Table 1.

Baseline characteristics of 173 patients with ALL analyzed by RNA-seq and the remainder of the DFCI 16-001 cohort

RNA-seq cohortDFCI 16-001 cohortP
N%Median (range)N%Median (range)
Total no. of patients 173   285    
Age at diagnosis, y   7.2 (1.0-21.7)   5.6 (1.0-20.8) .12 
 1-10 109 63.0  202 70.9  .13 
 10-15 42 24.3  48 16.8   
 ≥15 22 12.7  35 12.3   
WBC at diagnosis ×109/L   24.6 (1.5-874.4)   9.6 (0.6-612.5) <.001 
 <50 104 60.1  242 84.9  <.001 
 ≥50 69 39.9  43 15.1   
Sex        
 Female 78 45.1  130 45.6  .92 
 Male 95 54.9  155 54.4   
Race/ethnicity        
 White 117 67.6  177 62.1  .88 
 Hispanic* 24 13.9  41 14.4   
 Black 10 5.8  20 7.0   
 Asian 5 2.9  14 4.9   
 More than 1 race 4 2.3  8 2.8   
 Other 11 6.4  17 6.0   
 Unknown 2 1.2  8 2.8   
Immunophenotype        
 B-cell 136 78.6  245 86.0  .053 
 T-cell 37 21.4  40 14.0   
CNS status at diagnosis        
 CNS-1 128 74.0  211 74.0  .86 
 CNS-2 40 23.1  57 20.0   
 CNS-3 3 1.7  4 1.4   
 Traumatic LP with blasts 2 1.2  5 1.8   
 Other or missing 0 0  8 2.8   
Testicular involvement        
 Yes 1 1.0  2 1.3  .99 
 No 94 99.0  149 96.1   
 Unknown 0 0  4 2.6   
NCI risk        
 Standard 59 34.1  155 56.0  <.001 
 High 114 65.9  122 44.0   
DFCI risk        
 Provisional        
  Low 81 46.8  201 70.5  <.001 
  High 92 53.2  84 29.5   
 Initial (n = 434)        
  Low 62 35.8  161 61.7  <.001 
  High 75 43.4  65 24.9   
  Very high 36 20.8  35 13.4   
 Final (n = 402)        
  Low 46 28.8  117 48.3  <.001 
   Intermediate 45 28.1  42 17.4   
  High 29 18.1  45 18.6   
  Very high 40 25.0  38 15.7   
Complete remission (n = 420)        
 Yes 161 97.6  252 98.8  .44 
 No 4 2.4  3 1.2   
MRD        
 TP1 (n = 404)        
  Low (<10−4) 110 67.0  172 72.2  .27 
  High (≥10−4) 54 32.9  66 27.7   
 TP2 (n = 140)        
  Low (<10−3) 57 80.2  62 89.9  .16 
  High (≥10−3) 14 19.7  7 10.1   
RNA-seq cohortDFCI 16-001 cohortP
N%Median (range)N%Median (range)
Total no. of patients 173   285    
Age at diagnosis, y   7.2 (1.0-21.7)   5.6 (1.0-20.8) .12 
 1-10 109 63.0  202 70.9  .13 
 10-15 42 24.3  48 16.8   
 ≥15 22 12.7  35 12.3   
WBC at diagnosis ×109/L   24.6 (1.5-874.4)   9.6 (0.6-612.5) <.001 
 <50 104 60.1  242 84.9  <.001 
 ≥50 69 39.9  43 15.1   
Sex        
 Female 78 45.1  130 45.6  .92 
 Male 95 54.9  155 54.4   
Race/ethnicity        
 White 117 67.6  177 62.1  .88 
 Hispanic* 24 13.9  41 14.4   
 Black 10 5.8  20 7.0   
 Asian 5 2.9  14 4.9   
 More than 1 race 4 2.3  8 2.8   
 Other 11 6.4  17 6.0   
 Unknown 2 1.2  8 2.8   
Immunophenotype        
 B-cell 136 78.6  245 86.0  .053 
 T-cell 37 21.4  40 14.0   
CNS status at diagnosis        
 CNS-1 128 74.0  211 74.0  .86 
 CNS-2 40 23.1  57 20.0   
 CNS-3 3 1.7  4 1.4   
 Traumatic LP with blasts 2 1.2  5 1.8   
 Other or missing 0 0  8 2.8   
Testicular involvement        
 Yes 1 1.0  2 1.3  .99 
 No 94 99.0  149 96.1   
 Unknown 0 0  4 2.6   
NCI risk        
 Standard 59 34.1  155 56.0  <.001 
 High 114 65.9  122 44.0   
DFCI risk        
 Provisional        
  Low 81 46.8  201 70.5  <.001 
  High 92 53.2  84 29.5   
 Initial (n = 434)        
  Low 62 35.8  161 61.7  <.001 
  High 75 43.4  65 24.9   
  Very high 36 20.8  35 13.4   
 Final (n = 402)        
  Low 46 28.8  117 48.3  <.001 
   Intermediate 45 28.1  42 17.4   
  High 29 18.1  45 18.6   
  Very high 40 25.0  38 15.7   
Complete remission (n = 420)        
 Yes 161 97.6  252 98.8  .44 
 No 4 2.4  3 1.2   
MRD        
 TP1 (n = 404)        
  Low (<10−4) 110 67.0  172 72.2  .27 
  High (≥10−4) 54 32.9  66 27.7   
 TP2 (n = 140)        
  Low (<10−3) 57 80.2  62 89.9  .16 
  High (≥10−3) 14 19.7  7 10.1   
*

Patients indicated as Hispanic are included here regardless of other races provided.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal