Table 1

Pristimerin gene expression signature-response genes at 4 hours

Probe-set identifier U133_plus_2Gene symbolFold change in expression
H929U266Mean
Heat shock/ER stress response proteins     
    213418_at HSPA6 (HSP70B′) 69.5 94.2 81.9 
    117_at HSPA6 (HSP70B′) 4.0 6.6 5.3 
    202581_at HSPA1B (HSP70-1) 15.4 13.0 14.2 
    200800_s_at HSPA1A; HSPA1B (HSP70-1) 15.9 11.9 13.9 
    206976_s_at HSPH1 (HSP105) 2.1 3.0 2.6 
    208744_x_at HSPH1 (HSP105) 2.2 2.6 2.4 
    235573_at HSPH1 (HSP105) 1.7 1.9 1.8 
    211969_at HSPCA (HSP90AA) 2.3 2.3 2.3 
    211968_s_at HSPCA (HSP90AA) 2.1 2.2 2.2 
    210211_s_at HSPCA (HSP90AA) 2.2 2.1 2.1 
    214328_s_at HSPCA (HSP90AA) 2.0 1.8 1.9 
    241716_at HSPD1 (HSP60) 2.0 1.8 1.9 
    200666_s_at HSP40/DNAJB1 2.9 4.0 3.5 
    200664_s_at HSP40/DNAJB1 2.5 3.6 3.1 
    200880_at HSP40/DNAJA1 1.8 1.7 1.8 
    200881_s_at HSP40/DNAJA1 1.8 1.6 1.7 
    209383_at DDIT3 (CHOP) 7.0 1.6 4.3 
    202887_s_at DDIT4 (REDD1) 3.6 2.2 2.9 
    207714_s_at HSP47/SERPINH1 2.5 2.1 2.3 
Ubiquitin/ligases     
    208980_s_at UBC 1.8 1.8 1.8 
    227558_at CBX4 1.7 1.6 1.7 
    224186_s_at RNF123 1.8 1.5 1.7 
Apoptosis regulation     
    217911_s_at BAG3 2.9 5.2 4.0 
    241876_at MDM4 0.61 0.67 0.64 
    206665_s_at BCL2L1 0.63 0.65 0.64 
Solute/ion transport     
    219270_at MGC4504 4.1 1.9 3.0 
    209921_at SLC7A11 3.4 1.7 2.6 
    217678_at SLC7A11 2.9 1.8 2.3 
    212907_at SLC30A1 1.9 1.8 1.9 
    213164_at SLC5A3 1.8 1.6 1.7 
    232280_at SLC25A29 0.62 0.68 0.65 
    1559993_at SFXN3 0.61 0.61 0.61 
    212564_at KCTD2 0.51 0.65 0.58 
Transcription factors/regulation     
    202672_s_at ATF3 3.3 1.6 2.4 
    212501_at CEBPB 2.1 1.5 1.8 
    201466_s_at JUN 2.0 1.5 1.8 
    202146_at IFRD1 2.3 1.7 2.0 
    1560419_at CHD4 0.68 0.63 0.66 
Other     
    203438_at STC2 3.8 2.0 2.9 
    203439_s_at STC2 2.8 2.2 2.5 
    210587_at INHBE 4.0 1.7 2.8 
    239331_at  3.3 1.6 2.4 
    228655_at  2.5 2.2 2.3 
    223196_s_at SESN2 3.0 1.7 2.3 
    223195_s_at SESN2 2.7 1.7 2.2 
    217127_at CTH 2.9 1.8 2.3 
    225434_at DEDD2 2.5 2.1 2.3 
    237631_at  2.0 1.6 1.8 
    229313_at  1.9 1.5 1.7 
    1556072_at FLJ40542 1.8 1.5 1.7 
    241940_at ABHD3 1.8 1.5 1.7 
    230174_at LYPLAL1 1.7 1.6 1.7 
    217529_at LOC401394; LOC402578 0.70 0.62 0.66 
    220873_at REPS2 0.69 0.63 0.66 
    1561749_at  0.61 0.66 0.64 
    232649_at COLM 0.61 0.63 0.62 
    208016_s_at AGTR1 0.48 0.55 0.51 
    244887_at RGS13 0.54 0.47 0.51 
    1562657_a_at C10orf90 0.56 0.45 0.51 
Probe-set identifier U133_plus_2Gene symbolFold change in expression
H929U266Mean
Heat shock/ER stress response proteins     
    213418_at HSPA6 (HSP70B′) 69.5 94.2 81.9 
    117_at HSPA6 (HSP70B′) 4.0 6.6 5.3 
    202581_at HSPA1B (HSP70-1) 15.4 13.0 14.2 
    200800_s_at HSPA1A; HSPA1B (HSP70-1) 15.9 11.9 13.9 
    206976_s_at HSPH1 (HSP105) 2.1 3.0 2.6 
    208744_x_at HSPH1 (HSP105) 2.2 2.6 2.4 
    235573_at HSPH1 (HSP105) 1.7 1.9 1.8 
    211969_at HSPCA (HSP90AA) 2.3 2.3 2.3 
    211968_s_at HSPCA (HSP90AA) 2.1 2.2 2.2 
    210211_s_at HSPCA (HSP90AA) 2.2 2.1 2.1 
    214328_s_at HSPCA (HSP90AA) 2.0 1.8 1.9 
    241716_at HSPD1 (HSP60) 2.0 1.8 1.9 
    200666_s_at HSP40/DNAJB1 2.9 4.0 3.5 
    200664_s_at HSP40/DNAJB1 2.5 3.6 3.1 
    200880_at HSP40/DNAJA1 1.8 1.7 1.8 
    200881_s_at HSP40/DNAJA1 1.8 1.6 1.7 
    209383_at DDIT3 (CHOP) 7.0 1.6 4.3 
    202887_s_at DDIT4 (REDD1) 3.6 2.2 2.9 
    207714_s_at HSP47/SERPINH1 2.5 2.1 2.3 
Ubiquitin/ligases     
    208980_s_at UBC 1.8 1.8 1.8 
    227558_at CBX4 1.7 1.6 1.7 
    224186_s_at RNF123 1.8 1.5 1.7 
Apoptosis regulation     
    217911_s_at BAG3 2.9 5.2 4.0 
    241876_at MDM4 0.61 0.67 0.64 
    206665_s_at BCL2L1 0.63 0.65 0.64 
Solute/ion transport     
    219270_at MGC4504 4.1 1.9 3.0 
    209921_at SLC7A11 3.4 1.7 2.6 
    217678_at SLC7A11 2.9 1.8 2.3 
    212907_at SLC30A1 1.9 1.8 1.9 
    213164_at SLC5A3 1.8 1.6 1.7 
    232280_at SLC25A29 0.62 0.68 0.65 
    1559993_at SFXN3 0.61 0.61 0.61 
    212564_at KCTD2 0.51 0.65 0.58 
Transcription factors/regulation     
    202672_s_at ATF3 3.3 1.6 2.4 
    212501_at CEBPB 2.1 1.5 1.8 
    201466_s_at JUN 2.0 1.5 1.8 
    202146_at IFRD1 2.3 1.7 2.0 
    1560419_at CHD4 0.68 0.63 0.66 
Other     
    203438_at STC2 3.8 2.0 2.9 
    203439_s_at STC2 2.8 2.2 2.5 
    210587_at INHBE 4.0 1.7 2.8 
    239331_at  3.3 1.6 2.4 
    228655_at  2.5 2.2 2.3 
    223196_s_at SESN2 3.0 1.7 2.3 
    223195_s_at SESN2 2.7 1.7 2.2 
    217127_at CTH 2.9 1.8 2.3 
    225434_at DEDD2 2.5 2.1 2.3 
    237631_at  2.0 1.6 1.8 
    229313_at  1.9 1.5 1.7 
    1556072_at FLJ40542 1.8 1.5 1.7 
    241940_at ABHD3 1.8 1.5 1.7 
    230174_at LYPLAL1 1.7 1.6 1.7 
    217529_at LOC401394; LOC402578 0.70 0.62 0.66 
    220873_at REPS2 0.69 0.63 0.66 
    1561749_at  0.61 0.66 0.64 
    232649_at COLM 0.61 0.63 0.62 
    208016_s_at AGTR1 0.48 0.55 0.51 
    244887_at RGS13 0.54 0.47 0.51 
    1562657_a_at C10orf90 0.56 0.45 0.51 
View Large