Oligonucleotides used in this study
Target gene . | Sense and antisense oligonucleotides . |
---|---|
Used in real-time PCR | |
Indo | S, 5′-ACGGGCAGCTTCGAGAAG-3′ |
AS, 5′-TCGCAGTAGGGAACAGCAA-3′ | |
Tyrobp | S, 5′-TGGTGCCTTCTGTTCCTTCC-3′ |
AS, 5′-TTGTTTCCGGGTCCCTTCC-3′ | |
Cxcl9 | S, 5′-GCATCATCTTCCTGGAGCAGTG-3′ |
AS, 5′-TGTAGTGGATCGTGCCTCGG-3′ | |
Cd14 | S, 5′-GTCTTCCTTGAACGACGACGAC-3′ |
AS, 5′-TAGAAGGTATTCCAGGCTGCGG-3′ | |
Gapdh | S, 5′-GCCTTCCGTGTTCCTACCC-3′ |
AS, 5′-CAGTGGGCCCTCAGATGC-3′ | |
Used in RT-PCR | |
Indo | S, 5′-GAAGGATCCTTGAAGACCAC-3′ |
AS, 5′-GAAGCTGCGATTTCCACCAA-3′ | |
Tyrobp | S, 5′-TGGTGCCTTCTGTTCCTTCC-3′ |
AS, 5′-TTGTTTCCGGGTCCCTTCC-3′ | |
Hcst | S, 5′-CCTCCTGTTCCTGCTTCTGC-3′ |
AS, 5′-GGGCGCATACATACAAACACC-3′ | |
Icsbp1 | S, 5′-CAGATCGACAGCAGCATGTACC-3′ |
AS, 5′-TTCAGAGCACAGCGTAACCTCG-3′ | |
Gapdh | S, 5′-AGCACAGTCCATGCCATCAC-3′ |
AS, 5′-TCCACCACCTGTTGCTGTA-3′ | |
TYROBP | S, 5′-ACTTGAACCCTGCAGCAGGC-3′ |
AS, 5′-CTCGGTCTCAGTGATACGCTG-3′ | |
HCST | S, 5′-CATGATGGTAGACCCAGTGTAGG-3′ |
AS, 5′-ACGATGAGCAGCGATGCCAC-3′ | |
IRF8 | S, 5′-GACAGTGGCTGATCGAGCAG-3′ |
AS, 5′-CTTCCAAGTGGCTGGTTCAGC-3′ | |
IRF1 | S, 5′-ATCACTCGGATGCGCATGAGAC-3′ |
AS, 5′-TACACTCGCACAGCTGAGCTG-3′ | |
Used in siRNA | |
Tyrobp | S, 5′-GGGACCCGGAAACAACACAtt-3′ |
AS, 5′-UGUGUUGUUUCCGGGUCCCtt-3′ | |
Icsbp1 | S, 5′-GGAUUACAAUCAGGAGGUGtt-3′ |
AS, 5′-CACCUCCUGAUUGUAAUCCtg-3′ | |
TYROBP | S, 5′-AACAGCGUAUCACUGAGACtt-3′ |
AS, 5′-GUCUCAGUGAUACGCUGUUtc-3′ | |
IRF8 | S, 5′-GGACUGAUUUGGGAGAAUGtt-3′ |
AS, 5′-CAUUCUCCCAAAUCAGUCCtg-3′ |
Target gene . | Sense and antisense oligonucleotides . |
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Used in real-time PCR | |
Indo | S, 5′-ACGGGCAGCTTCGAGAAG-3′ |
AS, 5′-TCGCAGTAGGGAACAGCAA-3′ | |
Tyrobp | S, 5′-TGGTGCCTTCTGTTCCTTCC-3′ |
AS, 5′-TTGTTTCCGGGTCCCTTCC-3′ | |
Cxcl9 | S, 5′-GCATCATCTTCCTGGAGCAGTG-3′ |
AS, 5′-TGTAGTGGATCGTGCCTCGG-3′ | |
Cd14 | S, 5′-GTCTTCCTTGAACGACGACGAC-3′ |
AS, 5′-TAGAAGGTATTCCAGGCTGCGG-3′ | |
Gapdh | S, 5′-GCCTTCCGTGTTCCTACCC-3′ |
AS, 5′-CAGTGGGCCCTCAGATGC-3′ | |
Used in RT-PCR | |
Indo | S, 5′-GAAGGATCCTTGAAGACCAC-3′ |
AS, 5′-GAAGCTGCGATTTCCACCAA-3′ | |
Tyrobp | S, 5′-TGGTGCCTTCTGTTCCTTCC-3′ |
AS, 5′-TTGTTTCCGGGTCCCTTCC-3′ | |
Hcst | S, 5′-CCTCCTGTTCCTGCTTCTGC-3′ |
AS, 5′-GGGCGCATACATACAAACACC-3′ | |
Icsbp1 | S, 5′-CAGATCGACAGCAGCATGTACC-3′ |
AS, 5′-TTCAGAGCACAGCGTAACCTCG-3′ | |
Gapdh | S, 5′-AGCACAGTCCATGCCATCAC-3′ |
AS, 5′-TCCACCACCTGTTGCTGTA-3′ | |
TYROBP | S, 5′-ACTTGAACCCTGCAGCAGGC-3′ |
AS, 5′-CTCGGTCTCAGTGATACGCTG-3′ | |
HCST | S, 5′-CATGATGGTAGACCCAGTGTAGG-3′ |
AS, 5′-ACGATGAGCAGCGATGCCAC-3′ | |
IRF8 | S, 5′-GACAGTGGCTGATCGAGCAG-3′ |
AS, 5′-CTTCCAAGTGGCTGGTTCAGC-3′ | |
IRF1 | S, 5′-ATCACTCGGATGCGCATGAGAC-3′ |
AS, 5′-TACACTCGCACAGCTGAGCTG-3′ | |
Used in siRNA | |
Tyrobp | S, 5′-GGGACCCGGAAACAACACAtt-3′ |
AS, 5′-UGUGUUGUUUCCGGGUCCCtt-3′ | |
Icsbp1 | S, 5′-GGAUUACAAUCAGGAGGUGtt-3′ |
AS, 5′-CACCUCCUGAUUGUAAUCCtg-3′ | |
TYROBP | S, 5′-AACAGCGUAUCACUGAGACtt-3′ |
AS, 5′-GUCUCAGUGAUACGCUGUUtc-3′ | |
IRF8 | S, 5′-GGACUGAUUUGGGAGAAUGtt-3′ |
AS, 5′-CAUUCUCCCAAAUCAGUCCtg-3′ |
In siRNA, lower case letters indicate replacement with deoxynucleotides.
S indicates sense; AS, antisense.