Table 1

NF-κB profiles of MM cell lines

Systematic nameNF-κB index (10)NF-κB mutationNF-κB pathway
EJM 11.81 NIK Both 
ARP-1C* 11.66 NFKB2 Mostly alternative 
KMS20 11.64 CIAP Both 
Kp6 11.38 CYLD Mostly classical 
JMW1 11.36 TRAF2 Both 
KMS28PE* 11.24 CIAP Both 
MM.1 11.24 TRAF3 Both 
KMM1 11.19 NFKB1 Mostly classical 
LP1 11.17 TRAF3 Both 
KMS18 11.00 CIAP Both 
XG2 10.99 CD40 Both 
JK6L 10.95 NFKB2 Mostly alternative 
KMS12PE* 10.91 — Mostly classical 
JJN3 10.80 NIK Both 
OciMy5 10.74 NFKB1 Mostly classical 
OciMy1 10.70 TRAF3 Both 
Karpas620 10.70 — Mostly classical 
L363 10.44 NIK Both 
RPMI8226 10.44 TRAF3 Both 
U266 10.41 TRAF3 Both 
KMS12BM* 10.39 — Mostly classical 
ANBL6 10.38 TRAF3 Both 
KMS11 10.27 TRAF3 Both 
KMS26 10.24 TACI Mostly classical 
KMS28BM* 10.09 — Weak classical 
MM-S1 9.84 — Weak classical 
H1112 9.72 — Weak classical 
ARP-1* 9.68 — Not done 
KMS34 9.50 — Weak classical 
OciMy7 9.19 — Not done 
KHM1b 9.17 — Not done 
DP6 9.09 — Weak classical 
FR4 9.06 LTBR Weak both 
OPM2* 9.03 — Weak classical 
KHM11 8.97 — Weak classical 
OPM1* 8.88 — Not done 
Sachi 8.85 — Weak classical 
Delta47 8.75 — Not done 
UTMC2 8.68 — Not done 
PE2 8.53 — Not done 
SKMM1 8.47 — Weak both 
H929 8.37 — Weak classical 
JIM3 8.33 — Not done 
FLAM76 8.30 — Weak classical 
SKMM2 8.30 — Not done 
INA6 8.26 — Weak classical 
XG1 8.21 — Not done 
KAS6.1 8.20 — Not done 
XG6 8.13 — Not done 
XG7 7.90 — Not done 
PE1 7.79 — Weak classical 
Systematic nameNF-κB index (10)NF-κB mutationNF-κB pathway
EJM 11.81 NIK Both 
ARP-1C* 11.66 NFKB2 Mostly alternative 
KMS20 11.64 CIAP Both 
Kp6 11.38 CYLD Mostly classical 
JMW1 11.36 TRAF2 Both 
KMS28PE* 11.24 CIAP Both 
MM.1 11.24 TRAF3 Both 
KMM1 11.19 NFKB1 Mostly classical 
LP1 11.17 TRAF3 Both 
KMS18 11.00 CIAP Both 
XG2 10.99 CD40 Both 
JK6L 10.95 NFKB2 Mostly alternative 
KMS12PE* 10.91 — Mostly classical 
JJN3 10.80 NIK Both 
OciMy5 10.74 NFKB1 Mostly classical 
OciMy1 10.70 TRAF3 Both 
Karpas620 10.70 — Mostly classical 
L363 10.44 NIK Both 
RPMI8226 10.44 TRAF3 Both 
U266 10.41 TRAF3 Both 
KMS12BM* 10.39 — Mostly classical 
ANBL6 10.38 TRAF3 Both 
KMS11 10.27 TRAF3 Both 
KMS26 10.24 TACI Mostly classical 
KMS28BM* 10.09 — Weak classical 
MM-S1 9.84 — Weak classical 
H1112 9.72 — Weak classical 
ARP-1* 9.68 — Not done 
KMS34 9.50 — Weak classical 
OciMy7 9.19 — Not done 
KHM1b 9.17 — Not done 
DP6 9.09 — Weak classical 
FR4 9.06 LTBR Weak both 
OPM2* 9.03 — Weak classical 
KHM11 8.97 — Weak classical 
OPM1* 8.88 — Not done 
Sachi 8.85 — Weak classical 
Delta47 8.75 — Not done 
UTMC2 8.68 — Not done 
PE2 8.53 — Not done 
SKMM1 8.47 — Weak both 
H929 8.37 — Weak classical 
JIM3 8.33 — Not done 
FLAM76 8.30 — Weak classical 
SKMM2 8.30 — Not done 
INA6 8.26 — Weak classical 
XG1 8.21 — Not done 
KAS6.1 8.20 — Not done 
XG6 8.13 — Not done 
XG7 7.90 — Not done 
PE1 7.79 — Weak classical 

An NF-κB index was calculated using the average expression of 10 NF-κB target genes (“Genes comprising the NF-κB index in myeloma”). Mutations were reported previously,15,16 except for 2 new mutations reported here: (1) biallelic deletion of TRAF2 in JMW1 and (2) mutation of CYLD gene in Kp6. Contribution of the classical and alternative NF-κB pathways in MMCLs was estimated from steady-state levels of NF-κB subunits and/or effect of IKKβ inhibitor.

— indicates no mutation identified.

*

It is not known whether different mutations in some pairs of cell lines represent different tumor subclones or occurred after generation of the cell lines.