1.56 NM_010515.1 
    Slc5a9 1.56 NM_145551.2 
    Slc14a1 0.68 NM_028122.2 
    Abcc5 0.67 NM_176839.1 
    Car2 0.53 NM_009801.3 
    Hebp1 0.51 NM_013546.1 
Cytoskeleton organization   
    Myo18b 4.84 XM_144513.3 
    Tpm2 2.4 NM_009416.2 
    Cap1 2.07 NM_007598.2 
    Myo6 1.65 NM_008662.1 
    Ehd2 1.53 AK029240 
    Homer2 0.46 XM_133550.4 
Ubiquitination   
    Usp20 1.56 NM_028846.1 
    Usp40 0.54 XM_129956.2 
Metabolism   
    Chst1 4.71 NM_023850.1 
    Alox5 3.95 XM_132832 
    Abat 2.31 NM_172961.2 
    Padi2 2.2 NM_008812.1 
    Hmgcs2 1.88 NM_008256.2 
    Acas2l 1.65 NM_080575.1 
    Ltc4s 1.65 NM_008521.1 
    Rsdr1-pending 1.64 AK087137 
    Dhrs3 1.45 NM_011303.2 
    Gchfr 0.71 NM_177157.2 
    Chsy3 0.65 NM_178636 
    Oxr1 0.63 AK040881 
    Hyi 0.6 XM_489058 
    Mtap 0.6 NM_024433.1 
    Serpinb1a 0.56 NM_025429.1 
    Gucy1a3 0.47 NM_021896.3 
    Sdh1 0.45 NM_146126.1 
    Serpina3g 0.4 XM_354694.1 
    Serpina3b 0.38 NM_173024.1 
Unidentified   
    9830134C10Rik 3.43 AK036563 
    2310047A01Rik 2.56 XM_484355 
    LOC381142 2.09 XM_355058.1 
    6430559E15Rik 1.99 XM_131537.4 
    C130080K17Rik 1.71 AK081831 
    LOC382231 1.69 XM_356343.1 
    1110012N22Rik 1.68 XM_126634.3 
    BC023181 1.6 XM_194180.3 
    4930427A07Rik 1.51 NM_134041.1 
    BC057022 1.5 NM_001004180.1 
    0610037L13Rik 0.72 NM_028754.1 
    5730446C15Rik 0.69 NM_146096 
    B930074N03Rik 0.68 AK047478 
    BC023823 0.68 NM_153566.1 
    C530050O22Rik 0.68 NM_172871.1 
    AY078069 0.66 NM_172142.1 
    D8Ertd594e 0.66 NM_133791.3 
    2900008M13Rik 0.63 XM_110121 
    2010300G19Rik 0.61 NM_028097.2 
    BC049975 0.59 XM_138237.2 
    9030611O19Rik 0.57 NM_027828.2 
*

Fold change: ratio SclΔ/Δ MkPs/WT MkP.

Specific functions in megakaryopoiesis and/or platelet biology.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal