Targeted NGS for 32 genes related to myeloid disorders in 2 matched diagnostic PDX IR AML pairs
| Gene . | Patient 14088 . | Patient 14204 . | ||
|---|---|---|---|---|
| Diagnostic (VAF range) . | PDX (VAF range) . | Diagnostic (VAF range) . | PDX (VAF range) . | |
| NRAS | + (13.37-24.49)* | + (1.85-42.82)* | − | − |
| IDH1 | + (46.18)* | + (51.67)* | − | − |
| DNMT3A | + (93.74)* | + (99.44)* | − | + (5.06-7.31)† |
| ASXL1 | − | + (5.5-15.73)† | − | + (5.71-64.27)† |
| CEBPA | − | + (5.24-23.77)† | − | + (32.99-82.6)† |
| EZH2 | − | + (19.9)† | − | + (10.04-43.6)† |
| JAK2 | − | + (9.3-11.16)† | − | + (54.59-60.28)† |
| KMT2A | − | + (5.2-28.71)† | − | + (5.02-83.99)† |
| MPL | − | + (8.83-10.89)† | − | + (12.56-55.8)† |
| SETBP1 | − | + (5.2-7.4)† | − | + (22.49-46.37)† |
| WT1 | − | + (9.32)† | − | + (54.93)† |
| RUNX1 | − | + (13.19-14.64)† | + (46.76)* | + (12.71-65.57)* |
| SRSF2 | − | − | + (45.23)* | − |
| ETV6 | − | − | − | + (6.91-13.93)† |
| SF3B1 | − | − | − | + (16.91)† |
| ZRSR2 | − | − | − | + (7.97-9.07)† |
| ABL1 | − | − | − | − |
| BRAF | − | − | − | − |
| CALR | − | − | − | − |
| CBL | − | − | − | − |
| CSF3 | − | − | − | − |
| CSNK1A1 | − | − | − | − |
| FLT3 | − | − | − | − |
| HRAS | − | − | − | − |
| IDH2 | − | − | − | − |
| KIT | − | − | − | − |
| KRAS | − | − | − | − |
| NPM1 | − | − | − | − |
| PTPN11 | − | − | − | − |
| TET2 | − | − | − | − |
| TP53 | − | − | − | − |
| U2AF1 | − | − | − | − |
| Gene . | Patient 14088 . | Patient 14204 . | ||
|---|---|---|---|---|
| Diagnostic (VAF range) . | PDX (VAF range) . | Diagnostic (VAF range) . | PDX (VAF range) . | |
| NRAS | + (13.37-24.49)* | + (1.85-42.82)* | − | − |
| IDH1 | + (46.18)* | + (51.67)* | − | − |
| DNMT3A | + (93.74)* | + (99.44)* | − | + (5.06-7.31)† |
| ASXL1 | − | + (5.5-15.73)† | − | + (5.71-64.27)† |
| CEBPA | − | + (5.24-23.77)† | − | + (32.99-82.6)† |
| EZH2 | − | + (19.9)† | − | + (10.04-43.6)† |
| JAK2 | − | + (9.3-11.16)† | − | + (54.59-60.28)† |
| KMT2A | − | + (5.2-28.71)† | − | + (5.02-83.99)† |
| MPL | − | + (8.83-10.89)† | − | + (12.56-55.8)† |
| SETBP1 | − | + (5.2-7.4)† | − | + (22.49-46.37)† |
| WT1 | − | + (9.32)† | − | + (54.93)† |
| RUNX1 | − | + (13.19-14.64)† | + (46.76)* | + (12.71-65.57)* |
| SRSF2 | − | − | + (45.23)* | − |
| ETV6 | − | − | − | + (6.91-13.93)† |
| SF3B1 | − | − | − | + (16.91)† |
| ZRSR2 | − | − | − | + (7.97-9.07)† |
| ABL1 | − | − | − | − |
| BRAF | − | − | − | − |
| CALR | − | − | − | − |
| CBL | − | − | − | − |
| CSF3 | − | − | − | − |
| CSNK1A1 | − | − | − | − |
| FLT3 | − | − | − | − |
| HRAS | − | − | − | − |
| IDH2 | − | − | − | − |
| KIT | − | − | − | − |
| KRAS | − | − | − | − |
| NPM1 | − | − | − | − |
| PTPN11 | − | − | − | − |
| TET2 | − | − | − | − |
| TP53 | − | − | − | − |
| U2AF1 | − | − | − | − |