Splenic B cells in IL-7−/− K14-TSLP Tg mice display N nucleotide additions at VDJ junctions
| Clone . | V . | P . | N1 . | P . | D . | P . | N2 . | P . | JH4 . | D element . |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3 | tgtaccgg | — | gattacg | gggc | attactatgctatggactactgg | SP2.2*01 | ||||
| 4 | tgtgcaaga | — | tggg | gg | tactatgctatggactactgg | DQ52*01 | ||||
| 5 | tgtgcaaga | tc | ctcg | tatgattac | gga | atggactactgg | SP2.2*01 | |||
| 10 | tgtgcaaga | aggg | ttattactacgg | c | ttactatgctatggactactgg | FL16.1*01 | ||||
| 12 | tgtgcaaga | gg | gg | cctactatagtaac | ccagg | ggactactgg | SP2.x*01 | |||
| 14 | tgtgcaaga | cgg | agtaac | — | tacgatgctatggactactgg | SP2.x*01 | ||||
| 16 | tgtgcaaga | gagaagg | attactacggtagtagct | — | ctatggactactgg | FL16.1*01 | ||||
| 19 | tgtgcaaga | aacccc | ctacgg | G | actatgctatggactactgg | FL16.2*01 | ||||
| 20 | tgtgc | cct | ctatga | C | tactatgctatggactactgg | SP2.2*01, SP2.9*01 | ||||
| 23 | tgtgcgag | ggacaca | gggct | — | ctatgctatggactactgg | ST4 | ||||
| 24 | tgtgcaaga | tccc | gta | Agaagg | atgctatggactactgg | FL16.1*01, SP2.x,.1,.5,.7,.8 | ||||
| 25 | tgtgcaaga | cg | ggga | G | atgctatggactactgg | DQ52*01 | ||||
| 28 | tgtgcgaga | aatttcgcc | tattactacggtagtag | g | actatgctatggactactgg | FL16.1*01 | ||||
| 32 | tgtgcaaga | t | gggattttag | cggta | g | ttactatgctatggactactgg | FL16.1*01 | |||
| 40 | tgtgcaaga | gaga | atgattacgac | g | gg | tactatgctatggactactgg | SP2.2*01 | |||
| 50 | tgtgcaaga | a | aactggg | g | gcg | actatgctatggactactgg | DQ52*01 | |||
| 51 | tgtgcaaga | — | attactacggtagtag | ctc | actatgctatggactactgg | FL16.1*01 | ||||
| 56 | tgtgcaa | tgacg | attactacggtagtagc | ggggg | actatgctatggactactgg | FL16.1*01 | ||||
| 57 | tgtgcaaga | aggaatcg | agttact | tggg | atgctatggactactgg | SP2.12*01 | ||||
| 58 | tgtgcaaga | gga | tattactacggtagtagc | ctctatggg | tatgctatggactactgg | FL16.1*01 | ||||
| 64 | tgtgc | c | ga | tctactatggtaac | cacggagggg | tgctatggactactgg | SP2.1*01 | |||
| 65 | tgtgcaaga | gcg | tattactacggtag | — | tgctatggactactgg | FL16.1*01 | ||||
| 67 | tgtgcaaga | tc | ggtgg | gattacgac | agaaggggtc | ttactatgctatggactactgg | SP2.2*01 | |||
| 73 | tgtgcaaga | atggaggg | tac | acttct | ctatgctatggactactgg | All, except DQ52 | ||||
| 75 | tgtgcaaga | gaga | atgattacgac | g | gg | tactatgctatggactactgg | SP2.2*01 | |||
| 80 | tgtgcaaga | tggac | tactacggtagtagct | gaaggaggg | atggactactgg | FL16.1*01 |
| Clone . | V . | P . | N1 . | P . | D . | P . | N2 . | P . | JH4 . | D element . |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3 | tgtaccgg | — | gattacg | gggc | attactatgctatggactactgg | SP2.2*01 | ||||
| 4 | tgtgcaaga | — | tggg | gg | tactatgctatggactactgg | DQ52*01 | ||||
| 5 | tgtgcaaga | tc | ctcg | tatgattac | gga | atggactactgg | SP2.2*01 | |||
| 10 | tgtgcaaga | aggg | ttattactacgg | c | ttactatgctatggactactgg | FL16.1*01 | ||||
| 12 | tgtgcaaga | gg | gg | cctactatagtaac | ccagg | ggactactgg | SP2.x*01 | |||
| 14 | tgtgcaaga | cgg | agtaac | — | tacgatgctatggactactgg | SP2.x*01 | ||||
| 16 | tgtgcaaga | gagaagg | attactacggtagtagct | — | ctatggactactgg | FL16.1*01 | ||||
| 19 | tgtgcaaga | aacccc | ctacgg | G | actatgctatggactactgg | FL16.2*01 | ||||
| 20 | tgtgc | cct | ctatga | C | tactatgctatggactactgg | SP2.2*01, SP2.9*01 | ||||
| 23 | tgtgcgag | ggacaca | gggct | — | ctatgctatggactactgg | ST4 | ||||
| 24 | tgtgcaaga | tccc | gta | Agaagg | atgctatggactactgg | FL16.1*01, SP2.x,.1,.5,.7,.8 | ||||
| 25 | tgtgcaaga | cg | ggga | G | atgctatggactactgg | DQ52*01 | ||||
| 28 | tgtgcgaga | aatttcgcc | tattactacggtagtag | g | actatgctatggactactgg | FL16.1*01 | ||||
| 32 | tgtgcaaga | t | gggattttag | cggta | g | ttactatgctatggactactgg | FL16.1*01 | |||
| 40 | tgtgcaaga | gaga | atgattacgac | g | gg | tactatgctatggactactgg | SP2.2*01 | |||
| 50 | tgtgcaaga | a | aactggg | g | gcg | actatgctatggactactgg | DQ52*01 | |||
| 51 | tgtgcaaga | — | attactacggtagtag | ctc | actatgctatggactactgg | FL16.1*01 | ||||
| 56 | tgtgcaa | tgacg | attactacggtagtagc | ggggg | actatgctatggactactgg | FL16.1*01 | ||||
| 57 | tgtgcaaga | aggaatcg | agttact | tggg | atgctatggactactgg | SP2.12*01 | ||||
| 58 | tgtgcaaga | gga | tattactacggtagtagc | ctctatggg | tatgctatggactactgg | FL16.1*01 | ||||
| 64 | tgtgc | c | ga | tctactatggtaac | cacggagggg | tgctatggactactgg | SP2.1*01 | |||
| 65 | tgtgcaaga | gcg | tattactacggtag | — | tgctatggactactgg | FL16.1*01 | ||||
| 67 | tgtgcaaga | tc | ggtgg | gattacgac | agaaggggtc | ttactatgctatggactactgg | SP2.2*01 | |||
| 73 | tgtgcaaga | atggaggg | tac | acttct | ctatgctatggactactgg | All, except DQ52 | ||||
| 75 | tgtgcaaga | gaga | atgattacgac | g | gg | tactatgctatggactactgg | SP2.2*01 | |||
| 80 | tgtgcaaga | tggac | tactacggtagtagct | gaaggaggg | atggactactgg | FL16.1*01 |
Sequences of VHJ558-JH4 rearrangements from 26 individual PCR fragments derived from sorted B220+CD19+ splenic B cells of 8-week-old IL-7−/− K14-TSLP Tg mice are shown.
— indicates no N nucleotide addition.