Targeted genes/exons in a representative molecular genetic testing panel focused on hematologic malignancies
ABL1 e2-e10 | ASXL1 e1-e13 | ATM e2-e63 | BCL11B e4 |
BCOR e2-e15 | BCORL1 e1-e12 | BRAF e15 | BRCC3 e3-e11 |
CALR e9 | CBL e7-e8 | CBLB e9-e11 | CD79B e5-e6 |
CEBPA e1 | CNOT3 e1-e2 | CREBBP e2-e21, e23-31 | CRLF2 e6 |
CSF1R e22 | CSF3R e14-e18 | CTCF e3-e12 | CTNNB1 e2-e4 |
CUX1 e1-e21 | CXCR4 e2 | DNMT3A e2-e23 | DNMT3B e2-e23 |
EED e1-e12 | EGFR e18-e21 | EP300 e18-e27 | ETV6 e1-e8 |
FANCL e1-e14 | FBXW7 e8-e12 | EZH2 e2-e8, e11-e20 | FLT3 e14-e16, e20 |
GATA1 e2-e6 | GATA2 e2-e6 | GATA3 e4-e6 | GNAS e8-e9 |
GNB1 e5-e6 | IDH1 e4 | IDH2 e4 | IKZF1 e2-e8 |
IKZF2 e1-e8 | IKZF3 e1-e8 | IL7R e6 | JAK1 e10-e25 |
JAK2 e12, e14 | JAK3 e11-e24 | KIT e8-9, e11, e17 | KRAS e2-e5 |
LUC7L2 e3-e11 | MAP2K1 e2-e3 | MEF2B e3 | MPL e10 |
MYD88 e5 | NOTCH1 e24-e28 | NOTCH1 e34 | NOTCH2 e24-e28 |
NOTCH2 e34 | NOTCH3 e25-e26 | NOTCH3 e33 | NPM1 e10-e11 |
NRAS e2-e5 | PAX5 e3, e6-e7 | NT5C2 e9, e11, e13, e15, e17 | |
PDS5B e3-e35 | PHF6 e2-e10 | PDGFRA e10-e21, e23 | PIGA e2-e6 |
PIM1 e1-e6 | PRPF40B e2-e26 | PIK3CA e2, e10, e21 | PRPF8 e2-e43 |
PTEN e1-e9 | PTPN11 e1-e15 | RAD21 e2-e14 | RET e7 |
RIT1 e1-e6 | RPL10 e5 | RUNX1 e2-e9 | SETBP1 e4 |
SF3B1 e12-e16 | SF1 e1-e10, e13 | SF3A1 e1-e2, e5-e16 | SETD2 e1-e4, e6-e21 |
SH2B3 e2-e8 | SMC1A e1-e25 | SMC3 e2-e29 | SRSF2 e1 |
STAG2 e3-e35 | TET2 e3-e11 | STAT3 e2-e17, e21-23 | TLR2 e1 |
TP53 e2-e11 | U2AF1 e2, e6 | U2AF2 e1-e12 | WHSC1 e17-e18 |
WT1 e1-e10 | XPO1 e15-e16 | ZRSR2 e1-e11 |
ABL1 e2-e10 | ASXL1 e1-e13 | ATM e2-e63 | BCL11B e4 |
BCOR e2-e15 | BCORL1 e1-e12 | BRAF e15 | BRCC3 e3-e11 |
CALR e9 | CBL e7-e8 | CBLB e9-e11 | CD79B e5-e6 |
CEBPA e1 | CNOT3 e1-e2 | CREBBP e2-e21, e23-31 | CRLF2 e6 |
CSF1R e22 | CSF3R e14-e18 | CTCF e3-e12 | CTNNB1 e2-e4 |
CUX1 e1-e21 | CXCR4 e2 | DNMT3A e2-e23 | DNMT3B e2-e23 |
EED e1-e12 | EGFR e18-e21 | EP300 e18-e27 | ETV6 e1-e8 |
FANCL e1-e14 | FBXW7 e8-e12 | EZH2 e2-e8, e11-e20 | FLT3 e14-e16, e20 |
GATA1 e2-e6 | GATA2 e2-e6 | GATA3 e4-e6 | GNAS e8-e9 |
GNB1 e5-e6 | IDH1 e4 | IDH2 e4 | IKZF1 e2-e8 |
IKZF2 e1-e8 | IKZF3 e1-e8 | IL7R e6 | JAK1 e10-e25 |
JAK2 e12, e14 | JAK3 e11-e24 | KIT e8-9, e11, e17 | KRAS e2-e5 |
LUC7L2 e3-e11 | MAP2K1 e2-e3 | MEF2B e3 | MPL e10 |
MYD88 e5 | NOTCH1 e24-e28 | NOTCH1 e34 | NOTCH2 e24-e28 |
NOTCH2 e34 | NOTCH3 e25-e26 | NOTCH3 e33 | NPM1 e10-e11 |
NRAS e2-e5 | PAX5 e3, e6-e7 | NT5C2 e9, e11, e13, e15, e17 | |
PDS5B e3-e35 | PHF6 e2-e10 | PDGFRA e10-e21, e23 | PIGA e2-e6 |
PIM1 e1-e6 | PRPF40B e2-e26 | PIK3CA e2, e10, e21 | PRPF8 e2-e43 |
PTEN e1-e9 | PTPN11 e1-e15 | RAD21 e2-e14 | RET e7 |
RIT1 e1-e6 | RPL10 e5 | RUNX1 e2-e9 | SETBP1 e4 |
SF3B1 e12-e16 | SF1 e1-e10, e13 | SF3A1 e1-e2, e5-e16 | SETD2 e1-e4, e6-e21 |
SH2B3 e2-e8 | SMC1A e1-e25 | SMC3 e2-e29 | SRSF2 e1 |
STAG2 e3-e35 | TET2 e3-e11 | STAT3 e2-e17, e21-23 | TLR2 e1 |
TP53 e2-e11 | U2AF1 e2, e6 | U2AF2 e1-e12 | WHSC1 e17-e18 |
WT1 e1-e10 | XPO1 e15-e16 | ZRSR2 e1-e11 |
List of 98 genes and exons included in the “Rapid Hematology Panel” test at Dana-Farber Cancer Institute/Brigham & Women’s Hospital as of May 1, 2016. The majority of genes recurrently mutated in myeloid or lymphoid neoplasms are included in this list. Gene/exon list developed by Jon C. Aster, Frank C. Kuo, and Neal I. Lindeman (Brigham & Women’s Hospital Center for Advanced Molecular Diagnostics), and R. Coleman Lindsley (Dana-Farber Cancer Institute Division of Hematological Malignancies) in consultation with clinical hematology groups.