Table 1

Sequence variants identified in CXCR4

Nucleotide change*dbSNP MAFProtein changeFrequency (n)
Cases (n = 188)    
    rs56400844:157 A>C No data I53L 0.005 (1) 
    rs2228014: 414 C>T 0.043 Synonymous 0.037 (14) 
    415 G>A — V139I 0.005 (1) 
    584 A>G — W195X 0.005 (1) 
    1003 A>G — G335S 0.005 (1) 
    1295 C>G — 3′ UTR 0.005 (1) 
    1350 G>A — 3′ UTR 0.005 (1) 
    1430 C>T — 3′ UTR 0.005 (1) 
Controls (n = 213)    
    153 T>A — Synonymous 0.004 (1) 
    294 C>T — Synonymous 0.004 (1) 
    rs2228014: 414 C>T 0.043 Synonymous 0.08 (19) 
    783 C>T — Synonymous 0.004 (1) 
    1336 G>A — 3′ UTR 0.009(2) 
Nucleotide change*dbSNP MAFProtein changeFrequency (n)
Cases (n = 188)    
    rs56400844:157 A>C No data I53L 0.005 (1) 
    rs2228014: 414 C>T 0.043 Synonymous 0.037 (14) 
    415 G>A — V139I 0.005 (1) 
    584 A>G — W195X 0.005 (1) 
    1003 A>G — G335S 0.005 (1) 
    1295 C>G — 3′ UTR 0.005 (1) 
    1350 G>A — 3′ UTR 0.005 (1) 
    1430 C>T — 3′ UTR 0.005 (1) 
Controls (n = 213)    
    153 T>A — Synonymous 0.004 (1) 
    294 C>T — Synonymous 0.004 (1) 
    rs2228014: 414 C>T 0.043 Synonymous 0.08 (19) 
    783 C>T — Synonymous 0.004 (1) 
    1336 G>A — 3′ UTR 0.009(2) 

MAF indicates minor allele frequency of SNP in whites (as reported in dbSNP); —, not applicable; and UTR, untranslated region.

*

Nucleotide position is taken from the first base of the start codon; dbSNP accession number is shown where available.

No frequency data available for whites.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal