ELISPOT assay before and after short-term expansion
. | Replicate . | Prame 100 . | Prame 142 . | Peptide-specific ELISPOTs (spots/million PBMCs) . | GP100/CAP-1–6D . | CMV . | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Prame 300 . | Prame 425 . | No peptide . | |||||||||||||
D1/D7 . | D1 . | D7 . | D1 . | D7 . | D1 . | D7 . | D1 . | D7 . | . | . | D1 . | D7 . | D1 . | D7 . | |
AML | |||||||||||||||
1 | 6/6 | NEG | 21 ± 6 | NEG | 28 ± 7 | 131 ± 11 | 72 ± 15 | NEG | NEG | 3 | 3 | NEG | NEG | 330 ± 36 | 3500 ± 550 |
7 | 5/5 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | 80 | 1 590 | NEG | NEG | NEG | NEG |
10 | 6/6 | NEG | 1410 ± 145 | 26 ± 6 | 230 ± 65 | 280 ± 60 | 550 ± 60 | NEG | 137 ± 45 | 2 | 50 | NEG | 660 ± 80 | 180 ± 52 | 7000 ± 165 |
ALL | |||||||||||||||
21 | 5/5 | NEG | 1300 ± 65 | NEG | 2100 ± 35 | 2460 ± 40 | > 14 300 | NEG | 2500 ± 40 | 110 | 760 | NEG | 960 ± 90 | 1000 ± 110 | ND |
22 | 5/5 | NEG | NEG | NEG | 80 ± 23 | NEG | NEG | NEG | 150 ± 30 | 1 | 23 | NEG | 88 ± 31 | 25 ± 5 | ND |
23 | 5/5 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | 2 | 12 | NEG | NEG | NEG | NEG |
24 | 5/5 | NEG | 1150 ± 200 | NEG | 3400 ± 360 | NEG | 3200 ± 290 | NEG | NEG | 24 | 320 | 36 ± 8 | NEG | 2950 ± 170 | ND |
25 | 5/5 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | 660 ± 110 | NEG | 220 ± 60 | 18 | 95 | NEG | NEG | 540 ± 105 | ND |
CML | |||||||||||||||
6/6 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | 110 ± 20 | NEG | NEG | 70 | 65 | NEG | NEG | NEG | 282 ± 96 | |
6/6 | NEG | 28 ± 8 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | 16 | 16 | NEG | NEG | 77 ± 26 | 205 ± 10 | |
6/6 | NEG | 2100 ± 300 | NEG | 2180 ± 180 | NEG | 550 ± 110 | NEG | 2220 ± 190 | 110 | 100 | NEG | 330 ± 100 | NEG | NEG | |
Donors | |||||||||||||||
31 | 5/5 | NEG | NEG | NEG | NEG | 176 ± 27 | NEG | NEG | NEG | 150 | 135 | NEG | NEG | NEG | NEG |
35 | 5/5 | NEG | NEG | NEG | 980 ± 44 | 103 ± 40 | NEG | NEG | NEG | 77 | 130 | NEG | NEG | 303 ± 39 | > 3800 |
41 | 5/5 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | 38 | 775 | NEG | 167 ± 94 | ND | |
42 | 4/5 | NEG | NEG | NEG | NEG | 99 ± 22 | 1630 ± 83 | NEG | NEG | 81 | 1126 | NEG | NEG | NEG | NEG |
. | Replicate . | Prame 100 . | Prame 142 . | Peptide-specific ELISPOTs (spots/million PBMCs) . | GP100/CAP-1–6D . | CMV . | |||||||||
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Prame 300 . | Prame 425 . | No peptide . | |||||||||||||
D1/D7 . | D1 . | D7 . | D1 . | D7 . | D1 . | D7 . | D1 . | D7 . | . | . | D1 . | D7 . | D1 . | D7 . | |
AML | |||||||||||||||
1 | 6/6 | NEG | 21 ± 6 | NEG | 28 ± 7 | 131 ± 11 | 72 ± 15 | NEG | NEG | 3 | 3 | NEG | NEG | 330 ± 36 | 3500 ± 550 |
7 | 5/5 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | 80 | 1 590 | NEG | NEG | NEG | NEG |
10 | 6/6 | NEG | 1410 ± 145 | 26 ± 6 | 230 ± 65 | 280 ± 60 | 550 ± 60 | NEG | 137 ± 45 | 2 | 50 | NEG | 660 ± 80 | 180 ± 52 | 7000 ± 165 |
ALL | |||||||||||||||
21 | 5/5 | NEG | 1300 ± 65 | NEG | 2100 ± 35 | 2460 ± 40 | > 14 300 | NEG | 2500 ± 40 | 110 | 760 | NEG | 960 ± 90 | 1000 ± 110 | ND |
22 | 5/5 | NEG | NEG | NEG | 80 ± 23 | NEG | NEG | NEG | 150 ± 30 | 1 | 23 | NEG | 88 ± 31 | 25 ± 5 | ND |
23 | 5/5 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | 2 | 12 | NEG | NEG | NEG | NEG |
24 | 5/5 | NEG | 1150 ± 200 | NEG | 3400 ± 360 | NEG | 3200 ± 290 | NEG | NEG | 24 | 320 | 36 ± 8 | NEG | 2950 ± 170 | ND |
25 | 5/5 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | 660 ± 110 | NEG | 220 ± 60 | 18 | 95 | NEG | NEG | 540 ± 105 | ND |
CML | |||||||||||||||
6/6 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | 110 ± 20 | NEG | NEG | 70 | 65 | NEG | NEG | NEG | 282 ± 96 | |
6/6 | NEG | 28 ± 8 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | 16 | 16 | NEG | NEG | 77 ± 26 | 205 ± 10 | |
6/6 | NEG | 2100 ± 300 | NEG | 2180 ± 180 | NEG | 550 ± 110 | NEG | 2220 ± 190 | 110 | 100 | NEG | 330 ± 100 | NEG | NEG | |
Donors | |||||||||||||||
31 | 5/5 | NEG | NEG | NEG | NEG | 176 ± 27 | NEG | NEG | NEG | 150 | 135 | NEG | NEG | NEG | NEG |
35 | 5/5 | NEG | NEG | NEG | 980 ± 44 | 103 ± 40 | NEG | NEG | NEG | 77 | 130 | NEG | NEG | 303 ± 39 | > 3800 |
41 | 5/5 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | 38 | 775 | NEG | 167 ± 94 | ND | |
42 | 4/5 | NEG | NEG | NEG | NEG | 99 ± 22 | 1630 ± 83 | NEG | NEG | 81 | 1126 | NEG | NEG | NEG | NEG |
In all subjects, cross-reactivity was excluded by testing responses against the irrelevant peptides, GP100 or CAP1–6D. The absolute number of INF-γ spots from negative control wells (T2 cells with no peptide) is included. A T-cell response was defined as positive if there was a minimum of 20 peptide-specific spots in 106 PBMCs (after subtracting the number of spots in negative control wells), if the number of spots in peptide-exposed PBMCs was 2-fold or more higher than the number of spots the number of spots in negative control wells and statistically significantly different from the control by Student t test (P < .05). The mean plus or minus SEM values in positive wells represent spot numbers after subtracting the number of spots in negative control wells. The figures in bold represent positive CD8+ T-cell responses to stimulation with PRAME peptide.
D1 indicates assays performed prior to in vitro expansion; D7, assays performed after 7 days of in vitro expansion; and ND, not done.