Table 1

Biacore analysis of SN8 framework variants

SN8 FW variantMurine framework residues present
Changes for stability in VL
CDR-H3 seqBivalent binding fold, Kdvariant / Kdchimera
VL
VH
447486769717375788028299495
SN8 graft      71 73  78      wt 56 
All vernier 4 47 48 67 69 71 73 75 78 80     wt 1 
1   48   71 73  78      wt 9.4 
2  47    71 73  78      wt 18 
3    67 69 71 73 75 78 80     wt 5.5 
4     69 71 73 75 78 80     wt 12 
5   48 67 69 71 73 75 78 80     wt 3.5 
6   48 67  71 73  78      wt 7.6 
7   48  69 71 73  78      wt 3.5 
8   48 67 69 71 73  78      wt 1.7 
9   48 67 69 71 73  78 80     wt 1.8 
10   48 67 69 71 73 75 78      wt NA 
11   48 67 69 71 73 75 78 80     H3-10 0.6 
12   48 67 69 71 73  78      H3-10 0.5 
13  47 48  69 71 73  78      wt 1.8 
14 4  48  69 71 73  78      wt 1.1 
15 4 47 48  69 71 73  78      wt 0.8 
16 4  48 67  71 73  78      wt 1.6 
17 4  48 67 69 71 73  78      wt 1.0 
18 4  48 67 69 71 73  78      H3-10 0.4 
19 4  48 67 69 71 73  78  S  E  H3-10 NDB 
20 4  48 67 69 71 73  78  S  N  H3-10 NDB 
21 4  48 67 69 71 73  78  E  E  H3-10 NDB 
22 4  48 67 69 71 73  78  E  N  H3-10 NDB 
23 4 47 48 67 69 71 73  78  S  E  H3-10 25 
24 4 47 48 67 69 71 73  78  S  N  H3-10 NDB 
25 4 47 48 67 69 71 73  78  E  E  H3-10 NDB 
26 4 47 48 67 69 71 73  78  E  N  H3-10 NDB 
27 4 47 48 67 69 71 73  78      H3-10  
28 4  48 67 69 71 73  78  E    H3-10 0.8 
29   48 67 69 71 73  78    N  H3-10 Very weak 
30 4 47 48 67 69 71 73  78   A   H3-10 1.3 
31 4 47 48 67 69 71 73  78   S   H3-10 1.0 
32 4 47 48 67 69 71 73  78  S    H3-10 1.6 
33 4 47 48 67 69 71 73  78     A H3-10 Very weak 
34 4 47 48 67 69 71 73  78    E  H3-10 NDB 
SN8 FW variantMurine framework residues present
Changes for stability in VL
CDR-H3 seqBivalent binding fold, Kdvariant / Kdchimera
VL
VH
447486769717375788028299495
SN8 graft      71 73  78      wt 56 
All vernier 4 47 48 67 69 71 73 75 78 80     wt 1 
1   48   71 73  78      wt 9.4 
2  47    71 73  78      wt 18 
3    67 69 71 73 75 78 80     wt 5.5 
4     69 71 73 75 78 80     wt 12 
5   48 67 69 71 73 75 78 80     wt 3.5 
6   48 67  71 73  78      wt 7.6 
7   48  69 71 73  78      wt 3.5 
8   48 67 69 71 73  78      wt 1.7 
9   48 67 69 71 73  78 80     wt 1.8 
10   48 67 69 71 73 75 78      wt NA 
11   48 67 69 71 73 75 78 80     H3-10 0.6 
12   48 67 69 71 73  78      H3-10 0.5 
13  47 48  69 71 73  78      wt 1.8 
14 4  48  69 71 73  78      wt 1.1 
15 4 47 48  69 71 73  78      wt 0.8 
16 4  48 67  71 73  78      wt 1.6 
17 4  48 67 69 71 73  78      wt 1.0 
18 4  48 67 69 71 73  78      H3-10 0.4 
19 4  48 67 69 71 73  78  S  E  H3-10 NDB 
20 4  48 67 69 71 73  78  S  N  H3-10 NDB 
21 4  48 67 69 71 73  78  E  E  H3-10 NDB 
22 4  48 67 69 71 73  78  E  N  H3-10 NDB 
23 4 47 48 67 69 71 73  78  S  E  H3-10 25 
24 4 47 48 67 69 71 73  78  S  N  H3-10 NDB 
25 4 47 48 67 69 71 73  78  E  E  H3-10 NDB 
26 4 47 48 67 69 71 73  78  E  N  H3-10 NDB 
27 4 47 48 67 69 71 73  78      H3-10  
28 4  48 67 69 71 73  78  E    H3-10 0.8 
29   48 67 69 71 73  78    N  H3-10 Very weak 
30 4 47 48 67 69 71 73  78   A   H3-10 1.3 
31 4 47 48 67 69 71 73  78   S   H3-10 1.0 
32 4 47 48 67 69 71 73  78  S    H3-10 1.6 
33 4 47 48 67 69 71 73  78     A H3-10 Very weak 
34 4 47 48 67 69 71 73  78    E  H3-10 NDB 

wt indicates wild type; N, asparagine; A, alanine; S, serine; E, glutamine; and NDB, no detectable binding.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal