KSHV latent and lytic gene expression in rKSHV.219-infected NOD/SCID-hu mice
. | LANA-1 (ORF 73)† . | . | . | . | RTA (ORF 50)‡ . | . | . | . | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Group*mouse ID . | Spleen . | . | Bone marrow . | . | Spleen . | . | Bone marrow . | . | ||||||
| . | Exp 1 . | Exp 2 . | Exp 1 . | Exp 2 . | Exp 1 . | Exp 2 . | Exp 1 . | Exp 2 . | ||||||
| MOCK | ||||||||||||||
| D1 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D2 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D8 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D9 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D10 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D11§ | nd | nd | nd | nd | nd | nd | nd | nd | ||||||
| D13 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D51 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D52 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D55 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D57 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D59 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| HEAT | ||||||||||||||
| D3 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D4 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| rKSHV.219 | ||||||||||||||
| D5 | + | − | + | − | − | + | − | + | ||||||
| D6 | − | + | − | + | − | + | − | + | ||||||
| D7 | − | + | − | + | − | + | − | + | ||||||
| D14 | − | + | − | + | − | + | − | + | ||||||
| D15 | − | + | − | + | − | + | − | + | ||||||
| D16 | + | − | − | + | + | − | − | + | ||||||
| D17 | + | − | + | − | + | − | + | + | ||||||
| D18 | − | + | + | + | − | + | + | + | ||||||
| D19 | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||
| D20 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D21 | + | + | + | − | + | + | + | + | ||||||
| D22 | − | + | − | + | − | + | − | + | ||||||
| D23 | − | + | + | + | + | − | + | − | ||||||
| D25 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D67 | + | − | − | + | + | + | + | − | ||||||
| D73 | + | − | − | + | − | + | + | − | ||||||
. | LANA-1 (ORF 73)† . | . | . | . | RTA (ORF 50)‡ . | . | . | . | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Group*mouse ID . | Spleen . | . | Bone marrow . | . | Spleen . | . | Bone marrow . | . | ||||||
| . | Exp 1 . | Exp 2 . | Exp 1 . | Exp 2 . | Exp 1 . | Exp 2 . | Exp 1 . | Exp 2 . | ||||||
| MOCK | ||||||||||||||
| D1 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D2 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D8 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D9 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D10 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D11§ | nd | nd | nd | nd | nd | nd | nd | nd | ||||||
| D13 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D51 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D52 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D55 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D57 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D59 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| HEAT | ||||||||||||||
| D3 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D4 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| rKSHV.219 | ||||||||||||||
| D5 | + | − | + | − | − | + | − | + | ||||||
| D6 | − | + | − | + | − | + | − | + | ||||||
| D7 | − | + | − | + | − | + | − | + | ||||||
| D14 | − | + | − | + | − | + | − | + | ||||||
| D15 | − | + | − | + | − | + | − | + | ||||||
| D16 | + | − | − | + | + | − | − | + | ||||||
| D17 | + | − | + | − | + | − | + | + | ||||||
| D18 | − | + | + | + | − | + | + | + | ||||||
| D19 | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||
| D20 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D21 | + | + | + | − | + | + | + | + | ||||||
| D22 | − | + | − | + | − | + | − | + | ||||||
| D23 | − | + | + | + | + | − | + | − | ||||||
| D25 | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||
| D67 | + | − | − | + | + | + | + | − | ||||||
| D73 | + | − | − | + | − | + | + | − | ||||||
Real-time RT-PCR analysis of spleen and bone marrow samples recovered from NOD/SCID mice intravenously inoculated with rKSHV.219-infected CD34+ HPCs. + indicates transcript detected; −, transcript not detected; nd, not done; and exp, experiment.
CD34+ HPCs were infected with rKSHV.219, heat-treated rKSHV.219 (HEAT), or mock-infected (MOCK).
Real-time RT-PCR analysis of RNA extracted from indicated tissues using primers specific for KSHV LANA-1 (ORF 73).
Real-time RT-PCR analysis of RNA extracted from indicated tissues using primers specific for KSHV Rta (ORF 50).
Spleen and bone marrow samples not available for analysis.