Table 2.

Gene expression profile in NB4 cells treated with ATRA, ST1346, or the combination of the two compounds

8 hours72 hours
ControlATRAST1346ATRA + ST1346ControlATRAST1346ATRA + ST1346
Group A         
 ICAM-1 (J03132) 1 368 7 530* 1 491 16 649* <1 000 7 909* <1 000 20 326* 
 MCP-1 (M24545) <1 000 4 734* 1 062 7 668* <1 000 23 911* <1 000 51 927* 
 Id-2 (M97796) <1 000 1 773* <1 000 3 023* <1 000 2 357* <1 000 5 518* 
 Mlh1 (U07418) 16 128 9 100 14 897 9 913 <1 000 2 261* <1 000 4 713* 
 MAPKAP-K2 (U12779) 2 368 1 836 1 826 4 552* <1 000 2 253* <1 000 7 329* 
 Cathepsin D (M11233) 1 712 1 753 2 331 3 963* 3 604 16 269* 3 606 6 787* 
 FLI-1 (M93255) <1 000 <1 000 <1 000 1 308* <1 000 5 949* 8 474* 9 568* 
 MRP14 (X06233) <1 000 3 399* <1 000 3 889* <1 000 6 933* <1 000 12 376* 
 MRP8 (X06234) <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 11 299* <1 000 23 344* 
 MNDA (M81750) <1 000 1 607* <1 000 1 583* <1 000 2 234* <1 000 6 609* 
 IRF7 (U73036) <1 000 2 412* <1 000 1 726* <1 000 2 510* <1 000 4 216* 
 Net (Z36715) <1 000 1 038 <1 000 1 612* <1 000 2 095* 1 656 6 806* 
 PRK1 (U33053) <1 000 3 182* <1 000 1 700* 1 364 <1 000 1 097 6 899* 
 G-CSF receptor (M59818) 1 072 3 370* <1 000 3 483* 2 428 1 782 3 095 8 136* 
 LIM-kinase (D26309) <1 000 3 374* <1 000 1 912* 1 084 1 186 1 641 5 484* 
 LD-78 (D10924) <1 000 2 570* <1 000 1 951* <1 000 <1 000 1 710 3 730* 
 c-fgr (M19722) 1 116 2 884* <1 000 4 025* 1 296 1 323 <1 000 3 963* 
 PKC delta (D10495) 3 132 5 548* 3 062 5 568* <1 000 <1 000 <1 000 3 080* 
 Tyk-2 (X54637) 2 784 3 842 2 288 2 362 2 104 3 109 2 524 5 180* 
 EBI (U24166) 1 948 2 286 1 418 3 518* 2 752 7 422* 2 553 8 378* 
Group B         
 Cyclin-B (M25753) 2 260 4 746* 3 414 4 814* 4 696 9 553* 8 794 5 577 
 P19 INK (U40343) <1 000 7 222* 1 019 6 065* 2 016 2 800 1 698 1 493 
 Integrin alpha-4 (L12002) 2 308 2 870 2 521 3 127 4 379 8 720* 5 548 7 428 
 TNF receptor (M32315) <1 000 2 728* <1 000 1 654* <1 000 2 453* <1 000 <1 000 
 GST pi (M24485) 18 472 13 777 13 877 14 985 <1 000 3 392* 2 829 3 957* 
 Neutrophil elastase inhibitor (M93056) <1 000 1 492* <1 000 1 794* <1 000 5 640* <1 000 <1 000 
 G0S19-1 (M23452) <1 000 2 298* 1 541 1 514* <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 
 Glutharedoxin (X76648) <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 4 096* <1 000 2 280* 
 RALB (M35416) <1 000 1 687 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 
 Glial growth factor (L12261) <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 3 581* <1 000 <1 000 
 c-sis (X02744) <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 3 253* <1 000 <1 000 
 Estrogen sulfotransferase (U08098) <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 4 736* <1 000 <1 000 
 NKSF (M65291) <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 3 912* <1 000 <1 000 
 S19 ribosomal protein (M81757) 4 772 12 426* 8 619 7 603 3 360 3 759 2 511 4 177 
 Cathepsin H (X07549) 3 996 2 076† 4 241 3 384 <1 000 4 589* <1 000 <1 000 
 Stromelysin-3 (X57766) 2 992 5 591* 2 969 2 912 4 116 1 880† 3 519 3 053 
 DNA-binding protein A (M24069) <1 000 1 414* 2 530* 1 305* 2 556 <1 000† 2 634 <1 000† 
 Nucleobindin (M96824) <1 000 2 098* 2 342* 1 623* 1 608 1 924 3 594* 1 944 
Group C         
 c-raf (X03484) <1 000 1 026 <1 000 1 439* <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 
 APNH1 (M81768) <1 000 <1 000 1 072 1 452* <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 
 Lnk (AF055581) <1 000 <1 000 <1 000 1 334* <1 000 <1 000 <1 000 2 262* 
 hRlf beta subunit (D38073) <1 000 <1 000 <1 000 2 117* 2 792 2 131 1 626 <1 000† 
 RbAp46 (U35143) <1 000 <1 000 <1 000 1 368* 1 300 <1 000 <1 000 5 810* 
 CD19 (M21097) <1 000 <1 000 <1 000 1 563* <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 
 VEGF (M32977) <1 000 <1 000 <1 000 1 321* 6 228 4 326 6 453 1 116† 
 CLN2 protease (AF017456) <1 000 <1 000 <1 000 1 597* 6 812 6 433 1 928 <1 000† 
 MAPKAP (U09578) 2 484 1 019† 1 949 1 422 3 084 1 433† 2 416 7 880* 
 RAB7 GTPase (X93499) 3 080 1 212† 1 929 2 518 <1 000 <1 000 <1 000 2 237* 
Group D         
 Cathepsin C (X87212) 2 628 <1 000 2 693 2 052 <1 000 <1 000 3 361* 2 979* 
 Heat shock factor 1 (M64673) <1 000 <1 000 3 067* 1 912* <1 000 <1 000 5 753* 1 723* 
 Repl. factor C (M87339) <1 000 <1 000 1 822* 2 240* 4 044 4 664 4 500 <1 000† 
Group E         
 RanGTPase act. Protein 1 (X82260) 2 212 1 078† 1 830 <1 000† <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 
 c-myc (V00568) 10 500 4 884† 10 851 4 436† 7 560 <1 000† 6 526 <1 000† 
 TNF (X01394) 8 292 3 265† 7 822 3 801† 2 424 2 345 2 500 <1 000† 
 IL-2 receptor (X01057) 5 832 2 716† 5 537 3 039† 15 236 3 749† 14 835 4 269† 
 IL-2 receptor gamma (D11086) 3 424 1 433† 3 132 1 977† 2 812 1 573 4 410 3 173 
 HSP27 (X54079) 15 452 5 319† 14 741 7 652† 5 076 3 226 3 421 3 161 
 Histidine decarboxylase (X54297) 2 080 1 074† 2 398 <1 000† 2 512 <1 000† 3 920 1 901† 
 Repl. factor C (M87338) 3 016 1 733 2 597 1 081† 9 048 1 260† 4 718 4 994 
Control ATRA ST1346 ATRA + ST1346 Control ATRA ST1346 ATRA + ST1346  
 TRRAP (AF076974) 3 920 1 903† 4 068 2 316† 1 432 2 371 8 519* <1 000† 
 ALG-2 (AF035606) 4 976 2 712† 5 929 3 433 2 840 3 304 6 438* <1 000 
 HER-3 (M34309) 1 616 <1 000† 1 773 <1 000† 3 256 <1 000† 3 089 <1 000† 
 HDLCl (U32944) 7 220 3 320† 8 343 5 583 5 136 2 104† 4 859 3 897 
 CDC47 homolog (D55716) 4 692 2 345† 4 112 3 176 7 288 2 132† 5 690 <1 000† 
 Uracil-DNA glyc. (X15653) 2 480 <1 000† 3 032 1 534† 14 940 <1 000† 3 818† <1 000† 
 EGR1(X52541) 2 344 <1 000† 1 869 2 269 3 316 <1 000† 10 176* 1 174† 
 HSE 70 (Y00371) 4 608 1 891† 5 417 4 537 10 164 2 288† 11 668 5 663† 
 Hepatoma-derived GF (D16431) 4 660 1 149† 4 019 2 316† 7 772 6 226 11 680 5 565 
 IL-1 (K02770) 4 104 2 092 3 601 1 676† <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 
 TAXREB 67 (D90209) 7 272 6 709 8 802 6 375 5 772 2 754† 7 088 3 241† 
Group F 
 ARF1 (M36340) 2 148 2 483 1 793 1 166† 2 524 2 525 4 045 4 717 
 DNA pol. Delta (M80397) 2 656 1 832 2 188 1 078† 1 272 <1 000 1 571 1 571 
 M-CSF (M37435) 10 608 6 353 10 423 5 189† 4 184 3 453 2 073 <1 000† 
8 hours72 hours
ControlATRAST1346ATRA + ST1346ControlATRAST1346ATRA + ST1346
Group A         
 ICAM-1 (J03132) 1 368 7 530* 1 491 16 649* <1 000 7 909* <1 000 20 326* 
 MCP-1 (M24545) <1 000 4 734* 1 062 7 668* <1 000 23 911* <1 000 51 927* 
 Id-2 (M97796) <1 000 1 773* <1 000 3 023* <1 000 2 357* <1 000 5 518* 
 Mlh1 (U07418) 16 128 9 100 14 897 9 913 <1 000 2 261* <1 000 4 713* 
 MAPKAP-K2 (U12779) 2 368 1 836 1 826 4 552* <1 000 2 253* <1 000 7 329* 
 Cathepsin D (M11233) 1 712 1 753 2 331 3 963* 3 604 16 269* 3 606 6 787* 
 FLI-1 (M93255) <1 000 <1 000 <1 000 1 308* <1 000 5 949* 8 474* 9 568* 
 MRP14 (X06233) <1 000 3 399* <1 000 3 889* <1 000 6 933* <1 000 12 376* 
 MRP8 (X06234) <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 11 299* <1 000 23 344* 
 MNDA (M81750) <1 000 1 607* <1 000 1 583* <1 000 2 234* <1 000 6 609* 
 IRF7 (U73036) <1 000 2 412* <1 000 1 726* <1 000 2 510* <1 000 4 216* 
 Net (Z36715) <1 000 1 038 <1 000 1 612* <1 000 2 095* 1 656 6 806* 
 PRK1 (U33053) <1 000 3 182* <1 000 1 700* 1 364 <1 000 1 097 6 899* 
 G-CSF receptor (M59818) 1 072 3 370* <1 000 3 483* 2 428 1 782 3 095 8 136* 
 LIM-kinase (D26309) <1 000 3 374* <1 000 1 912* 1 084 1 186 1 641 5 484* 
 LD-78 (D10924) <1 000 2 570* <1 000 1 951* <1 000 <1 000 1 710 3 730* 
 c-fgr (M19722) 1 116 2 884* <1 000 4 025* 1 296 1 323 <1 000 3 963* 
 PKC delta (D10495) 3 132 5 548* 3 062 5 568* <1 000 <1 000 <1 000 3 080* 
 Tyk-2 (X54637) 2 784 3 842 2 288 2 362 2 104 3 109 2 524 5 180* 
 EBI (U24166) 1 948 2 286 1 418 3 518* 2 752 7 422* 2 553 8 378* 
Group B         
 Cyclin-B (M25753) 2 260 4 746* 3 414 4 814* 4 696 9 553* 8 794 5 577 
 P19 INK (U40343) <1 000 7 222* 1 019 6 065* 2 016 2 800 1 698 1 493 
 Integrin alpha-4 (L12002) 2 308 2 870 2 521 3 127 4 379 8 720* 5 548 7 428 
 TNF receptor (M32315) <1 000 2 728* <1 000 1 654* <1 000 2 453* <1 000 <1 000 
 GST pi (M24485) 18 472 13 777 13 877 14 985 <1 000 3 392* 2 829 3 957* 
 Neutrophil elastase inhibitor (M93056) <1 000 1 492* <1 000 1 794* <1 000 5 640* <1 000 <1 000 
 G0S19-1 (M23452) <1 000 2 298* 1 541 1 514* <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 
 Glutharedoxin (X76648) <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 4 096* <1 000 2 280* 
 RALB (M35416) <1 000 1 687 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 
 Glial growth factor (L12261) <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 3 581* <1 000 <1 000 
 c-sis (X02744) <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 3 253* <1 000 <1 000 
 Estrogen sulfotransferase (U08098) <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 4 736* <1 000 <1 000 
 NKSF (M65291) <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 3 912* <1 000 <1 000 
 S19 ribosomal protein (M81757) 4 772 12 426* 8 619 7 603 3 360 3 759 2 511 4 177 
 Cathepsin H (X07549) 3 996 2 076† 4 241 3 384 <1 000 4 589* <1 000 <1 000 
 Stromelysin-3 (X57766) 2 992 5 591* 2 969 2 912 4 116 1 880† 3 519 3 053 
 DNA-binding protein A (M24069) <1 000 1 414* 2 530* 1 305* 2 556 <1 000† 2 634 <1 000† 
 Nucleobindin (M96824) <1 000 2 098* 2 342* 1 623* 1 608 1 924 3 594* 1 944 
Group C         
 c-raf (X03484) <1 000 1 026 <1 000 1 439* <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 
 APNH1 (M81768) <1 000 <1 000 1 072 1 452* <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 
 Lnk (AF055581) <1 000 <1 000 <1 000 1 334* <1 000 <1 000 <1 000 2 262* 
 hRlf beta subunit (D38073) <1 000 <1 000 <1 000 2 117* 2 792 2 131 1 626 <1 000† 
 RbAp46 (U35143) <1 000 <1 000 <1 000 1 368* 1 300 <1 000 <1 000 5 810* 
 CD19 (M21097) <1 000 <1 000 <1 000 1 563* <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 
 VEGF (M32977) <1 000 <1 000 <1 000 1 321* 6 228 4 326 6 453 1 116† 
 CLN2 protease (AF017456) <1 000 <1 000 <1 000 1 597* 6 812 6 433 1 928 <1 000† 
 MAPKAP (U09578) 2 484 1 019† 1 949 1 422 3 084 1 433† 2 416 7 880* 
 RAB7 GTPase (X93499) 3 080 1 212† 1 929 2 518 <1 000 <1 000 <1 000 2 237* 
Group D         
 Cathepsin C (X87212) 2 628 <1 000 2 693 2 052 <1 000 <1 000 3 361* 2 979* 
 Heat shock factor 1 (M64673) <1 000 <1 000 3 067* 1 912* <1 000 <1 000 5 753* 1 723* 
 Repl. factor C (M87339) <1 000 <1 000 1 822* 2 240* 4 044 4 664 4 500 <1 000† 
Group E         
 RanGTPase act. Protein 1 (X82260) 2 212 1 078† 1 830 <1 000† <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 
 c-myc (V00568) 10 500 4 884† 10 851 4 436† 7 560 <1 000† 6 526 <1 000† 
 TNF (X01394) 8 292 3 265† 7 822 3 801† 2 424 2 345 2 500 <1 000† 
 IL-2 receptor (X01057) 5 832 2 716† 5 537 3 039† 15 236 3 749† 14 835 4 269† 
 IL-2 receptor gamma (D11086) 3 424 1 433† 3 132 1 977† 2 812 1 573 4 410 3 173 
 HSP27 (X54079) 15 452 5 319† 14 741 7 652† 5 076 3 226 3 421 3 161 
 Histidine decarboxylase (X54297) 2 080 1 074† 2 398 <1 000† 2 512 <1 000† 3 920 1 901† 
 Repl. factor C (M87338) 3 016 1 733 2 597 1 081† 9 048 1 260† 4 718 4 994 
Control ATRA ST1346 ATRA + ST1346 Control ATRA ST1346 ATRA + ST1346  
 TRRAP (AF076974) 3 920 1 903† 4 068 2 316† 1 432 2 371 8 519* <1 000† 
 ALG-2 (AF035606) 4 976 2 712† 5 929 3 433 2 840 3 304 6 438* <1 000 
 HER-3 (M34309) 1 616 <1 000† 1 773 <1 000† 3 256 <1 000† 3 089 <1 000† 
 HDLCl (U32944) 7 220 3 320† 8 343 5 583 5 136 2 104† 4 859 3 897 
 CDC47 homolog (D55716) 4 692 2 345† 4 112 3 176 7 288 2 132† 5 690 <1 000† 
 Uracil-DNA glyc. (X15653) 2 480 <1 000† 3 032 1 534† 14 940 <1 000† 3 818† <1 000† 
 EGR1(X52541) 2 344 <1 000† 1 869 2 269 3 316 <1 000† 10 176* 1 174† 
 HSE 70 (Y00371) 4 608 1 891† 5 417 4 537 10 164 2 288† 11 668 5 663† 
 Hepatoma-derived GF (D16431) 4 660 1 149† 4 019 2 316† 7 772 6 226 11 680 5 565 
 IL-1 (K02770) 4 104 2 092 3 601 1 676† <1 000 <1 000 <1 000 <1 000 
 TAXREB 67 (D90209) 7 272 6 709 8 802 6 375 5 772 2 754† 7 088 3 241† 
Group F 
 ARF1 (M36340) 2 148 2 483 1 793 1 166† 2 524 2 525 4 045 4 717 
 DNA pol. Delta (M80397) 2 656 1 832 2 188 1 078† 1 272 <1 000 1 571 1 571 
 M-CSF (M37435) 10 608 6 353 10 423 5 189† 4 184 3 453 2 073 <1 000† 

The numbers indicate the adjusted intensity values of the spots on the array corresponding to the genes listed on the left. They were obtained following average background subtraction and normalization for the average intensity of all the arrayed spots using the ATLAS 2.0 analysis software. The Genbank accession number for each gene is indicated in parentheses. Genes were classified in each group according to their expression profiles. Less than 1000 indicates that the intensity of the signal was equivalent to or below the background level.

*

An induction of the mRNA equal to or higher than 1.6 relative to the corresponding control.

†

A decrease of the mRNA equal to or higher than 0.4 relative to the corresponding control.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal