Table 1.

Baseline characteristics of 173 patients with ALL analyzed by RNA-seq and the remainder of the DFCI 16-001 cohort

RNA-seq cohortDFCI 16-001 cohortP
N%Median (range)N%Median (range)
Total no. of patients 173   285    
Age at diagnosis, y   7.2 (1.0-21.7)   5.6 (1.0-20.8) .12 
 1-10 109 63.0  202 70.9  .13 
 10-15 42 24.3  48 16.8   
 ≥15 22 12.7  35 12.3   
WBC at diagnosis ×109/L   24.6 (1.5-874.4)   9.6 (0.6-612.5) <.001 
 <50 104 60.1  242 84.9  <.001 
 ≥50 69 39.9  43 15.1   
Sex        
 Female 78 45.1  130 45.6  .92 
 Male 95 54.9  155 54.4   
Race/ethnicity        
 White 117 67.6  177 62.1  .88 
 Hispanic* 24 13.9  41 14.4   
 Black 10 5.8  20 7.0   
 Asian 5 2.9  14 4.9   
 More than 1 race 4 2.3  8 2.8   
 Other 11 6.4  17 6.0   
 Unknown 2 1.2  8 2.8   
Immunophenotype        
 B-cell 136 78.6  245 86.0  .053 
 T-cell 37 21.4  40 14.0   
CNS status at diagnosis        
 CNS-1 128 74.0  211 74.0  .86 
 CNS-2 40 23.1  57 20.0   
 CNS-3 3 1.7  4 1.4   
 Traumatic LP with blasts 2 1.2  5 1.8   
 Other or missing 0 0  8 2.8   
Testicular involvement        
 Yes 1 1.0  2 1.3  .99 
 No 94 99.0  149 96.1   
 Unknown 0 0  4 2.6   
NCI risk        
 Standard 59 34.1  155 56.0  <.001 
 High 114 65.9  122 44.0   
DFCI risk        
 Provisional        
  Low 81 46.8  201 70.5  <.001 
  High 92 53.2  84 29.5   
 Initial (n = 434)        
  Low 62 35.8  161 61.7  <.001 
  High 75 43.4  65 24.9   
  Very high 36 20.8  35 13.4   
 Final (n = 402)        
  Low 46 28.8  117 48.3  <.001 
   Intermediate 45 28.1  42 17.4   
  High 29 18.1  45 18.6   
  Very high 40 25.0  38 15.7   
Complete remission (n = 420)        
 Yes 161 97.6  252 98.8  .44 
 No 4 2.4  3 1.2   
MRD        
 TP1 (n = 404)        
  Low (<10−4) 110 67.0  172 72.2  .27 
  High (≥10−4) 54 32.9  66 27.7   
 TP2 (n = 140)        
  Low (<10−3) 57 80.2  62 89.9  .16 
  High (≥10−3) 14 19.7  7 10.1   
RNA-seq cohortDFCI 16-001 cohortP
N%Median (range)N%Median (range)
Total no. of patients 173   285    
Age at diagnosis, y   7.2 (1.0-21.7)   5.6 (1.0-20.8) .12 
 1-10 109 63.0  202 70.9  .13 
 10-15 42 24.3  48 16.8   
 ≥15 22 12.7  35 12.3   
WBC at diagnosis ×109/L   24.6 (1.5-874.4)   9.6 (0.6-612.5) <.001 
 <50 104 60.1  242 84.9  <.001 
 ≥50 69 39.9  43 15.1   
Sex        
 Female 78 45.1  130 45.6  .92 
 Male 95 54.9  155 54.4   
Race/ethnicity        
 White 117 67.6  177 62.1  .88 
 Hispanic* 24 13.9  41 14.4   
 Black 10 5.8  20 7.0   
 Asian 5 2.9  14 4.9   
 More than 1 race 4 2.3  8 2.8   
 Other 11 6.4  17 6.0   
 Unknown 2 1.2  8 2.8   
Immunophenotype        
 B-cell 136 78.6  245 86.0  .053 
 T-cell 37 21.4  40 14.0   
CNS status at diagnosis        
 CNS-1 128 74.0  211 74.0  .86 
 CNS-2 40 23.1  57 20.0   
 CNS-3 3 1.7  4 1.4   
 Traumatic LP with blasts 2 1.2  5 1.8   
 Other or missing 0 0  8 2.8   
Testicular involvement        
 Yes 1 1.0  2 1.3  .99 
 No 94 99.0  149 96.1   
 Unknown 0 0  4 2.6   
NCI risk        
 Standard 59 34.1  155 56.0  <.001 
 High 114 65.9  122 44.0   
DFCI risk        
 Provisional        
  Low 81 46.8  201 70.5  <.001 
  High 92 53.2  84 29.5   
 Initial (n = 434)        
  Low 62 35.8  161 61.7  <.001 
  High 75 43.4  65 24.9   
  Very high 36 20.8  35 13.4   
 Final (n = 402)        
  Low 46 28.8  117 48.3  <.001 
   Intermediate 45 28.1  42 17.4   
  High 29 18.1  45 18.6   
  Very high 40 25.0  38 15.7   
Complete remission (n = 420)        
 Yes 161 97.6  252 98.8  .44 
 No 4 2.4  3 1.2   
MRD        
 TP1 (n = 404)        
  Low (<10−4) 110 67.0  172 72.2  .27 
  High (≥10−4) 54 32.9  66 27.7   
 TP2 (n = 140)        
  Low (<10−3) 57 80.2  62 89.9  .16 
  High (≥10−3) 14 19.7  7 10.1   
*

Patients indicated as Hispanic are included here regardless of other races provided.

View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal