Table 1.

Targeted genes/exons in a representative molecular genetic testing panel focused on hematologic malignancies

ABL1 e2-e10 ASXL1 e1-e13 ATM e2-e63 BCL11B e4 
BCOR e2-e15 BCORL1 e1-e12 BRAF e15 BRCC3 e3-e11 
CALR e9 CBL e7-e8 CBLB e9-e11 CD79B e5-e6 
CEBPA e1 CNOT3 e1-e2 CREBBP e2-e21, e23-31 CRLF2 e6 
CSF1R e22 CSF3R e14-e18 CTCF e3-e12 CTNNB1 e2-e4 
CUX1 e1-e21 CXCR4 e2 DNMT3A e2-e23 DNMT3B e2-e23 
EED e1-e12 EGFR e18-e21 EP300 e18-e27 ETV6 e1-e8 
FANCL e1-e14 FBXW7 e8-e12 EZH2 e2-e8, e11-e20 FLT3 e14-e16, e20 
GATA1 e2-e6 GATA2 e2-e6 GATA3 e4-e6 GNAS e8-e9 
GNB1 e5-e6 IDH1 e4 IDH2 e4 IKZF1 e2-e8 
IKZF2 e1-e8 IKZF3 e1-e8 IL7R e6 JAK1 e10-e25 
JAK2 e12, e14 JAK3 e11-e24 KIT e8-9, e11, e17 KRAS e2-e5 
LUC7L2 e3-e11 MAP2K1 e2-e3 MEF2B e3 MPL e10 
MYD88 e5 NOTCH1 e24-e28 NOTCH1 e34 NOTCH2 e24-e28 
NOTCH2 e34 NOTCH3 e25-e26 NOTCH3 e33 NPM1 e10-e11 
NRAS e2-e5 PAX5 e3, e6-e7 NT5C2 e9, e11, e13, e15, e17  
PDS5B e3-e35 PHF6 e2-e10 PDGFRA e10-e21, e23 PIGA e2-e6 
PIM1 e1-e6 PRPF40B e2-e26 PIK3CA e2, e10, e21 PRPF8 e2-e43 
PTEN e1-e9 PTPN11 e1-e15 RAD21 e2-e14 RET e7 
RIT1 e1-e6 RPL10 e5 RUNX1 e2-e9 SETBP1 e4 
SF3B1 e12-e16 SF1 e1-e10, e13 SF3A1 e1-e2, e5-e16 SETD2 e1-e4, e6-e21 
SH2B3 e2-e8 SMC1A e1-e25 SMC3 e2-e29 SRSF2 e1 
STAG2 e3-e35 TET2 e3-e11 STAT3 e2-e17, e21-23 TLR2 e1 
TP53 e2-e11 U2AF1 e2, e6 U2AF2 e1-e12 WHSC1 e17-e18 
WT1 e1-e10 XPO1 e15-e16 ZRSR2 e1-e11  
ABL1 e2-e10 ASXL1 e1-e13 ATM e2-e63 BCL11B e4 
BCOR e2-e15 BCORL1 e1-e12 BRAF e15 BRCC3 e3-e11 
CALR e9 CBL e7-e8 CBLB e9-e11 CD79B e5-e6 
CEBPA e1 CNOT3 e1-e2 CREBBP e2-e21, e23-31 CRLF2 e6 
CSF1R e22 CSF3R e14-e18 CTCF e3-e12 CTNNB1 e2-e4 
CUX1 e1-e21 CXCR4 e2 DNMT3A e2-e23 DNMT3B e2-e23 
EED e1-e12 EGFR e18-e21 EP300 e18-e27 ETV6 e1-e8 
FANCL e1-e14 FBXW7 e8-e12 EZH2 e2-e8, e11-e20 FLT3 e14-e16, e20 
GATA1 e2-e6 GATA2 e2-e6 GATA3 e4-e6 GNAS e8-e9 
GNB1 e5-e6 IDH1 e4 IDH2 e4 IKZF1 e2-e8 
IKZF2 e1-e8 IKZF3 e1-e8 IL7R e6 JAK1 e10-e25 
JAK2 e12, e14 JAK3 e11-e24 KIT e8-9, e11, e17 KRAS e2-e5 
LUC7L2 e3-e11 MAP2K1 e2-e3 MEF2B e3 MPL e10 
MYD88 e5 NOTCH1 e24-e28 NOTCH1 e34 NOTCH2 e24-e28 
NOTCH2 e34 NOTCH3 e25-e26 NOTCH3 e33 NPM1 e10-e11 
NRAS e2-e5 PAX5 e3, e6-e7 NT5C2 e9, e11, e13, e15, e17  
PDS5B e3-e35 PHF6 e2-e10 PDGFRA e10-e21, e23 PIGA e2-e6 
PIM1 e1-e6 PRPF40B e2-e26 PIK3CA e2, e10, e21 PRPF8 e2-e43 
PTEN e1-e9 PTPN11 e1-e15 RAD21 e2-e14 RET e7 
RIT1 e1-e6 RPL10 e5 RUNX1 e2-e9 SETBP1 e4 
SF3B1 e12-e16 SF1 e1-e10, e13 SF3A1 e1-e2, e5-e16 SETD2 e1-e4, e6-e21 
SH2B3 e2-e8 SMC1A e1-e25 SMC3 e2-e29 SRSF2 e1 
STAG2 e3-e35 TET2 e3-e11 STAT3 e2-e17, e21-23 TLR2 e1 
TP53 e2-e11 U2AF1 e2, e6 U2AF2 e1-e12 WHSC1 e17-e18 
WT1 e1-e10 XPO1 e15-e16 ZRSR2 e1-e11  

List of 98 genes and exons included in the “Rapid Hematology Panel” test at Dana-Farber Cancer Institute/Brigham & Women’s Hospital as of May 1, 2016. The majority of genes recurrently mutated in myeloid or lymphoid neoplasms are included in this list. Gene/exon list developed by Jon C. Aster, Frank C. Kuo, and Neal I. Lindeman (Brigham & Women’s Hospital Center for Advanced Molecular Diagnostics), and R. Coleman Lindsley (Dana-Farber Cancer Institute Division of Hematological Malignancies) in consultation with clinical hematology groups.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal